Immun- och mikromiljö-Proteogenomics-profilering för klassificering av lungcancerpatienter

Den överdrivna ansamlingen av vätska mellan membranen som omger lungan, ett kliniskt tillstånd som vanligtvis kallas "pleural effusion", orsakas av en av tre faktorer: ökad produktion av pleuravätska, minskad förmåga att återupptaga pleuravätska eller en blandning av båda.

Grunden för ansamling av pleurautgjutning kan härröra från flera patologier: från benigna och extrapulmonära tillstånd till inneboende pleurapatologi (inflammatorisk eller neoplastisk primär eller metastatisk) där ackumuleringen av vätska i pleurautrymmet huvudsakligen beror på förändringar i strukturen av pleura. membran (förlust av integritet och/eller infiltration av neoplastiska celler).

Ett exempel på extrapulmonära tillstånd är pleurautgjutning som observerats hos patienter med kongestiv hjärtsvikt där det finns en ökning av det hydrostatiska kapillärtrycket, på grund av fel på hjärtcirkulationspumpen.

Skillnaden mellan godartade och maligna orsaker är för närvarande en diagnostisk utmaning som vanligtvis kräver insamling av material (celler nedsänkta i pleuravätskan eller till och med ett histologiskt prov).

Det första steget i denna undersökning är för närvarande den cytologiska utvärderingen av pleuravätskan, det vill säga observation av celler, av ett initialt prov av pleuravätskan. Denna procedur är associerad med en genomsnittlig känslighet på 62 % medan ett andra prov genom thoracentes förbättrar diagnosens känslighet med 10 %. I vissa fall är det dock inte möjligt att ställa diagnos genom att analysera pleuravätskan och som regel rekommenderas en mer invasiv diagnostisk metod, såsom pleurabiopsi (uppsamlad genom punktering med en "blind" nål, ekostyrd eller beräknad tomografi guidad eller erhållen med hjälp av direkt visualisering av pleurahålan genom pleuroskopi).

Det diagnostiska utbytet av detta tillvägagångssätt kan nå upp till 97% (vid pleuralbiopsi erhållen genom medicinsk torakoskopi). Det innebär dock större sjuklighet och större förbrukning av resurser (materiella och mänskliga). Utvecklingen av en mer känslig och specifik och samtidigt mindre invasiv diagnostisk metod för pleuravätska kan bidra till en effektivare screening av patienter, vilket begränsar användningen av mer invasiva metoder, endast för patienter med högre risk för malign patologi.

Studiemål:

Detta projekt består av en preklinisk studie där vi kommer att utforska nya metoder för klinisk utvärdering, baserad på proteomisk analys av de immunologiska egenskaperna och mikromiljön av tumören i pleuravätskan hos patienter vars diagnos inte har bekräftats. De erhållna resultaten kommer att användas vid implementeringen av en algoritm för klassificering av pleuravätska i följande grupper: a) låg risk eller benign; b) hög risk eller maligna. Om algoritmen har god sensitivitet och specificitet för maligna diagnoser kan det vara användbart att särskilja patienter i grupperna: a) skjuta upp det invasiva testet och göra aktiv bildövervakning; b) fortsätt till invasiv testning.

Nytta/riskbedömning:

Uppsamlingen av pleuravätskan kommer att utföras genom procedurer som används vid standardvård och diagnos av sjukdomen, vilket innebär att de inte utgör ytterligare risker för deltagarna. Resultaten av denna undersökning ger inte kliniska effekter direkt tillämpliga på de inblandade deltagarna. Men i framtiden kan de erhållna resultaten gynna andra användare genom förbättrad förståelse av tumörens mikromiljö.

Rekryteringsmetoder:

Genom en intervju med den utredande läkaren får deltagaren i denna studie kännedom om villkoren för behandlingen av hans personuppgifter inom ramen för forskningsprojektet. Dessutom undertecknar de registrerade ett informerat samtycke för deltagande i studien. Anmälan innehåller en förklaring av de förfaranden som ingår i utredningen och vilken roll personuppgifter som samlas in i samband med utredningen. I en intervju med den utredande läkaren och genom att underteckna det informerade samtycket för deltagande i studien blir den registrerade medveten om sin rätt att dra sig ur studien och/eller att återkalla sitt informerade samtycke.

Insamlingen av biologiska prover för den jämförande prospektiva kohortstudien kommer att genomföras på alla samverkanssjukhus i detta projekt under en period av två till tre år. Baserat på variansen och den statistiska styrkan som observerats i en tidigare studie av lungvätskans exosomproteom, uppskattades 200 prover som det minsta antalet för klassificering av biologiska prover. Analysen av statistisk styrka är baserad på variansen som observerats i 10 prover där cirka 3500 proteiner identifierades och kvantifierades i lungvätskor. Den statistiska effektanalysen tar hänsyn till korrigeringen för flera tester enligt antalet identifierade och kvantifierade proteiner.

Datainsamlingsspecifikationer:

Under konsultationen kommer en klinisk intervju att genomföras, vilket kommer att möjliggöra insamling av personuppgifter, nämligen genetiska data, data relaterade till hälsa och ras eller etniskt ursprung. En objektiv undersökning kommer också att genomföras för att bedöma vikt, längd, blodtryck och hjärtfrekvens. Data som hänför sig till resultaten av kompletterande diagnostiska tester kommer att samlas in, nämligen: 1. Röntgen av bröstkorgen (placering, omfattning och egenskaper hos pleurautgjutningen); 2. ultraljud i bröstet (plats, omfattning, karakterisering av ekostrukturen - homogen / heterogen; med / utan synliga skiljeväggar); 3. Thoracic Computed Tomography (plats, omfattning, morfologisk aspekt av pleura - tjockleksökning, knölar, etc.); 4. Cytologisk utvärdering av pleuravätskan; 5. Biokemisk undersökning av serum: blodsockernivå; analys av totala proteiner och serumalbumin; nivån av laktatdehydrogenas.

Den diagnostiska referensmetoden kommer att baseras på histologisk utvärdering av vävnaden. Resultaten av proteomikanalysen som erhållits i detta projekt kommer inte att beaktas för den slutliga diagnosen av deltagarna.

Specifikation av insamling och slutdestination för biologiska prover:

Enligt läkarens beslut kommer pleuralvätska att erhållas för diagnos (genom thoracentes eller under loppet av pleuralbiopsi eller pleuroskopi). Det erhållna provet kommer att följa den vanliga kliniska undersökningsvägen (cytologisk och/eller histopatologisk utvärdering, biokemisk utvärdering, mikrobiologisk utvärdering) som registrerats vid varje institution. För patienter som går med på att delta i studien kommer endast ett extra prov av pleuralvätska att skickas till den studie som vi föreslår att genomföra. Dessa sista prover kommer att lagras på CEDOC.

Text med information som ska lämnas till volontärer:

Studien för vilken vi ber om ditt samtycke syftar till att utveckla en diagnostisk metod med större specificitet och känslighet för att identifiera olika patologier associerade med överdriven ansamling av pleuravätska (ett tillstånd som vanligtvis kallas pleurautgjutning). För närvarande har den cytologiska utvärderingen, det vill säga observation av celler, av ett initialt prov av pleuravätskan en genomsnittlig känslighet på 62% medan en andra provtagning genom thoracentes (består av aspiration av vätskan från pleura genom punktering av lungsäcken. bröstväggen) förbättrar diagnosens känslighet med 10 %. I vissa fall går det inte att ställa diagnos genom att analysera pleuravätskan och som regel rekommenderas en mer invasiv diagnostisk metod, såsom pleuralbiopsi eller pleuroskopi (kirurgisk teknik som gör att man direkt kan se insidan av bröstkorgen) med pleura biopsi (känslighet 98%). Utvecklingen av en diagnostisk metod med större specificitet och känslighet för pleuravätskan, och på så sätt undvika invasiva metoder, kan förbättra effektiviteten vid screening av patienter med pleurautgjutning, vilket begränsar den invasiva studien till en utvald del av patienter med en effektivare högre risk för malign patologi. . Ditt deltagande i denna studie innebär inte ytterligare procedurer utöver de som din läkare anser nödvändiga för diagnos av sjukdomen eller förskrivning av specifika läkemedel för studien i fråga. De insamlade proverna kommer att anonymiseras med en kod, det vill säga att det inte kommer att vara möjligt för forskarna att matcha proverna med respektive patienters personuppgifter. All data som samlas in kommer att vara konfidentiell, i enlighet med den nya allmänna dataskyddsförordningen (GDPR) som trädde i kraft i maj 2018 (förordning (EU) nr 2016/679).

PATIENTENS INFORMERADE SAMTYCKE:

(NAMN) __________________________________________________, jag går frivilligt med på att delta i forskningsprojektet med titeln "Klinisk studie i samband med diagnos av patienter med pleural effusion".

Jag förklarar att jag har fått information om målen och metodiken för denna studie, samt om villkoren för deltagande, efter att ha fått muntlig och skriftlig information som jag hört, läst och förstått.

Detta dokument undertecknades efter att alla tvivel hade klargjorts med den undersökande läkaren och efter att ha reflekterat över detta förslag om deltagande med obegränsad tid.

Proverna och data kommer att krypteras för att skydda min identitet. Jag är fri att vägra att donera mina prover och, även efter att jag har gett mitt samtycke, kommer jag att kunna dra tillbaka det när som helst om det är min önskan. Mitt beslut kommer inte på något sätt att påverka kvaliteten på min kliniska uppföljning och inte heller kommer det att förändra mina rättigheter som patient på ___________________________________________________________________ (sjukhusenheten).

Jag kan när som helst begära generisk information om studien för vilken prover används. Jag kommer dock inte att informeras om de konkreta resultaten som erhållits i mina prover, eftersom dessa data inte är relevanta för min kliniska uppföljning.

Jag godkänner också användningen av biologiska prover och data som samlats in, anonymt och konfidentiellt, i efterföljande forskningsprojekt, förutsatt att de är godkända av lämplig etikkommitté.

Deltagarens underskrift: ______________________________________

Datum: __ / __ / _____

Utredarens underskrift: ______________________________________

Datum: __ / __ / _____

Ägarskap och dataskydd för deltagare / konfidentialitet:

De säkerhetsåtgärder för skydd av personuppgifter som kommer att implementeras inkluderar 1. Pseudonymisering och kryptering av personuppgifter; 2. Förmåga att återställa tillgänglighet och tillgång till personuppgifter i rätt tid i händelse av en incident; 3. Process för att testa, utvärdera och regelbundet utvärdera effektiviteten av tekniska och organisatoriska åtgärder för att säkerställa databehandlingens säkerhet.