En undersøgelse af prædiktive og prognostiske markører hos patienter med ikke-småcellet lungekræft

1. At etablere en retrospektiv kompilering af kliniske, histopatologiske, behandlings- og opfølgningsdata (kliniske patologiske) data af tidligere tilfælde af ikke-småcellet lungekræft (NSCLC).
2. At etablere en prospektiv samling af klinikpatologisk information fra NSCLC-patienter med tilsvarende blod- og vævsprøver
3. At opdage og validere molekylære biomarkører for overlevelse og behandlingsresultat i NSCLC

En af de nuværende vanskeligheder i behandlingen af ​​lungekræft er beslutningen om at behandle og den type behandling, der skal vælges. Der er således behov for yderligere prognostiske (indikerende for sygdoms aggressivitet) og prædiktive (indikerende sandsynlige respons på behandling) markører for lungecancer. For at gennemføre et vellykket prognostisk og prædiktivt markørprogram kræves der flere faktorer, herunder: en omfattende database, der forbinder kliniske, histopatologiske, behandlings- og resultatkarakteristika for hvert enkelt tilfælde, en samling af prøver knyttet til databasen, der er egnet til testning af kandidatmarkører , og et tværfagligt, tværafdelingsniveau af ekspertise i håndtering af lungekræft.

Mål 1:

En gennemgang af sagsjournalerne vil blive udført for at udtrække kliniske, behandlings- og opfølgningsdata

Mål 2:

Patienter på 21 år eller derover med nydiagnosticeret, ubehandlet ikke-småcellet lungekræft skal kontaktes for samtykke. Patienterne vil blive identificeret gennem patologijournalerne og fra undersøgelsens efterforskers klinik. Efter forsøgspersonens samtykke opnås baseline-karakteristika. Opfølgningsdata om modtagne behandlinger og påviste toksiciteter vil blive indhentet. Tumorprøver vil kun blive indhentet fra patienter med NSCLC, der gennemgår operation som en del af rutinemæssig klinisk pleje. Den kirurgiske prøve vil blive sendt til patologi for at verificere tilstrækkeligheden af ​​den diagnostiske prøve som sædvanlig praksis. Blod vil blive opsamlet ved baseline (eller før enhver anti-cancer behandling) og vil blive udtaget igen på tidspunktet for tilbagefald eller sygdomsprogression. Indsamling vil indebære at trække 7 ml blod ind i et Vacutainer CPT-rør (Becton Dickinson, USA), centrifugering, ekstraktion af et adskilt lag af mononukleære celler (MNC), mærkning efterfulgt af opbevaring under -80oC. Hyppigheden af ​​udtaget blod vil være omkring 1-5 gange (7-35 ml i alt). Antallet af gange afhænger af, om lungekræften får tilbagefald og i det fremskredne stadie, hvor ofte lungekræften får tilbagefald efter behandling. DNA og RNA vil blive ekstraheret af CSIS og opbevaret i fryseren der. Lagrede prøver vil blive brugt til undersøgelse af prognostiske og prædiktive markører for udfald og til opdagelse af nye molekylære ændringer

Mål 3:

Biomarkøranalyse af tumor og blod. Blod vil blive beriget til cirkulerende tumorceller (CTC) ved hjælp af tidligere optimerede metoder (11), og DNA vil blive ekstraheret fra CTC og tumor ved hjælp af Tri-Reagent (Molecular Research Center, Cincinatti, OH). DNA vil blive ekstraheret fra tumor-, CTC- og mononukleerede celler og testet for somatiske lungemutationer ved sekventering (2). Germline DNA vil blive analyseret for gener forbundet med genetisk risiko for NSCLC og, for behandlingstoksicitet, for gener relateret til NSCLC kemoterapi metaboliske veje.

Tissue microarray (TMA) er en high-throughput metode til at analysere et stort antal formalinfikserede, paraffinindlejrede tumorer til en minimal pris og indsats. For at analysere ekspressionen af ​​proteiner af formodet relevans for EGFR-funktion, celleproliferation, angiogenese, apoptose, metastaser og hormonelle, vil TMA blive brugt. PTEN og C/EBPa vil også blive analyseret.