En studie av prediktiva och prognostiska markörer hos patienter med icke-småcellig lungcancer

1. Att upprätta en retrospektiv sammanställning av kliniska, histopatologiska, behandlings- och uppföljningsdata (klinikpatologiska) av tidigare fall av icke-småcellig lungcancer (NSCLC).
2. Att upprätta en prospektiv samling av klinikpatologisk information från NSCLC-patienter med motsvarande blod- och vävnadsprover
3. Att upptäcka och validera molekylära biomarkörer för överlevnad och behandlingsresultat vid NSCLC

En av de nuvarande svårigheterna i hanteringen av lungcancer är beslutet att behandla och vilken typ av behandling som ska väljas. Det finns således ett behov av ytterligare prognostiska (indikerar på sjukdomens aggressivitet) och prediktiva (indikerar sannolikt svar på behandling) markörer för lungcancer. För att genomföra ett framgångsrikt prognostiskt och prediktivt markörprogram krävs flera faktorer, inklusive: en omfattande databas som länkar samman kliniska, histopatologiska, behandlings- och resultatkarakteristika för varje fall, en samling prover kopplade till databasen som är lämpliga för testning av kandidatmarkörer , och en multidisciplinär, interdepartemental nivå av expertis i hanteringen av lungcancer.

Mål 1:

En granskning av journalerna kommer att genomföras för att extrahera kliniska, behandlings- och uppföljningsdata

Mål 2:

Patienter som är 21 år eller äldre med nydiagnostiserad, obehandlad icke-småcellig lungcancer ska kontaktas för samtycke. Patienterna kommer att identifieras genom patologijournalerna och från studieutredarnas klinik. Efter försökspersonens samtycke kommer baslinjeegenskaper att erhållas. Uppföljningsdata om mottagna terapier och påträffade toxiciteter kommer att erhållas. Tumörprov kommer endast att erhållas från patienter med NSCLC som genomgår operation som en del av rutinmässig klinisk vård. Det kirurgiska provet kommer att skickas till patologi för att verifiera att det diagnostiska provet är adekvat enligt vanlig praxis. Blod kommer att samlas in vid baslinjen (eller före någon anti-cancerbehandling) och kommer att tas igen vid tidpunkten för återfall eller sjukdomsprogression. Insamlingen kommer att innebära att 7 ml blod dras in i ett Vacutainer CPT-rör (Becton Dickinson, USA), centrifugering, extraktion av ett separerat lager av mononukleära celler (MNC), märkning följt av förvaring under -80oC. Frekvensen för uttag av blod kommer att vara cirka 1-5 gånger (7-35 ml totalt). Antalet gånger beror på om lungcancern återfaller och i framskridet stadium, hur ofta lungcancern återfaller efter behandling. DNA och RNA kommer att extraheras av CSIS och lagras i frysutrymmet där. Lagrade prover kommer att användas för undersökning av prognostiska och prediktiva markörer för utfall och för upptäckt av nya molekylära förändringar

Mål 3:

Biomarköranalys av tumör och blod. Blod kommer att anrikas för cirkulerande tumörceller (CTC) med tidigare optimerade metoder (11) och DNA kommer att extraheras från CTC och tumör med hjälp av Tri-Reagent (Molecular Research Center, Cincinatti, OH). DNA kommer att extraheras från tumör-, CTC- och mononukleära celler och testas för somatiska lungmutationer genom sekvensering (2). Germline DNA kommer att analyseras för gener kopplade till genetisk risk för NSCLC och, för behandlingstoxicitet, för gener relaterade till NSCLC kemoterapi metaboliska vägar.

Tissue microarray (TMA) är en metod med hög genomströmning för att analysera ett stort antal formalinfixerade, paraffininbäddade tumörer till en minimal kostnad och ansträngning. För att analysera uttrycket av proteiner av förmodad relevans för EGFR-funktion, cellproliferation, angiogenes, apoptos, metastasering och hormonell, kommer TMA att användas. PTEN och C/EBPa kommer också att analyseras.