Investigación diagnóstica en pacientes con enfermedades raras - Resolviendo las enfermedades raras no resueltas (AnDDI-Solve-RD)

La mayoría de las enfermedades raras no resueltas en el diagnóstico tienen una causa genética. Estas causas no se han encontrado aplicando las metodologías actuales debido a limitaciones técnicas (p. expansiones repetidas, cambios en regiones no codificantes (intrónicas)) o, aunque registrados metódicamente, su significado fisiopatológico pero no clasificado como clínicamente relevante. Un nuevo y metanálisis de los conjuntos de datos existentes con nuevos algoritmos y modelos estadísticos, así como la complementación con otras tecnologías ómicas seguidas de estudios de seguimiento funcional en modelos de enfermedades apropiados (p. líneas celulares de pacientes) permite dilucidar causas adicionales de enfermedades y mejorar el diagnóstico de enfermedades hereditarias. Además del examen directo de las personas afectadas, el análisis de miembros sanos de la familia, por ejemplo, de los padres, juega un papel importante en el llamado análisis de trío, especialmente en el filtrado eficiente de los extensos conjuntos de datos para cambios recién creados, de modo que -llamadas de novo- Variantes (nuevas mutaciones). En el contexto de los análisis descritos, se pueden encontrar y validar nuevos genes de enfermedades. La adquisición de conocimientos científicos debido a una mejor comprensión de los mecanismos biológicos celulares básicos puede contribuir al desarrollo de enfoques terapéuticos específicos.

En este contexto, el proyecto Solve-RD ha sido construido y financiado por la Unión Europea con la ambición de resolver un gran número de enfermedades raras, para las cuales aún no se conoce una causa molecular mediante enfoques ómicos combinados sofisticados, y para mejorar el diagnóstico de enfermedades raras. pacientes de la enfermedad. Solve-RD se integra completamente con las Redes Europeas de Referencia (ERN) recién formadas para enfermedades raras, y en particular con ERN-RND, -EURO-NMD, -ITHACA y -GENTURIS. La red AnDDI-Rares está totalmente afiliada a la red ERN ITHACA y contribuirá activamente al proyecto, con la ambición de compartir conocimientos sobre genes, variantes genómicas y fenotipos.

En primer lugar, el proyecto reanalizará 18.000 exomas negativos de las diferentes ERN realizadas en un contexto de diagnóstico o investigación (ya se ha realizado la recogida de biomaterial, datos clínicos/fenotípicos más la secuenciación de última generación, y el paciente/familiar ha acordado previamente por escrito que su la muestra podría usarse para investigaciones relacionadas con su enfermedad, sin que se requiera la presencia relacionada con el estudio. El proyecto también propondrá nuevos análisis multiómicos con nuevas muestras necesarias en 500 pacientes y sus padres en total, lo que justifica el proyecto AnDDI-Solve-RD.