Transkriptomiske responser for identifisering av patogener (TRiP)
26. februar 2025 oppdatert av: University of Sheffield
En multisitt evaluering av funksjonelle genomiske signaturer for forbedret diagnose av akutt udifferensiert feberinfeksjoner
Akutt udifferensiert feberinfeksjon (AUFI) er et vanlig presentasjonssyndrom i innstillinger med lav ressurs og bedre diagnostikk er presserende nødvendig for å forbedre pasientbehandling og veilede forebygging av sykdommer. Vurdering av vertsgenuttrykksresponsen på infeksjon i endemiske populasjoner har vist betydelig løfte som en ny tilnærming til å identifisere pasienter med enterisk feber og for potensial i å skille mellom andre årsaker til AUFI. Signaturer identifisert gjennom nye dataanalytiske teknikker kan utvikles til en testpleiestest for bruk i endemiske omgivelser.
I denne multisite diagnostiske evalueringsstudien vil vi samle potensielle kliniske, laboratorie- og diagnostiske data fra to endemiske omgivelser for å evaluere vertsgenuttrykksignaturer for å oppdage enterisk feber og for å bestemme årsaken til AUFI i LMIC -omgivelser.
Studieoversikt
Status
Rekruttering
Intervensjon / Behandling
Studietype
Observasjonsmessig
Registrering (Antatt)
2000
Kontakter og plasseringer
Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.
Studiekontakt
- Navn: Farah Shahi
- Telefonnummer: 01142159522
- E-post: f.shahi@sheffield.ac.uk
Studer Kontakt Backup
- Navn: Thomas Darton
- E-post: t.darton@sheffield.ac.uk
Studiesteder
-
-
-
Vellore, India
- Rekruttering
- Christian Medical Centre
-
-
Deltakelseskriterier
Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
2 år til 45 år (Barn, Voksen, Eldre voksen)
Tar imot friske frivillige
Ja
Prøvetakingsmetode
Ikke-sannsynlighetsprøve
Studiepopulasjon
Vi vil rekruttere voksne i alderen 15 til 65 år som presenterer sykehus med feber på 2 steder: 1 i Asia og 1 i Afrika der enterisk feber er endemisk.
Alle inkluderte feberdeltakere vil ha en (dokumentert) tympanic/rektal temperatur på ≥ 38 ° C eller en aksillær/oral temperatur på ≥ 37,8 ° C på presentasjon og vil rapportere en feberhistorie i løpet av det siste døgnet som varer 3 til 14 dager.
Parallelt vil sunne samfunnskontrolldeltakere bli rekruttert fra hvert avsamlingsområde i løpet av studien med påmelding designet for å resultere i en jevn representasjon av aldersgrupper og sesongvariasjon.
Identifiserte signaturer om infeksjon vil bli utforsket i en årskull av feberbarn i alderen 2 til 14 år på hvert sted.
600 feberne voksne, 200 feberbarn og 200 afebrile voksne kontroller vil bli rekruttert på hvert sted.
Beskrivelse
Febrile voksne- inkluderingskriterier
- Alder større enn eller lik 15 år og mindre enn eller lik 65 år
- Deltakeren er villig, og de og/eller en passende verge/slektning/representant er i stand til å gi informert samtykke for deltakelse i studien og en oppfølging (telefon) diskusjon på 14 dager
Og enten:
Febre sykdom uten å lokalisere funksjoner (se 'eksklusjonskriterier' og 'screening' seksjoner) der feber er definert som:
- dokumentert tympanisk/rektal temperatur på ≥ 38 ° C eller en aksillær/oral temperatur på ≥ 37,8 ° C, eller en rapportert feber i løpet av det siste døgnet og
- Rapportert varighet av feber 3-14 dager eller
- Nylig bekreftet blodkultur som indikerer enterisk feber (bekreftet i løpet av de foregående 5 dagene)
- De kan ha hatt nylig eksponering for antimikrobielle midler.
Febrile voksne- eksklusjonskriterier
- Deltakeren kan ikke gå inn i studien hvis noen av følgende gjelder:
- Kan ikke gi informert samtykke og ingen pårørende er villig og i stand til å gi informert samtykke.
For pasienter med febersykdom (inkludert i (1) ovenfor): enhver historie eller klinisk mistanke om:
- Revmatologisk eller bindevevsforstyrrelse (f.eks. Revmatoid artritt)
- Autoimmun tilstand (f.eks. Autoimmune hepatitt)
- Malignitet
- Aktiv behandling med immunmodulerende medisiner, eller for tuberkulose (lunge eller ekstrapulmonal) eller annen kronisk infeksjon.
- Graviditet (ammende mødre vil ikke bli ekskludert)
- Ingen sykehusinnleggelse i mer enn 48 timer de siste 4 ukene
- Vaksinasjon innen 4 uker før aktuell innleggelse
- Lokaliserende tegn eller symptomer på infeksjon som er tilstrekkelig til å diagnostisere den sannsynlige årsaken til akutt febersykdom og dermed forhindre at den blir 'udifferensiert.'
Kontrollkriterier
- Deltakeren er villig, og de er (og i 15-18-åringer, en verge er) i stand til å gi informert samtykke for deltakelse i studien
- Alder større enn eller lik 15 år og mindre enn eller lik 65 år
- De bor utenfor det normale/lokale nedslagsfeltet for hvert sykehussted
- Afebrile (som definert av ingen rapportert feber og temperatur ≤ 38 ° C eller en aksillær/oral temperatur på ≤ 37,8 ° C).
Kontroller- eksklusjonskriterier
- Deltakeren kan ikke gå inn i studien hvis noen av følgende gjelder:
- Kan ikke gi informert samtykke og ingen pårørende (eller foreldre/verge i saken om en mindreårig) er villig og i stand til å gi informert samtykke.
Nåværende behandling for eller tidligere historie, eller klinisk mistanke om:
- Revmatologisk eller bindevevsforstyrrelse
- Autoimmun tilstand
- Malignitet
- Aktiv behandling for tuberkulose (lunge eller ekstrapulmonal) eller klinisk mistanke om aktiv tuberkulose. Tidligere fullført behandling er ikke en grunn til ekskludering.
- Aktiv behandling med immunmodulerende medisiner eller annen kronisk infeksjon.
- Gravid (amming mødre vil ikke bli ekskludert)
- Sykehusinnleggelse innen 4 uker etter rekrutteringen
- Vaksinasjon innen 4 uker før rekruttering
- Antimikrobiell bruk innen 4 uker etter rekrutteringen
- Deltakeren rapporterer at de føler seg mer uvel enn vanlig på påmeldingsdagen.
Utforskende mål- pediatriske kriterier; Inkluderingskriterier
- Alder større enn eller lik 2 år og mindre enn 15 år
- Som ovenfor for voksne deltakere.
Utforskende mål- pediatriske kriterier; Eksklusjonskriterier
- Foreldre/verge er uvillig, og/eller tålmodig i alderen 8 til 14 år er uvillig til å samtykke til å gi informert samtykke.
- Som ovenfor for voksne deltakere.
Studieplan
Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiver: Potensielle
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Feberbarn
400 barnedeltakere (2 til 14 år) med en febersykdom uten å lokalisere funksjoner og rapporterte varighet på 3-14 dager.
Dette er en utforskende arm av studien.
|
Dette er en prospektiv multisitt diagnostisk evalueringsstudie for å vurdere en ny tilnærming til diagnose av enterisk feber.
Indekstesten av vertsgentranskripsjonsrespons med en 5 gensignatur vil bli sammenlignet med referansetesten for blodkulturbekreftelse for en diagnose av enterisk feber hos pasienter med AUFI.
|
|
Febre voksne
1200 voksne deltakere (15 til 65 år gammel) med en febersykdom uten å lokalisere funksjoner og rapporterte varighet på 3-14 dager.
|
Dette er en prospektiv multisitt diagnostisk evalueringsstudie for å vurdere en ny tilnærming til diagnose av enterisk feber.
Indekstesten av vertsgentranskripsjonsrespons med en 5 gensignatur vil bli sammenlignet med referansetesten for blodkulturbekreftelse for en diagnose av enterisk feber hos pasienter med AUFI.
|
|
Kontroller
400 afebrile, friske voksne deltakere (15 til 65 år).
|
Dette er en prospektiv multisitt diagnostisk evalueringsstudie for å vurdere en ny tilnærming til diagnose av enterisk feber.
Indekstesten av vertsgentranskripsjonsrespons med en 5 gensignatur vil bli sammenlignet med referansetesten for blodkulturbekreftelse for en diagnose av enterisk feber hos pasienter med AUFI.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Følsomhet og spesifisitet (AUROC) av en diagnostisk poengsum avledet fra transkripsjonelle responser med en 5-gen transkripsjonssignatur (STAT1, SLAMF8, PSME2, Wars, ALDH1A1) for å klassifisere pasienter med blodkulturbekreftet enterisk feber.
Tidsramme: 2,5 år
|
Evaluer ytelsen til en vertsgen -transkripsjonssignatur for å oppdage enterisk feber hos voksne som presenterer akutt udifferensiert feber (AUFI)
|
2,5 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Antall deltakere med diagnose bekreftet ved laboratorietesting.
Tidsramme: 2,5 år
|
Bestem frekvensen av andre vanlige årsaker til AUFI på hvert sted.
|
2,5 år
|
|
Antall deltakere som har mild, moderat eller alvorlig sykdom ved klinisk diagnose i henhold til validerte prognostiske score som sepsis scoringssystemer.
Tidsramme: 2,5 år
|
Vurdere forholdet mellom markører for alvorlighetsgrad av klinisk sykdom, sannsynligvis infeksjonsårsak og nivå av molekylær forstyrrelse.
|
2,5 år
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.
Sponsor
Samarbeidspartnere
Etterforskere
- Studieleder: Thomas Darton, University of Sheffield
Studierekorddatoer
Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
2. mai 2022
Primær fullføring (Antatt)
1. juni 2025
Studiet fullført (Antatt)
1. juni 2025
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
20. januar 2021
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
5. mai 2021
Først lagt ut (Faktiske)
7. mai 2021
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
25. mars 2025
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
26. februar 2025
Sist bekreftet
1. februar 2025
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 157365
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Nei
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Nei
produkt produsert i og eksportert fra USA
Nei
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .