Immun- og mikromiljø-Proteogenomisk profilering til klassificering af lungekræftpatienter

Den overdrevne ophobning af væske mellem membranerne, der omgiver lungen, en klinisk tilstand, der almindeligvis omtales som "pleural effusion", er forårsaget af en af ​​tre faktorer: øget produktion af pleuravæske, nedsat evne til at reabsorbere pleuravæske eller en blanding af begge.

Grundlaget for ophobning af pleuraeffusion kan stamme fra flere patologier: fra benigne og ekstrapulmonale tilstande til iboende pleurapatologi (inflammatorisk eller neoplastisk primær eller metastatisk), hvor akkumuleringen af ​​væske i pleurarummet hovedsageligt skyldes ændringer i strukturen af ​​pleura membran (tab af integritet og/eller infiltration af neoplastiske celler).

Et eksempel på ekstrapulmonære tilstande er pleural effusion observeret hos patienter med kongestiv hjerteinsufficiens, hvor der er stigning i det hydrostatiske kapillærtryk på grund af svigt af cardiocirkulationspumpen.

Forskellen mellem godartede og ondartede årsager er i øjeblikket en diagnostisk udfordring, der normalt kræver indsamling af materiale (celler nedsænket i pleuravæsken eller endda en histologisk prøve).

Det første trin i denne undersøgelse er i øjeblikket den cytologiske evaluering af pleuravæsken, det vil sige observation af celler, af en indledende prøve af pleuravæsken. Denne procedure er forbundet med en gennemsnitlig følsomhed på 62 %, mens en anden prøve gennem thoracentese forbedrer følsomheden af ​​diagnosen med 10 %. I visse tilfælde er det dog ikke muligt at stille diagnosen ved at analysere pleuravæsken, og som regel anbefales en mere invasiv diagnostisk metode, såsom pleurabiopsi (opsamlet ved punktering med en "blind" nål, ekkostyret eller beregnet tomografi guidet eller opnået ved hjælp af direkte visualisering af pleurahulen gennem pleuroskopi).

Det diagnostiske udbytte af denne tilgang kan nå op til 97% (i tilfælde af pleural biopsi opnået ved medicinsk torakoskopi). Det indebærer dog større sygelighed og større forbrug af ressourcer (materielle og menneskelige). Udviklingen af ​​en mere følsom og specifik og samtidig mindre invasiv diagnostisk metode for pleuravæske kan bidrage til en mere effektiv screening af patienter, hvilket begrænser brugen af ​​mere invasive metoder, kun for patienter med en højere risiko for malign patologi.

Studiemål:

Dette projekt består af et præklinisk studie, hvor vi vil udforske nye metoder til klinisk evaluering, baseret på proteomisk analyse af de immunologiske karakteristika og mikromiljøet af tumoren i pleuravæsken hos patienter, hvis diagnose ikke er blevet bekræftet. De opnåede resultater vil blive brugt i implementeringen af ​​en algoritme til klassificering af pleuravæske i følgende grupper: a) lav risiko eller godartet; b) høj risiko eller ondartet. Hvis algoritmen har god sensitivitet og specificitet for maligne diagnoser, kan det være nyttigt at skelne patienter ind i grupperne: a) udskyde den invasive test og udføre aktiv billeddiagnostisk overvågning; b) fortsæt til invasiv testning.

Udbytte/risikovurdering:

Opsamlingen af ​​pleuravæsken vil blive udført ved procedurer, der anvendes i standardbehandling og diagnosticering af sygdommen, og udgør således ikke yderligere risici for deltagerne. Resultaterne af denne undersøgelse medfører ikke kliniske effekter, der er direkte relevante for de involverede deltagere. Men i fremtiden kan de opnåede resultater være til gavn for andre brugere gennem forbedret forståelse af tumormikromiljøet.

Rekrutteringsmetoder:

Gennem et interview med den undersøgende læge bliver deltageren i denne undersøgelse opmærksom på vilkårene for behandlingen af ​​hans persondata inden for forskningsprojektets omfang. Derudover underskriver de registrerede informeret samtykke til deltagelse i undersøgelsen. Meddelelsen indeholder en forklaring på de procedurer, der er involveret i efterforskningen, og hvilken rolle personoplysninger indsamlet i forbindelse med undersøgelsen. I et interview med den undersøgende læge og ved at underskrive det informerede samtykke til deltagelse i undersøgelsen, bliver den registrerede opmærksom på sin ret til at trække sig fra undersøgelsen og/eller til at trække sit informerede samtykke tilbage.

Indsamlingen af ​​biologiske prøver til det sammenlignende prospektive kohortestudie vil blive udført på alle samarbejdssygehuse i dette projekt i en periode på to til tre år. Baseret på variansen og den statistiske styrke, der blev observeret i en tidligere undersøgelse af pulmonalvæskeeksosomproteomet, blev 200 prøver estimeret som minimumsantallet for klassificering af biologiske prøver. Analysen af ​​statistisk styrke er baseret på variansen observeret i 10 prøver, hvor ca. 3500 proteiner blev identificeret og kvantificeret i lungevæsker. Den statistiske effektanalyse tager højde for korrektionen for flere tests i henhold til antallet af identificerede og kvantificerede proteiner.

Dataindsamlingsspecifikationer:

Under konsultationen vil der blive gennemført en klinisk samtale, som vil muliggøre indsamling af personlige data, nemlig genetiske data, data relateret til sundhed og race eller etnisk oprindelse. Der vil også blive gennemført en objektiv undersøgelse for at vurdere vægt, højde, blodtryk og puls. Data vedrørende resultaterne af komplementære diagnostiske tests vil blive indsamlet, nemlig: 1. Røntgen af ​​thorax (placering, omfang og karakteristika af pleural effusion); 2. thorax ultralyd (placering, omfang, karakterisering af økostrukturen - homogen / heterogen; med / uden synlige skillevægge); 3. Thoracic computertomografi (placering, udstrækning, morfologisk aspekt af pleura - tykkelsesforøgelse, knuder osv.); 4. Cytologisk evaluering af pleuravæsken; 5. Serum biokemisk undersøgelse: blodsukkerniveau; assay af totale proteiner og serumalbumin; lactat dehydrogenase niveau.

Den diagnostiske referencemetode vil være baseret på histologisk vurdering af vævet. Resultaterne af den proteomiske analyse opnået i dette projekt vil ikke blive taget i betragtning ved den endelige diagnose af deltagerne.

Specifikation af indsamling og endelig destination for biologiske prøver:

Ifølge klinikerens beslutning vil der blive indhentet pleuravæske til diagnosticering (gennem thoracentese eller i løbet af pleurabiopsi eller pleuroskopi). Den opnåede prøve vil følge den sædvanlige kliniske undersøgelsesvej (cytologisk og/eller histopatologisk evaluering, biokemisk evaluering, mikrobiologisk evaluering) som registreret i hver institution. For patienter, der accepterer at deltage i undersøgelsen, vil der kun blive sendt en ekstra prøve af pleuravæske til den undersøgelse, som vi foreslår at udføre. Disse sidste prøver vil blive opbevaret hos CEDOC.

Tekst med information, der skal gives til frivillige:

Undersøgelsen, som vi beder om dit samtykke til, har til formål at udvikle en diagnostisk metode med større specificitet og følsomhed til at identificere forskellige patologier forbundet med overdreven ophobning af pleuravæske (en tilstand almindeligvis kendt som pleural effusion). I øjeblikket har den cytologiske evaluering, det vil sige observation af celler, af en indledende prøve af pleuravæsken en gennemsnitlig følsomhed på 62%, mens en anden prøvetagning gennem thoracentese (består af aspiration af væsken fra pleura gennem punktering af brystvæggen) forbedrer følsomheden af ​​diagnosen med 10 %. I visse tilfælde er det ikke muligt at diagnosticere ved at analysere pleuravæsken, og som regel anbefales en mere invasiv diagnostisk metode, såsom pleurabiopsi eller pleuroskopi (kirurgisk teknik, der giver dig mulighed for direkte at se indersiden af ​​brystkassen) med pleura biopsi (følsomhed 98%). Udviklingen af ​​en diagnostisk metode med større specificitet og følsomhed af pleuravæsken, og dermed undgå invasive metoder, kan forbedre effektiviteten i screening af patienter med pleural effusion, hvilket begrænser den invasive undersøgelse til en udvalgt del af patienter med en effektiv højere risiko for malign patologi . Din deltagelse i denne undersøgelse involverer ikke yderligere procedurer ud over dem, som din læge anser for nødvendige til diagnosticering af sygdommen eller ordination af specifikke lægemidler til den pågældende undersøgelse. De indsamlede prøver vil blive anonymiseret med en kode, det vil sige, at det ikke vil være muligt for forskerne at matche prøverne med de respektive patienters personlige data. Enhver af de indsamlede data vil være fortrolige i overensstemmelse med den nye General Data Protection Regulation (GDPR), der trådte i kraft sidste maj 2018 (Forordning (EU) nr. 2016/679).

PATIENTENS INFORMEREDE SAMTYKKE:

(NAVN) __________________________________________________, jeg accepterer frivilligt at deltage i forskningsprojektet med titlen "Klinisk undersøgelse i forbindelse med diagnosticering af patienter med pleural effusion".

Jeg erklærer, at jeg er blevet informeret om formålet med og metodologien for denne undersøgelse, samt om betingelserne for deltagelse, efter at have modtaget mundtlig og skriftlig information, som jeg har hørt, læst og forstået.

Dette dokument blev underskrevet, efter at al tvivl var afklaret med den undersøgende læge og efter at have overvejet dette forslag om deltagelse med ubegrænset tid.

Prøverne og dataene bliver krypteret for at beskytte min identitet. Jeg kan frit nægte at donere mine prøver, og selv efter at jeg har givet mit samtykke, vil jeg til enhver tid kunne trække det tilbage, hvis det er mit ønske. Min beslutning vil på ingen måde påvirke kvaliteten af ​​min kliniske opfølgning, og den vil heller ikke ændre mine rettigheder som patient på _________________________________________________________________ (hospitalsenheden).

Jeg kan til enhver tid anmode om generisk information om den undersøgelse, som prøverne bliver brugt til. Jeg vil dog ikke blive informeret om de konkrete resultater opnået i mine prøver, da disse data ikke er relevante for min kliniske opfølgning.

Jeg tillader også brugen af ​​biologiske prøver og data indsamlet, anonymt og fortroligt, i efterfølgende forskningsprojekter, forudsat at de er godkendt af den relevante etiske komité.

Deltagerens underskrift: ______________________________________

Dato: __ / __ / _____

Efterforskerens underskrift: ______________________________________

Dato: __ / __ / _____

Ejerskab og databeskyttelse af deltagere / fortrolighed:

Sikkerhedsforanstaltningerne i beskyttelsen af ​​personoplysninger, der vil blive implementeret, omfatter 1. Pseudonymisering og kryptering af personlige data; 2. Evne til at genoprette tilgængelighed og adgang til personlige data rettidigt i tilfælde af en hændelse; 3. Proces til afprøvning, vurdering og regelmæssig evaluering af effektiviteten af ​​tekniske og organisatoriske foranstaltninger for at sikre databehandlingens sikkerhed.