Immun- og mikromiljø-Proteogenomisk profilering for klassifisering av lungekreftpasienter

Den overdrevne ansamlingen av væske mellom membranene som omgir lungen, en klinisk tilstand som ofte refereres til som "pleural effusjon", er forårsaket av en av tre faktorer: økt produksjon av pleuravæske, redusert evne til å reabsorbere pleuravæske eller en blanding av begge.

Grunnlaget for opphopning av pleural effusjon kan stamme fra flere patologier: fra godartede og ekstrapulmonale tilstander til indre pleurapatologi (inflammatorisk eller neoplastisk primær eller metastatisk) der væskeansamlingen i pleurarommet hovedsakelig skyldes endringer i strukturen til pleura. membran (tap av integritet og/eller infiltrasjon av neoplastiske celler).

Et eksempel på ekstrapulmonale tilstander er pleural effusjon observert hos pasienter med kongestiv hjertesvikt der det er økning i hydrostatisk kapillærtrykk, på grunn av svikt i kardiosirkulasjonspumpen.

Skillet mellom godartede og ondartede årsaker er for tiden en diagnostisk utfordring som vanligvis krever innsamling av materiale (celler nedsenket i pleuravæsken eller til og med en histologisk prøve).

Det første trinnet i denne undersøkelsen er for øyeblikket den cytologiske evalueringen av pleuravæsken, det vil si observasjon av celler, av en innledende prøve av pleuravæsken. Denne prosedyren er assosiert med en gjennomsnittlig sensitivitet på 62 %, mens en andre prøve gjennom thoracentese forbedrer sensitiviteten til diagnosen med 10 %. I visse tilfeller er det imidlertid ikke mulig å diagnostisere ved å analysere pleuravæsken, og som regel anbefales en mer invasiv diagnostisk metode, for eksempel pleurabiopsi (samlet ved punktering med en "blind" nål, ekkostyrt eller beregnet tomografi veiledet eller oppnådd ved hjelp av direkte visualisering av pleurahulen gjennom pleuroskopi).

Det diagnostiske utbyttet av denne tilnærmingen kan nå opptil 97% (i tilfelle av pleural biopsi oppnådd ved medisinsk torakoskopi). Det innebærer imidlertid større sykelighet og større forbruk av ressurser (materiell og menneskelig). Utviklingen av en mer sensitiv og spesifikk og samtidig mindre invasiv diagnostisk metode for pleuravæske kan bidra til en mer effektiv screening av pasienter, og begrense bruken av mer invasive metoder, kun for pasienter med høyere risiko for malign patologi.

Studiemål:

Dette prosjektet består av en preklinisk studie hvor vi skal utforske nye metoder for klinisk evaluering, basert på proteomisk analyse av de immunologiske egenskapene og mikromiljøet til svulsten i pleuravæsken til pasienter hvis diagnose ikke er bekreftet. Resultatene som oppnås vil bli brukt i implementeringen av en algoritme for klassifisering av pleuravæske i følgende grupper: a) lav risiko eller godartet; b) høy risiko eller ondartet. Hvis algoritmen har god sensitivitet og spesifisitet for ondartede diagnoser, kan det være nyttig å skille pasienter inn i gruppene: a) utsette den invasive testen og gjøre aktiv bildediagnostisk overvåking; b) fortsett til invasiv testing.

Nytte/risikovurdering:

Oppsamlingen av pleuravæsken vil bli utført ved prosedyrer som brukes i standardbehandling og diagnostisering av sykdommen, og utgjør dermed ikke ytterligere risiko for deltakerne. Resultatene av denne undersøkelsen gir ikke kliniske effekter direkte gjeldende for de involverte deltakerne. Imidlertid kan de oppnådde resultatene i fremtiden komme andre brukere til gode gjennom forbedret forståelse av tumormikromiljøet.

Rekrutteringsmåter:

Gjennom et intervju med den undersøkende legen blir deltakeren i denne studien klar over vilkårene for behandlingen av hans personopplysninger innenfor forskningsprosjektets omfang. I tillegg signerer registrerte informert samtykke for deltakelse i studien. Varselet inkluderer en forklaring av prosedyrene involvert i etterforskningen og rollen til personopplysninger som samles inn i forbindelse med etterforskningen. I et intervju med den undersøkende legen og ved å signere det informerte samtykket for deltakelse i studien, blir den registrerte klar over sin rett til å trekke seg fra studien og/eller trekke tilbake sitt informerte samtykke.

Innsamlingen av biologiske prøver for den komparative prospektive kohortstudien vil bli gjennomført i alle samarbeidssykehus i dette prosjektet i løpet av en periode på to til tre år. Basert på variansen og statistisk kraft observert i en tidligere studie av pulmonalvæskeeksosomproteomet, ble 200 prøver estimert som minimumsantallet for klassifisering av biologiske prøver. Analysen av statistisk kraft er basert på variansen observert i 10 prøver der omtrent 3500 proteiner ble identifisert og kvantifisert i lungevæsker. Den statistiske kraftanalysen vurderer korreksjonen for flere tester i henhold til antall proteiner identifisert og kvantifisert.

Datainnsamlingsspesifikasjoner:

Under konsultasjonen vil det bli gjennomført et klinisk intervju, som vil tillate innsamling av personopplysninger, nemlig genetiske data, data relatert til helse og rase eller etnisk opprinnelse. Det vil også bli gjennomført en objektiv undersøkelse for å vurdere vekt, høyde, blodtrykk og hjertefrekvens. Data relatert til resultatene av komplementære diagnostiske tester vil bli samlet inn, nemlig: 1. Røntgen av thorax (plassering, omfang og karakteristika av pleural effusjon); 2. ultralyd av brystet (plassering, omfang, karakterisering av økostrukturen - homogen / heterogen; med / uten synlige skillevegger); 3. Thoracic Computed Tomography (plassering, utstrekning, morfologisk aspekt av pleura - tykkelsesøkning, knuter, etc.); 4. Cytologisk evaluering av pleuravæsken; 5. Serum biokjemisk studie: blodsukkernivå; analyse av totale proteiner og serumalbumin; nivået av laktatdehydrogenase.

Referansediagnostisk metode vil være basert på histologisk evaluering av vevet. Resultatene av proteomikkanalysen oppnådd i dette prosjektet vil ikke bli tatt i betraktning for den endelige diagnosen av deltakerne.

Spesifikasjon av innsamling og endelig destinasjon for biologiske prøver:

I henhold til klinikerens avgjørelse vil pleuravæske innhentes for diagnose (gjennom thoracentese eller i løpet av pleurabiopsi eller pleuroskopi). Prøven som oppnås vil følge den vanlige kliniske undersøkelsesveien (cytologisk og/eller histopatologisk evaluering, biokjemisk evaluering, mikrobiologisk evaluering) som er registrert i hver institusjon. For pasienter som takker ja til å delta i studien, vil kun en ekstra prøve av pleuravæske bli sendt til studien som vi foreslår å gjennomføre. Disse siste prøvene vil bli lagret på CEDOC.

Tekst med informasjon som skal gis til frivillige:

Studien som vi ber om ditt samtykke til tar sikte på å utvikle en diagnostisk metode med større spesifisitet og sensitivitet for å identifisere ulike patologier assosiert med overdreven akkumulering av pleuravæske (en tilstand ofte kjent som pleural effusjon). For tiden har den cytologiske evalueringen, det vil si observasjon av celler, av en innledende prøve av pleuravæsken en gjennomsnittlig følsomhet på 62 %, mens en andre prøvetaking gjennom thoracentese (består av aspirasjon av væsken fra pleura gjennom punktering av brystvegg) forbedrer sensitiviteten til diagnosen med 10 %. I visse tilfeller er det ikke mulig å diagnostisere ved å analysere pleuravæsken og som regel anbefales en mer invasiv diagnostisk metode, som pleurabiopsi eller pleuroskopi (kirurgisk teknikk som lar deg se direkte innsiden av brystkassen) med pleura biopsi (sensitivitet 98%). Utviklingen av en diagnostisk metode med større spesifisitet og sensitivitet av pleuravæsken, og dermed unngå invasive metoder, kan forbedre effektiviteten i screening av pasienter med pleuraeffusjon, og begrense den invasive studien til en utvalgt del av pasienter med en effektiv høyere risiko for ondartet patologi. . Din deltakelse i denne studien innebærer ikke ytterligere prosedyrer utover de som legen din anser som nødvendige for diagnostisering av sykdommen eller forskrivning av spesifikke legemidler for den aktuelle studien. De innsamlede prøvene vil anonymiseres med en kode, det vil si at det ikke vil være mulig for forskerne å matche prøvene med personopplysningene til de respektive pasientene. Alle dataene som samles inn vil være konfidensielle, i samsvar med den nye General Data Protection Regulation (GDPR) som trådte i kraft sist mai 2018 (Forordning (EU) nr. 2016/679).

PASIENTENS INFORMERT SAMTYKKE:

(NAVN) __________________________________________________, jeg samtykker frivillig til å delta i forskningsprosjektet med tittelen "Klinisk studie i sammenheng med diagnostisering av pasienter med pleural effusjon".

Jeg erklærer at jeg ble informert om målene og metodikken for denne studien, samt om vilkårene for deltakelse, etter å ha mottatt muntlig og skriftlig informasjon som jeg har hørt, lest og forstått.

Dette dokumentet ble signert etter at all tvil var avklart med den undersøkende legen og etter å ha reflektert over dette forslaget om deltakelse med ubegrenset tid.

Prøvene og dataene vil bli kryptert for å beskytte identiteten min. Jeg står fritt til å nekte å donere prøvene mine, og selv etter at jeg har gitt mitt samtykke, vil jeg når som helst kunne trekke det hvis det er mitt ønske. Beslutningen min vil på ingen måte påvirke kvaliteten på min kliniske oppfølging, og den vil heller ikke endre rettighetene mine som pasient ved _________________________________________________________________ (sykehusenheten).

Jeg kan når som helst be om generisk informasjon om studien som prøver brukes til. Jeg vil imidlertid ikke bli informert om de konkrete resultatene som er oppnådd i prøvene mine, siden disse dataene ikke er relevante for min kliniske oppfølging.

Jeg godkjenner også bruk av biologiske prøver og data samlet inn, anonymt og konfidensielt, i påfølgende forskningsprosjekter, forutsatt at de er autorisert av den aktuelle etiske komité.

Deltakerens signatur: ______________________________________

Dato: __ / __ / _____

Etterforskerens signatur: ______________________________________

Dato: __ / __ / _____

Eierskap og databeskyttelse av deltakere / konfidensialitet:

Sikkerhetstiltakene i beskyttelsen av personopplysninger som vil bli implementert inkluderer 1. Pseudonymisering og kryptering av personopplysninger; 2. Evne til å gjenopprette tilgjengelighet og tilgang til personopplysninger i tide i tilfelle en hendelse; 3. Prosess for testing, vurdering og regelmessig evaluering av effektiviteten av tekniske og organisatoriske tiltak for å sikre databehandlingens sikkerhet.