Gastrointestinal mikrobiota ved primær skleroserende kolangitt og biliær atresi med vankomycin (PSC)

Så mange som 55 fag (35 med BA eller PSC og 20 kontroller) vil være involvert. Vi rekrutterer også 20 voksne pasienter med enten BA eller PSC. Pasientene vil bli rekruttert fra Lucile Children's Hospital, Stanford Medical Center og Stanford Redwood City Campus, slik som pasienter med primær skleroserende kolangitt, biliær atresi eller andre tarmlidelser for hvem øvre eller nedre endoskopi er indisert for rutinemessig medisinsk behandling. Det kan være noen deltakere som er over 18 år, selv om de aller fleste vil være under 18 år. Vankomycinbehandling vil bli administrert til BA-pasienter (4 uker) og PSC-pasienter. PSC-pasientens blodprøver ville nå bli tatt med forskjellige intervaller: før du starter Vancomycin; hver måned til deres leverfunksjonstester er normalisert; etter at deres leverfunksjonstester er normalisert; før de stopper Vancomycin og etter at de er av med Vancomycin ved måned 1,3,6,12 og 24. Det vil bli tatt avføringsprøver.

I tillegg vil pasienter som allerede skal gjennomgå enten øvre eller nedre intestinal endoskopi for rutinemessige diagnostiske eller terapeutiske formål, bli bedt om å godta endoskopisk slimhinnebørsting i tillegg til slimhinnebiopsier. Noen vil være pasienter med diagnosen primær skleroserende kolangitt, biliær atresi eller andre tarmlidelser som øvre eller nedre endoskopi er indisert for rutinemessig medisinsk behandling. Andre vil ha nedre intestinale funn (polypper) eller plager (f.eks. okkult blod i avføring), eller øvre intestinale funn (dyspepsi, refluks), og vil gjennomgå nedre endoskopi (koloskopi) eller øvre endoskopi for rutinemessig medisinsk behandling. Opptil 2 biopsier vil bli tatt fra mageslimhinnen og av så mange som 6 tarmsteder fra hver pasient. I tillegg vil følgende børster bli tatt: 2 fra midten av spiserøret, 2 fra mindre krumning av magen, 2 fra den andre delen av tolvfingertarmen nær ampulla. 2 fra jejunum 5 cm fra Ligament of Trietz, og 2 fra ileum 10 cm fra ileocecal ventilen. Vi vil også få børsting fra tungen. En prøve av spytt vil bli tatt.

Fekale prøver vil også bli tatt rett før tarmforberedelse for endoskopi/koloskopi. Hvis BA-pasienten allerede har en Kasai portoenterostomi, utført for å fjerne de syke gallegangene, vil vi gjerne ta en biopsi av gallegangen. Hvis pasienten har en klinisk utført leverbiopsi, ønsker vi å beholde en 2 mm del av den. Hvis pasienten har et intraoperativt kolangiogram for å evaluere gallegangene, samler vi inn 2,5 cc. av gallevæske. Når det gjelder kontrollene, som har andre tarmlidelser og som også får utført kliniske endoskopier, vil vi be om en midøsofagusbiopsi; en biopsi fra antrum og 2 biopsier fra 4. del av tolvfingertarmen. Cellebørsting vil bli tatt fra følgende områder: 2 fra midten av spiserøret, 2 fra mindre krumning av magen, 2 fra den andre delen av tolvfingertarmen nær ampulla. 2 fra jejunum 5 cm fra Ligament of Trietz, og 2 fra ileum 10 cm fra ileocecal ventilen. Vi vil også få børsting fra tungen. En prøve av spytt vil bli tatt. Hvis pasienten får utført en koloskopi som en del av sin kliniske behandling, vil vi be om en biopsi fra ileum, blindtarm og tverrgående nedadgående rektum. Vi vil også be om en spyttprøve.

Blodprøvene ville nå bli tatt med forskjellige intervaller: før du starter Vancomycin; hver måned til deres leverfunksjonstester er normalisert; etter at deres leverfunksjonstester er normalisert; før de stopper Vancomycin og etter at de er av med Vancomycin ved måned 1,3,6,12 og 24.