Ricerca diagnostica nei pazienti con malattie rare - Risolvere le malattie rare irrisolte (AnDDI-Solve-RD)

La maggior parte delle malattie rare diagnosticamente irrisolte ha una causa genetica. Tali cause non sono state riscontrate applicando le attuali metodologie a causa di limitazioni tecniche (es. espansioni ripetute, cambiamenti nelle regioni non codificanti (introniche)) o, sebbene registrati metodicamente, il loro significato fisiopatologico ma non classificato come clinicamente rilevante. Una ri- e meta-analisi di insiemi di dati esistenti con nuovi algoritmi e modelli statistici, nonché la complementazione con altre tecnologie omiche seguite da studi di follow-up funzionale in modelli di malattia appropriati (ad es. linee cellulari di pazienti) consente di chiarire ulteriori cause di malattie e migliorare la diagnosi delle malattie ereditarie. Oltre all'esame diretto delle persone colpite, l'analisi dei membri sani della famiglia, ad esempio dei genitori, svolge un ruolo importante in una cosiddetta analisi del trio, in particolare nel filtraggio efficiente degli ampi set di dati per i cambiamenti di nuova creazione, quindi -chiamate de novo- Varianti (nuove mutazioni). Nel contesto delle analisi delineate, è possibile trovare e convalidare nuovi geni di malattia. L'acquisizione di conoscenze scientifiche grazie a una migliore comprensione dei meccanismi biologici cellulari di base può contribuire allo sviluppo di approcci terapeutici mirati.

In questo contesto, il progetto Solve-RD è stato realizzato e finanziato dall'Unione Europea con l'ambizione di risolvere un gran numero di malattie rare, per le quali non è ancora nota una causa molecolare mediante sofisticati approcci di omica combinata, e di migliorare la diagnostica delle malattie rare malati. Solve-RD si integra completamente con le nuove reti di riferimento europee (ERN) per le malattie rare, e in particolare ERN-RND, -EURO-NMD, -ITHACA e -GENTURIS. La rete AnDDI-Rares è completamente affiliata alla rete ERN ITHACA e contribuirà attivamente al progetto, con l'ambizione di condividere le conoscenze su geni, varianti genomiche e fenotipi.

Il progetto analizzerà prima di tutto 18.000 esomi negativi delle diverse ERN eseguite in un contesto diagnostico o di ricerca (la raccolta di biomateriali, dati clinici/fenotipici più il sequenziamento di nuova generazione è già stata eseguita e il paziente/la famiglia ha concordato in precedenza per iscritto che il loro campione potrebbe essere utilizzato per la ricerca correlata alla loro malattia, senza che sia richiesta la presenza correlata allo studio. Il progetto proporrà anche nuove analisi multi-omiche con nuovi campioni necessari in 500 pazienti e i loro genitori in totale, giustificando il progetto AnDDI-Solve-RD.