Den verkliga distributionen av mikrobiota längs tjocktarmen med hjälp av en ny anordning Längs tjocktarmen med hjälp av en ny anordning

Den mänskliga mikrobiotan bildar ett mycket komplext ekosystem med sin värd, bestående av hundratals olika arter av mikroorganismer, varav majoriteten ännu inte har odlats. Med den senaste tillkomsten av gensekvenseringsteknologi för små subenheter rRNA (SSU rRNA), uppskattas det att antalet specifika fylotyper i mag-tarmkanalen är mer än 1800. Provtagningstekniker kan utgöra en stor förvirring i utläsningen av mycket känsliga tekniker som SSU-DNA-analys.

Det är inte korrekt fastställt om det finns en skillnad i distribution av luminala bakterier eller mukosa adherenta bakterier proximalt eller distalt i tjocktarmen. Dessutom kan "tarmsköljning" före endoskopi resultera i en störning av mikrobiotan i tarmen. För denna proof of concept-studie har en ny enhet som kan ta "skyddade" biopsier designats.

Vi antar att fördelningen av mukosal och luminal mikrobiota förändras från proximal till distal i tjocktarmen, och genom att ta 'skyddade biopsier' kommer det att finnas möjlighet att visa den verkliga fördelningen av mikrobiota enligt lokaliseringen i tjocktarmen.

Dessutom antar vi att mikrobiell mångfald kommer att skilja sig efter tarmsköljning.