Исследование прогностических и прогностических маркеров у пациентов с немелкоклеточным раком легкого

1. Создать ретроспективную компиляцию клинических, гистопатологических, лечебных и последующих (клинико-патологических) данных предыдущих случаев немелкоклеточного рака легкого (НМРЛ).
2. Создать проспективный сбор клинико-патологической информации от пациентов с НМРЛ с соответствующими образцами крови и тканей.
3. Обнаружить и подтвердить молекулярные биомаркеры выживаемости и результатов лечения при НМРЛ.

Одной из текущих трудностей в лечении рака легкого является решение о лечении и выборе типа лечения. Таким образом, существует потребность в дополнительных прогностических (указывающих на агрессивность заболевания) и предиктивных (указывающих на вероятный ответ на лечение) маркерах рака легкого. Для успешного проведения прогностической и прогностической программы маркеров требуется несколько факторов, в том числе: обширная база данных, связывающая клинические, гистопатологические, лечебные и исходные характеристики каждого случая, коллекция образцов, связанных с базой данных, которая подходит для тестирования маркеров-кандидатов. , а также междисциплинарный межведомственный уровень знаний в области лечения рака легких.

Цель 1:

Будет проведен обзор истории болезни для извлечения клинических данных, данных о лечении и последующем наблюдении.

Цель 2:

Пациенты в возрасте 21 года и старше с впервые диагностированным, нелеченым немелкоклеточным раком легкого должны получить согласие. Пациенты будут идентифицированы по записям патологии и из клиники исследователей исследования. После согласия субъекта будут получены базовые характеристики. Будут получены последующие данные о полученном лечении и обнаруженных токсических эффектах. Образцы опухолей будут браться только у пациентов с НМРЛ, перенесших операцию в рамках обычной клинической помощи. Хирургический образец будет отправлен в отделение патологии для проверки адекватности диагностического образца в соответствии с обычной практикой. Кровь будет собираться на исходном уровне (или перед любым противораковым лечением) и снова браться во время рецидива или прогрессирования заболевания. Сбор будет включать забор 7 мл крови в пробирку Vacutainer CPT (Becton Dickinson, США), центрифугирование, выделение отделенного слоя мононуклеарных клеток (MNC), мечение с последующим хранением при температуре ниже -80oC. Частота забора крови будет примерно 1-5 раз (всего 7-35 мл). Количество раз зависит от того, рецидивирует ли рак легкого и в запущенной стадии, как часто рак легкого рецидивирует после лечения. ДНК и РНК будут извлечены CSIS и храниться там в морозильной камере. Сохраненные образцы будут использоваться для исследования прогностических и прогностических маркеров исхода, а также для обнаружения новых молекулярных изменений.

Задача 3:

Биомаркерный анализ опухоли и крови. Кровь будет обогащена циркулирующими опухолевыми клетками (ЦОК) с использованием ранее оптимизированных методов (11), а ДНК будет извлечена из ЦОК и опухоли с использованием трехреагентов (Центр молекулярных исследований, Цинцинатти, Огайо). ДНК будет извлечена из опухоли, ЦОК и мононуклеарных клеток и проверена на соматические мутации легких путем секвенирования (2). ДНК зародышевой линии будет проанализирована на наличие генов, связанных с генетическим риском НМРЛ, и на токсичность лечения на наличие генов, связанных с метаболическими путями химиотерапии НМРЛ.

Тканевой микрочип (ТМА) — это высокопроизводительный метод анализа большого количества фиксированных формалином и залитых парафином опухолей с минимальными затратами и усилиями. Для анализа экспрессии белков, предположительно связанных с функцией EGFR, пролиферацией клеток, ангиогенезом, апоптозом, метастазированием и гормонами, будет использоваться ТМА. PTEN и C/EBPa также будут проанализированы.