Diagnosztikai kutatás ritka betegségben szenvedő betegeknél – A megoldatlan ritka betegségek megoldása (AnDDI-Solve-RD)

A legtöbb diagnosztikailag megoldatlan ritka betegségnek genetikai okai vannak. Ezeket az okokat a jelenlegi módszerekkel technikai korlátok miatt (pl. ismétlődő kiterjedések, nem kódoló (intronikus) régiók változásai) vagy – bár módszeresen rögzítik – patofiziológiai jelentőségüket, de nem minősítik klinikailag relevánsnak. Meglévő adatkészletek újra- és metaanalízise új algoritmusokkal és statisztikai modellekkel, valamint más omika technológiákkal való kiegészítése, majd funkcionális követési vizsgálatok a megfelelő betegségmodellekben (pl. betegsejtvonalak) lehetővé teszi a betegségek további okainak feltárását és az örökletes betegségek diagnosztizálásának javítását. Az érintettek közvetlen vizsgálata mellett az egészséges családtagok, például a szülők elemzése fontos szerepet kap egy úgynevezett trióelemzésben, különösen a kiterjedt adatsorok újonnan létrejött változásokra való hatékony szűrésében, így -de novo-nak nevezett változatok (új mutációk). A vázolt elemzések keretében új betegséggének felkutathatók és validálhatók. Az alapvető sejtbiológiai mechanizmusok jobb megértése révén szerzett tudományos ismeretek hozzájárulhatnak a célzott terápiás megközelítések kidolgozásához.

Ebben az összefüggésben a Solve-RD projektet az Európai Unió építette fel és finanszírozta azzal az ambícióval, hogy nagyszámú olyan ritka betegséget oldjon meg, amelyek molekuláris okát még nem ismerik kifinomult kombinált ómikus megközelítésekkel, valamint hogy javítsák a ritka betegségek diagnosztikáját. betegségben szenvedők. A Solve-RD teljes mértékben integrálódik a ritka betegségek újonnan alakult európai referenciahálózataival (ERN), különösen az ERN-RND-vel, -EURO-NMD-vel, -ITHACA-val és -GENTURIS-szal. Az AnDDI-Rares hálózat teljes mértékben kapcsolódik az ERN ITHACA hálózathoz, és aktívan hozzájárul a projekthez azzal a törekvéssel, hogy megosszák tudásukat a génekről, genomiális változatokról és fenotípusokról.

A projekt először 18 000 negatív exomát elemez a különböző ERN-ekből, diagnosztikai vagy kutatási kontextusban (bioanyag, klinikai/fenotípusos adatok gyűjtése, valamint a következő generációs szekvenálás már megtörtént, és a beteg/család korábban írásban beleegyezett abba, hogy mintát fel lehetne használni a betegségükkel kapcsolatos kutatásokhoz anélkül, hogy a vizsgálattal kapcsolatos jelenlétre lenne szükség. A projekt új multi-omikai elemzéseket is javasol majd, összesen 500 betegnél és szüleiknél új mintákra, ami indokolja az AnDDI-Solve-RD projektet.