Rzeczywiste rozmieszczenie mikrobiomu wzdłuż jelita grubego przy użyciu nowego urządzenia wzdłuż jelita grubego przy użyciu nowego urządzenia

Ludzka mikrobiota wraz ze swoim żywicielem tworzy wysoce złożony ekosystem, składający się z setek różnych gatunków mikroorganizmów, z których większość nie została jeszcze wyhodowana. Szacuje się, że wraz z niedawnym pojawieniem się technologii sekwencjonowania genów małych podjednostek rRNA (SSU rRNA) liczba określonych filotypów przewodu pokarmowego wynosi ponad 1800. Techniki pobierania próbek mogą stanowić główny czynnik zakłócający odczyt bardzo czułych technik, takich jak analiza SSU-DNA.

Nie jest właściwie ustalone, czy istnieje różnica w rozmieszczeniu bakterii światła lub bakterii przylegających do błony śluzowej proksymalnej lub dystalnej okrężnicy. Ponadto „płukanie jelita” przed endoskopią może spowodować zaburzenie mikroflory jelitowej. Na potrzeby tego badania sprawdzającego koncepcję zaprojektowano nowe urządzenie zdolne do wykonywania „chronionych” biopsji.

Stawiamy hipotezę, że rozmieszczenie mikroflory błony śluzowej i światła zmienia się od proksymalnej do dystalnej w okrężnicy, a pobranie „chronionych biopsji” będzie okazją do pokazania rzeczywistego rozmieszczenia mikroflory zgodnie z lokalizacją w okrężnicy.

Ponadto stawiamy hipotezę, że różnorodność drobnoustrojów będzie się różnić po płukaniu jelit.