Immune- i Microenvironment-Proteogenomics Profiling for Klasyfikacja pacjentów z rakiem płuca

Nadmierne gromadzenie się płynu między błonami otaczającymi płuco, stan kliniczny powszechnie określany jako „wysięk opłucnowy”, jest spowodowany jednym z trzech czynników: zwiększoną produkcją płynu opłucnowego, zmniejszoną zdolnością do ponownego wchłaniania płynu opłucnowego lub mieszanką obu.

Podłoże gromadzenia się wysięku opłucnowego może wynikać z wielu patologii: od łagodnych i pozapłucnych po patologie wewnętrzne opłucnej (zapalne lub nowotworowe pierwotne lub przerzutowe), w których gromadzenie się płynu w jamie opłucnej wynika głównie ze zmian w strukturze opłucnej. błony (utrata integralności i/lub naciekanie przez komórki nowotworowe).

Przykładem stanów pozapłucnych jest wysięk opłucnowy obserwowany u pacjentów z zastoinową niewydolnością serca, w której dochodzi do wzrostu ciśnienia hydrostatycznego w naczyniach włosowatych z powodu niewydolności pompy krążenia.

Rozróżnienie między łagodnymi i złośliwymi przyczynami jest obecnie wyzwaniem diagnostycznym, które zwykle wymaga pobrania materiału (komórek zanurzonych w płynie opłucnowym lub nawet próbki histologicznej).

Pierwszym etapem tego badania jest obecnie ocena cytologiczna płynu opłucnowego, czyli obserwacja komórek wyjściowej próbki płynu opłucnowego. Ta procedura wiąże się ze średnią czułością 62%, podczas gdy druga próbka przez toracentezę poprawia czułość diagnozy o 10%. W niektórych przypadkach nie jest jednak możliwe postawienie diagnozy na podstawie analizy płynu opłucnowego i z reguły zalecana jest bardziej inwazyjna metoda diagnostyczna, taka jak biopsja opłucnej (pobierana przez nakłucie „ślepą” igłą, pod kontrolą echa lub komputerowo tomografia pod kontrolą lub uzyskana za pomocą bezpośredniej wizualizacji jamy opłucnej przez pleuroskopię).

Skuteczność diagnostyczna tego podejścia może sięgać nawet 97% (w przypadku biopsji opłucnej uzyskanej w torakoskopii lekarskiej). Oznacza to jednak większą zachorowalność i większe zużycie zasobów (materialnych i ludzkich). Opracowanie bardziej czułej i swoistej, a jednocześnie mniej inwazyjnej metody diagnostycznej płynu opłucnowego może przyczynić się do skuteczniejszego skriningu pacjentów, ograniczając stosowanie metod bardziej inwazyjnych jedynie w przypadku pacjentów z podwyższonym ryzykiem patologii złośliwej.

Cele studiów:

Projekt ten składa się z badania przedklinicznego, w którym zbadamy nowe metodologie oceny klinicznej, oparte na analizie proteomicznej charakterystyki immunologicznej i mikrośrodowiska guza w płynie opłucnowym pacjentów, u których diagnoza nie została potwierdzona. Uzyskane wyniki posłużą do wdrożenia algorytmu klasyfikacji płynu opłucnowego do następujących grup: a) niskiego ryzyka lub łagodny; b) wysokiego ryzyka lub złośliwy. Jeśli algorytm ma dobrą czułość i specyficzność w diagnostyce nowotworów złośliwych, przydatne może być podzielenie pacjentów na grupy: a) odłożyć badanie inwazyjne i wykonać aktywny nadzór obrazowy; b) przystąpić do badań inwazyjnych.

Ocena korzyści / ryzyka:

Pobieranie płynu opłucnowego będzie odbywać się procedurami stosowanymi w standardowej opiece i diagnostyce choroby, nie stanowiąc tym samym dodatkowego ryzyka dla uczestników. Wyniki tego badania nie przynoszą efektów klinicznych bezpośrednio odnoszących się do zaangażowanych uczestników. Jednak w przyszłości uzyskane wyniki mogą przynieść korzyści innym użytkownikom dzięki lepszemu zrozumieniu mikrośrodowiska guza.

Zasady rekrutacji:

Uczestnik tego badania poprzez rozmowę z lekarzem prowadzącym dowiaduje się o zasadach przetwarzania jego danych osobowych w ramach projektu badawczego. Ponadto osoby, których dane dotyczą, podpisują świadomą zgodę na udział w badaniu. Powiadomienie zawiera wyjaśnienie procedur związanych z dochodzeniem oraz rolę danych osobowych zebranych w kontekście dochodzenia. W rozmowie z lekarzem prowadzącym badanie i podpisaniu świadomej zgody na udział w badaniu osoba, której dane dotyczą, dowiaduje się o swoim prawie do wycofania się z badania i/lub wycofania świadomej zgody.

Pobieranie próbek biologicznych do porównawczego prospektywnego badania kohortowego zostanie przeprowadzone we wszystkich szpitalach współpracujących w ramach tego projektu w okresie od dwóch do trzech lat. W oparciu o wariancję i moc statystyczną zaobserwowaną w poprzednim badaniu proteomu egzosomu płynu płucnego, oszacowano 200 próbek jako minimalną liczbę do klasyfikacji próbek biologicznych. Analiza mocy statystycznej opiera się na wariancji obserwowanej w 10 próbkach, w których zidentyfikowano i oznaczono ilościowo około 3500 białek w płynach płucnych. Statystyczna analiza mocy uwzględnia poprawkę dla wielu testów zgodnie z liczbą zidentyfikowanych i oznaczonych ilościowo białek.

Specyfikacje gromadzenia danych:

Podczas konsultacji zostanie przeprowadzony wywiad kliniczny, który umożliwi zebranie danych osobowych, tj. danych genetycznych, danych dotyczących stanu zdrowia oraz pochodzenia rasowego lub etnicznego. Przeprowadzone zostanie również obiektywne badanie oceniające wagę, wzrost, ciśnienie krwi i tętno. Zbierane będą dane dotyczące wyników uzupełniających badań diagnostycznych, a mianowicie: 1. RTG klatki piersiowej (lokalizacja, zasięg i charakterystyka wysięku opłucnowego); 2. USG klatki piersiowej (lokalizacja, zasięg, charakterystyka ekostruktury – jednorodna/niejednorodna; z/bez widocznych przegród); 3. Tomografia komputerowa klatki piersiowej (lokalizacja, rozległość, aspekt morfologiczny opłucnej - pogrubienie, guzki itp.); 4. Cytologiczna ocena płynu opłucnowego; 5. Badanie biochemiczne surowicy: poziom glukozy we krwi; oznaczenie białek całkowitych i albuminy surowicy; poziom dehydrogenazy mleczanowej.

Referencyjna metoda diagnostyczna będzie oparta na ocenie histologicznej tkanki. Wyniki analizy proteomicznej uzyskane w ramach tego projektu nie będą brane pod uwagę przy ostatecznej diagnozie uczestników.

Specyfikacja pobierania i ostatecznego przeznaczenia próbek biologicznych:

Zgodnie z decyzją klinicysty płyn opłucnowy zostanie pobrany do diagnostyki (poprzez toracentezę lub w trakcie biopsji opłucnej lub pleuroskopii). Uzyskana próbka zostanie pobrana zgodnie ze zwykłą ścieżką badania klinicznego (ocena cytologiczna i/lub histopatologiczna, ocena biochemiczna, ocena mikrobiologiczna) zarejestrowaną w każdej instytucji. W przypadku pacjentów, którzy wyrażą zgodę na udział w badaniu, do badania, które proponujemy przeprowadzić, zostanie przesłana jedynie dodatkowa próbka płynu opłucnowego. Te ostatnie próbki będą przechowywane w CEDOC.

Treść informacji, które należy przekazać wolontariuszom:

Badanie, na które prosimy o Państwa zgodę, ma na celu opracowanie metody diagnostycznej o większej specyficzności i czułości w rozpoznawaniu różnych patologii związanych z nadmiernym gromadzeniem się płynu opłucnowego (stan powszechnie znany jako wysięk opłucnowy). Obecnie ocena cytologiczna, czyli obserwacja komórek, początkowej próbki płynu opłucnowego ma średnią czułość 62%, podczas gdy drugie pobranie poprzez toracentezę (polega na aspiracji płynu z opłucnej przez nakłucie opłucnej). ściany klatki piersiowej) poprawia czułość diagnozy o 10%. W niektórych przypadkach nie jest możliwe postawienie diagnozy na podstawie analizy płynu opłucnowego i z reguły zalecana jest bardziej inwazyjna metoda diagnostyczna, taka jak biopsja opłucnej lub pleuroskopia (technika chirurgiczna umożliwiająca bezpośrednie obejrzenie wnętrza klatki piersiowej) z wycięciem opłucnej biopsja (czułość 98%). Opracowanie metody diagnostycznej o większej swoistości i czułości płynu opłucnowego, unikając w ten sposób metod inwazyjnych, może poprawić skuteczność skriningu pacjentów z płynem opłucnowym, ograniczając badanie inwazyjne do wyselekcjonowanej części pacjentów z efektywnie wyższym ryzykiem patologii złośliwej . Twój udział w tym badaniu nie wiąże się z dodatkowymi procedurami poza tymi, które Twój lekarz uzna za niezbędne do zdiagnozowania choroby lub przepisania określonych leków do danego badania. Pobrane próbki zostaną zanonimizowane za pomocą kodu, co oznacza, że ​​badacze nie będą mogli dopasować próbek do danych osobowych poszczególnych pacjentów. Wszelkie zebrane dane będą poufne, zgodnie z nowym ogólnym rozporządzeniem o ochronie danych (RODO), które weszło w życie w maju 2018 r. (Rozporządzenie (UE) nr 2016/679).

INFORMACYJNA ZGODA PACJENTA:

(IMIĘ I NAZWISKO) _______________________________________, wyrażam dobrowolną zgodę na udział w projekcie badawczym pt. „Badanie kliniczne w kontekście diagnostyki pacjentów z wysiękiem opłucnowym”.

Oświadczam, że zostałem/am poinformowany/a o celach i metodologii niniejszego badania, a także o warunkach udziału, otrzymując ustne i pisemne informacje, które usłyszałem, przeczytałem i zrozumiałem.

Dokument ten został podpisany po wyjaśnieniu wszelkich wątpliwości z lekarzem prowadzącym badanie i po zastanowieniu się nad propozycją udziału w nieograniczonym czasie.

Próbki i dane zostaną zaszyfrowane, aby chronić moją tożsamość. Mogę odmówić oddania moich próbek, a nawet po wyrażeniu zgody będę mógł ją wycofać w dowolnym momencie, jeśli taka będzie moja wola. Moja decyzja w żaden sposób nie wpłynie na jakość mojej obserwacji klinicznej ani nie zmieni moich praw jako pacjenta ______________________________________________________________________ (oddział szpitalny).

W każdej chwili mogę poprosić o ogólne informacje na temat badania, do którego wykorzystywane są próbki. Nie zostanę jednak poinformowany o konkretnych wynikach uzyskanych w moich próbkach, ponieważ dane te nie są istotne dla mojej obserwacji klinicznej.

Wyrażam również zgodę na anonimowe i poufne wykorzystanie próbek biologicznych i zebranych danych w kolejnych projektach badawczych, pod warunkiem uzyskania zgody właściwej Komisji Etycznej.

Podpis Uczestnika: ______________________________________

Data: __ / __ / _____

Podpis Badacza: ____________________________________________________

Data: __ / __ / _____

Własność i ochrona danych uczestników / poufność:

Środki bezpieczeństwa w zakresie ochrony danych osobowych, które zostaną wdrożone obejmują: 1. Pseudonimizację i szyfrowanie danych osobowych; 2. Zdolność do terminowego przywrócenia dostępności i dostępu do danych osobowych w przypadku wystąpienia incydentu; 3. Proces testowania, oceny i regularnej oceny skuteczności środków technicznych i organizacyjnych zapewniających bezpieczeństwo przetwarzania danych.