Den virkelige distribusjonen av mikrobiota langs tykktarmen ved å bruke en ny enhet langs tykktarmen ved å bruke en ny enhet

Den menneskelige mikrobiotaen danner et svært komplekst økosystem med verten, bestående av hundrevis av forskjellige arter av mikroorganismer, hvorav de fleste ennå ikke er dyrket. Med den nylige bruken av gensekvenseringsteknologi for små underenheter rRNA (SSU rRNA), anslås det at antallet spesifikke fylotyper i mage-tarmkanalen er mer enn 1800. Prøvetakingsteknikker kan utgjøre en stor forvirring i avlesningen av svært sensitive teknikker som SSU-DNA-analyse.

Det er ikke korrekt fastslått om det er forskjell i distribusjon av luminale bakterier eller slimhinneadherente bakterier proksimalt eller distalt i tykktarmen. I tillegg kan "tarmskylling" før endoskopi resultere i en forstyrrelse av mikrobiotaen i tarmen. For denne proof of concept-studien er det designet en ny enhet som er i stand til å ta "beskyttede" biopsier.

Vi antar at fordelingen av slimhinne- og luminal mikrobiota endres fra proksimal til distal i tykktarmen, og ved å ta 'beskyttede biopsier' vil det være mulighet for å vise den reelle fordelingen av mikrobiota i henhold til lokaliseringen i tykktarmen.

Videre antar vi at mikrobiell mangfold vil variere etter tarmskylling.