Badania diagnostyczne u pacjentów z chorobami rzadkimi — rozwiązywanie nierozwiązanych chorób rzadkich (AnDDI-Solve-RD)

Większość nierozwiązanych diagnostycznie chorób rzadkich ma podłoże genetyczne. Przyczyn tych nie znaleziono przy zastosowaniu obecnych metod z powodu ograniczeń technicznych (np. powtarzające się ekspansje, zmiany w regionach niekodujących (intronowych) lub, chociaż metodycznie rejestrowane, ich znaczenie patofizjologiczne, ale niesklasyfikowane jako istotne klinicznie. Ponowna i metaanaliza istniejących zestawów danych z nowymi algorytmami i modelami statystycznymi, a także uzupełnienie innymi technologiami omicznymi, a następnie funkcjonalne badania uzupełniające w odpowiednich modelach chorób (np. linii komórkowych pacjenta) pozwala na wyjaśnienie dodatkowych przyczyn chorób i poprawę diagnostyki chorób dziedzicznych. Oprócz bezpośredniego badania osób dotkniętych chorobą, analiza zdrowych członków rodziny, na przykład rodziców, odgrywa ważną rolę w tzw. -nazywane de novo- Warianty (nowe mutacje). W kontekście zarysowanych analiz można znaleźć i zweryfikować nowe geny chorobowe. Zdobycie wiedzy naukowej dzięki lepszemu zrozumieniu podstawowych mechanizmów biologicznych komórki może przyczynić się do rozwoju celowanych podejść terapeutycznych.

W tym kontekście projekt Solve-RD został stworzony i sfinansowany przez Unię Europejską z ambicjami rozwiązania dużej liczby rzadkich chorób, których przyczyna molekularna nie jest jeszcze znana za pomocą wyrafinowanych połączonych metod omicznych, oraz ulepszenia diagnostyki rzadkich chorób chorzy pacjenci. Solve-RD w pełni integruje się z nowo utworzonymi europejskimi sieciami referencyjnymi (ERN) ds. chorób rzadkich, aw szczególności z ERN-RND, -EURO-NMD, -ITHACA i -GENTURIS. Sieć AnDDI-Rares jest w pełni powiązana z siecią ERN ITHACA i będzie aktywnie uczestniczyć w projekcie poprzez ambicję dzielenia się wiedzą na temat genów, wariantów genomowych i fenotypów.

W ramach projektu najpierw ponownie przeanalizuje się 18 000 negatywnych egzomów z różnych ERN przeprowadzonych w kontekście diagnostycznym lub badawczym (zbieranie biomateriałów, danych klinicznych/fenotypowych oraz sekwencjonowanie nowej generacji zostało już przeprowadzone, a pacjent/rodzina uzgodnili wcześniej na piśmie, że ich próbkę można wykorzystać do badań związanych z ich chorobą, bez konieczności obecności związanej z badaniem. W ramach projektu zostaną również zaproponowane nowe analizy multiomiczne z nowymi próbkami potrzebnymi łącznie od 500 pacjentów i ich rodziców, uzasadniając projekt AnDDI-Solve-RD.