Diagnostisk forskning hos pasienter med sjeldne sykdommer - Løsning av uløste sjeldne sykdommer (AnDDI-Solve-RD)

De fleste diagnostisk uløste sjeldne sykdommer har en genetisk årsak. Disse årsakene er ikke funnet ved bruk av gjeldende metodikk på grunn av tekniske begrensninger (f. gjentatte utvidelser, endringer i ikke-kodende (introniske) regioner) eller, selv om de er metodisk registrert, deres patofysiologiske betydning, men ikke klassifisert som klinisk relevant. En re- og metaanalyse av eksisterende datasett med nye algoritmer og statistiske modeller, samt komplementering med andre omics-teknologier etterfulgt av funksjonelle oppfølgingsstudier i passende sykdomsmodeller (f. pasientcellelinjer) gjør det mulig å belyse ytterligere årsaker til sykdommer og forbedre diagnosen av arvelige sykdommer. I tillegg til direkte undersøkelse av personer som er berørt, spiller analysen av friske familiemedlemmer, for eksempel av foreldre, en viktig rolle i en såkalt trioanalyse, spesielt i effektiv filtrering av de omfattende datasettene for nyopprettede endringer, så -kalt de novo- Varianter (nye mutasjoner). I sammenheng med de skisserte analysene kan nye sykdomsgener bli funnet og validert. Gevinsten av vitenskapelig kunnskap på grunn av en bedre forståelse av grunnleggende cellebiologiske mekanismer kan bidra til utvikling av målrettede terapeutiske tilnærminger.

I denne sammenhengen har Solve-RD-prosjektet blitt bygget og finansiert av EU med ambisjoner om å løse et stort antall sjeldne sykdommer, som en molekylær årsak ikke er kjent ennå ved sofistikerte kombinerte omics-tilnærminger, og for å forbedre diagnostikk av sjeldne sykdommer. sykdomspasienter. Solve-RD integreres fullt ut med de nyopprettede europeiske referansenettverkene (ERN) for sjeldne sykdommer, og spesielt ERN-RND, -EURO-NMD, -ITHACA og -GENTURIS. AnDDI-Rares-nettverket er fullt tilknyttet ERN ITHACA-nettverket og vil aktivt bidra i prosjektet, med ambisjonen om å dele kunnskap om gener, genomiske varianter og fenotyper.

Prosjektet vil først reanalysere 18 000 negative eksomer fra de forskjellige ERN-ene utført i en diagnostisk eller forskningskontekst (innsamling av biomateriale, kliniske/fenotypiske data pluss neste generasjons sekvensering er allerede utført, og pasienten/familien har tidligere skriftlig samtykket til at deres prøven kan brukes til forskning relatert til sykdommen deres, uten at studierelatert tilstedeværelse er nødvendig. Prosjektet vil også foreslå nye multi-omics-analyser med nye prøver som trengs hos 500 pasienter og deres foreldre totalt, som rettferdiggjør AnDDI-Solve-RD-prosjektet.