Diagnostisk forskning i patienter med sjældne sygdomme - Løsning af uløste sjældne sygdomme (AnDDI-Solve-RD)

De fleste diagnostisk uløste sjældne sygdomme har en genetisk årsag. Disse årsager er ikke fundet ved anvendelse af de nuværende metoder på grund af tekniske begrænsninger (f.eks. gentagne udvidelser, ændringer i ikke-kodende (introniske) områder) eller, selvom de er metodisk registreret, deres patofysiologiske betydning, men ikke klassificeret som klinisk relevant. En re- og metaanalyse af eksisterende datasæt med nye algoritmer og statistiske modeller samt komplementering med andre omics-teknologier efterfulgt af funktionelle opfølgningsundersøgelser i passende sygdomsmodeller (f. patientcellelinjer) gør det muligt at belyse yderligere årsager til sygdomme og forbedre diagnosticeringen af ​​arvelige sygdomme. Udover den direkte undersøgelse af berørte personer, spiller analysen af ​​raske familiemedlemmer, for eksempel af forældre, en vigtig rolle i en såkaldt trioanalyse, især i den effektive filtrering af de omfattende datasæt for nyskabte ændringer, så -kaldet de novo- Varianter (nye mutationer). I forbindelse med de skitserede analyser kan nye sygdomsgener findes og valideres. Vinden af ​​videnskabelig viden på grund af en bedre forståelse af grundlæggende cellebiologiske mekanismer kan bidrage til udviklingen af ​​målrettede terapeutiske tilgange.

I denne sammenhæng er Solve-RD-projektet bygget og finansieret af Den Europæiske Union med ambitioner om at løse et stort antal sjældne sygdomme, hvortil en molekylær årsag endnu ikke er kendt af sofistikerede kombinerede omics-tilgange, og at forbedre diagnostik af sjældne sygdomspatienter. Solve-RD integreres fuldt ud med de nydannede europæiske referencenetværk (ERN'er) for sjældne sygdomme, og især ERN-RND, -EURO-NMD, -ITHACA og -GENTURIS. AnDDI-Rares netværket er fuldt tilsluttet ERN ITHACA netværket og vil aktivt bidrage til projektet, med ambitionen om at dele viden om gener, genomiske varianter og fænotyper.

Projektet vil først reanalysere 18.000 negative exomer fra de forskellige ERN'er udført i en diagnostisk eller forskningsmæssig sammenhæng (indsamling af biomateriale, kliniske/fænotypiske data plus næste generations sekventering er allerede blevet udført, og patienten/familien har tidligere skriftligt accepteret, at deres prøven kunne bruges til forskning relateret til deres sygdom, uden at der kræves nogen undersøgelsesrelateret tilstedeværelse. Projektet vil også foreslå nye multi-omics-analyser med nye prøver, der er nødvendige i 500 patienter og deres forældre i alt, hvilket retfærdiggør AnDDI-Solve-RD-projektet.