Diagnostisk forskning hos patienter med sällsynta sjukdomar - att lösa de olösta sällsynta sjukdomarna (AnDDI-Solve-RD)

De flesta diagnostiskt olösta sällsynta sjukdomar har en genetisk orsak. Dessa orsaker har inte hittats med tillämpning av nuvarande metoder på grund av tekniska begränsningar (t.ex. upprepade expansioner, förändringar i icke-kodande (introniska) regioner) eller, även om de är metodiskt registrerade, deras patofysiologiska betydelse men inte klassificerade som kliniskt relevanta. En om- och metaanalys av befintliga datamängder med nya algoritmer och statistiska modeller samt komplementet med andra omics-teknologier följt av funktionella uppföljningsstudier i lämpliga sjukdomsmodeller (t. patientcellinjer) gör det möjligt att klarlägga ytterligare orsaker till sjukdomar och förbättra diagnosen av ärftliga sjukdomar. Förutom den direkta undersökningen av personer som drabbats spelar analysen av friska familjemedlemmar, till exempel av föräldrar, en viktig roll i en så kallad trioanalys, särskilt för effektiv filtrering av de omfattande datamängderna för nyskapade förändringar, så -kallade de novo- Varianter (nya mutationer). Inom ramen för de skisserade analyserna kan nya sjukdomsgener hittas och valideras. Vinsten av vetenskaplig kunskap tack vare en bättre förståelse av grundläggande cellbiologiska mekanismer kan bidra till utvecklingen av riktade terapeutiska metoder.

I detta sammanhang har Solve-RD-projektet byggts och finansierats av Europeiska unionen med ambitionen att lösa ett stort antal sällsynta sjukdomar, för vilka en molekylär orsak ännu inte är känd genom sofistikerade kombinerade omics-metoder, och att förbättra diagnostiken av sällsynta sjukdomar. sjukdomspatienter. Solve-RD integreras helt med de nybildade europeiska referensnätverken (ERN) för sällsynta sjukdomar, och i synnerhet ERN-RND, -EURO-NMD, -ITHACA och -GENTURIS. Nätverket AndDDI-Rares är helt anslutet till nätverket ERN ITHACA och kommer aktivt att bidra till projektet, genom ambitionen att dela kunskap om gener, genomiska varianter och fenotyper.

Projektet kommer först att omanalysera 18 000 negativa exom från de olika ERN som utförts i ett diagnostiskt eller forskningssammanhang (insamling av biomaterial, kliniska/fenotypiska data plus nästa generations sekvensering har redan utförts, och patienten/familjen har tidigare skriftligen samtyckt till att deras prov kan användas för forskning relaterad till deras sjukdom, utan att någon studierelaterad närvaro krävs. Projektet kommer också att föreslå nya multiomics-analyser med nya prover som behövs på totalt 500 patienter och deras föräldrar, vilket motiverar projektet AnDDI-Solve-RD.