Tutkimus ennustavista ja ennustemarkkereista potilailla, joilla on ei-pienisoluinen keuhkosyöpä

1. Luodaan retrospektiivinen kokoelma aiempien ei-pienisoluisten keuhkosyöpätapausten kliinisistä, histopatologisista, hoito- ja seurantatiedoista (kliiniset patologiset) tiedot.
2. Luodaan mahdollinen kokoelma klinikan patologisia tietoja NSCLC-potilailta vastaavien veri- ja kudosnäytteiden kanssa
3. Löytää ja validoida molekyylibiomarkkereita eloonjäämisestä ja hoidon tuloksista NSCLC:ssä

Yksi keuhkosyövän hallinnan nykyisistä ongelmista on hoitopäätös ja valitun hoidon tyyppi. Siten on olemassa tarve keuhkosyövän prognostisille (osoittaa taudin aggressiivisuutta) ja ennustaville (osoittaa todennäköistä hoitovastetta) markkereita. Onnistuneen prognostisen ja ennustavan markkeriohjelman toteuttaminen edellyttää useita tekijöitä, mukaan lukien: kattava tietokanta, joka yhdistää kunkin tapauksen kliiniset, histopatologiset, hoito- ja tulosominaisuudet, tietokantaan linkitetty näytekokoelma, joka soveltuu ehdokasmarkkerien testaamiseen. ja monitieteinen, osastojen välinen asiantuntemus keuhkosyövän hoidossa.

Tavoite 1:

Tapausrekisterit tarkistetaan kliinisen, hoito- ja seurantatietojen poimimiseksi

Tavoite 2:

Vähintään 21-vuotiailta potilailta, joilla on äskettäin diagnosoitu, hoitamaton ei-pienisoluinen keuhkosyöpä, on pyydettävä suostumus. Potilaat tunnistetaan patologiatietojen ja tutkijoiden klinikan kautta. Tutkittavan suostumuksen jälkeen hankitaan perusominaisuudet. Seurantatiedot saaduista hoidoista ja havaituista toksisista vaikutuksista saadaan. Kasvainnäytteitä otetaan vain NSCLC-potilailta, joille tehdään leikkaus osana rutiinihoitoa. Kirurginen näyte lähetetään Patologiaan tarkastamaan diagnostisen näytteen riittävyys tavanomaisen käytännön mukaisesti. Veri kerätään lähtötilanteessa (tai ennen syövän vastaista hoitoa) ja otetaan uudelleen näytteitä taudin uusiutumisen tai etenemisen yhteydessä. Keräys sisältää 7 ml:n veren oton Vacutainer CPT -putkeen (Becton Dickinson, USA), sentrifugoinnin, erotetun mononukleaaristen solujen (MNC) kerroksen uuttamisen, leimauksen ja varastoinnin alle -80 oC:ssa. Verenottotiheys on noin 1-5 kertaa (yhteensä 7-35 ml). Kertojen lukumäärä riippuu siitä, uusiutuuko keuhkosyöpä ja pitkälle edennyt, kuinka usein keuhkosyöpä uusiutuu hoidon jälkeen. DNA ja RNA erotetaan CSIS:llä ja säilytetään siellä pakastimessa. Säilytettyjä näytteitä käytetään tulosten ennustavien ja ennustavien merkkien tutkimiseen ja uusien molekyylimuutosten löytämiseen

Tavoite 3:

Kasvaimen ja veren biomarkkerianalyysi. Veri rikastetaan kiertäviä kasvainsoluja (CTC) varten käyttämällä aiemmin optimoituja menetelmiä (11) ja DNA uutetaan CTC:stä ja kasvaimesta Tri-Reagentilla (Molecular Research Center, Cincinatti, OH). DNA uutetaan kasvain-, CTC- ja yksitumaisista soluista ja testataan somaattisten keuhkomutaatioiden varalta sekvensoimalla (2). Sukulinjan DNA:sta analysoidaan geenit, jotka liittyvät NSCLC:n geneettiseen riskiin, ja hoidon toksisuuden varalta geenit, jotka liittyvät NSCLC-kemoterapian aineenvaihduntareitteihin.

Tissue microarray (TMA) on korkean suorituskyvyn menetelmä, jolla analysoidaan suuria määriä formaliinilla kiinnitettyjä, parafiiniin upotettuja kasvaimia minimaalisilla kustannuksilla ja vaivalla. TMA:ta käytetään sellaisten proteiinien ilmentymisen analysoimiseksi, joilla on oletettavasti merkitystä EGFR:n toiminnalle, solujen lisääntymiselle, angiogeneesille, apoptoosille, metastaaseille ja hormonaalisille. Myös PTEN ja C/EBPa analysoidaan.