Diagnostický výzkum u pacientů se vzácnými chorobami - řešení nevyřešených vzácných onemocnění (AnDDI-Solve-RD)

Většina diagnosticky nevyřešených vzácných onemocnění má genetickou příčinu. Tyto příčiny nebyly při použití současných metodologií nalezeny kvůli technickým omezením (např. opakující se expanze, změny v nekódujících (intronických) oblastech) nebo, i když jsou metodicky zaznamenány, jejich patofyziologický význam, ale nejsou klasifikovány jako klinicky relevantní. Opětovná a metaanalýza existujících datových souborů s novými algoritmy a statistickými modely, jakož i doplnění s dalšími omikovými technologiemi následované funkčními následnými studiemi na vhodných modelech onemocnění (např. pacientské buněčné linie) umožňuje objasnit další příčiny onemocnění a zlepšit diagnostiku dědičných onemocnění. Kromě přímého zkoumání postižených osob hraje důležitou roli analýza zdravých rodinných příslušníků, například rodičů, v tzv. trioanalýze, zejména v efektivním filtrování rozsáhlých datových sad pro nově vzniklé změny, tzv. -tzv. de novo- Varianty (nové mutace). V kontextu nastíněných analýz lze nalézt a ověřit nové geny onemocnění. Získání vědeckých poznatků díky lepšímu pochopení základních buněčných biologických mechanismů může přispět k rozvoji cílených terapeutických přístupů.

V této souvislosti je projekt Solve-RD vybudován a financován Evropskou unií s ambicemi řešit velké množství vzácných onemocnění, u nichž není dosud známa molekulární příčina, pomocí sofistikovaných kombinovaných omických přístupů a zlepšit diagnostiku vzácných onemocnění. nemocných pacientů. Solve-RD se plně integruje s nově vytvořenými evropskými referenčními sítěmi (ERN) pro vzácná onemocnění, a to zejména s ERN-RND, -EURO-NMD, -ITHACA a -GENTURIS. Síť AnDDI-Rares je plně přidružena k síti ERN ITHACA a bude aktivně přispívat k projektu, ambicí sdílet znalosti o genech, genomických variantách a fenotypech.

Projekt nejprve znovu analyzuje 18 000 negativních exomů z různých ERN provedených v diagnostickém nebo výzkumném kontextu (sběr biomateriálu, klinických/fenotypových dat plus sekvenování nové generace již byl proveden a pacient/rodina již dříve písemně souhlasila, že jejich Vzorek by mohl být použit pro výzkum související s jejich onemocněním, aniž by byla vyžadována přítomnost související se studií. Projekt také navrhne nové multi-omické analýzy s novými vzorky potřebnými u celkem 500 pacientů a jejich rodičů, což ospravedlňuje projekt AnDDI-Solve-RD.