Imunitní a mikroprostředí proteogenomické profilování pro klasifikaci pacientů s rakovinou plic

Nadměrná akumulace tekutiny mezi membránami obklopujícími plíce, klinický stav běžně označovaný jako "pleurální výpotek", je způsobena jedním ze tří faktorů: zvýšená produkce pleurální tekutiny, snížená schopnost reabsorbovat pleurální tekutinu nebo směs obou.

Podstata akumulace pleurálního výpotku může pocházet z mnoha patologických stavů: od benigních a extrapulmonálních stavů až po vnitřní patologii pleury (zánětlivá nebo neoplastická primární nebo metastatická), při které je hromadění tekutiny v pleurálním prostoru způsobeno především změnami ve struktuře pleurální dutiny. membrána (ztráta integrity a/nebo infiltrace neoplastickými buňkami).

Příkladem mimoplicních stavů je pleurální výpotek pozorovaný u pacientů s městnavým srdečním selháním, u kterých dochází ke zvýšení hydrostatického kapilárního tlaku v důsledku selhání kardiocirkulační pumpy.

Rozlišení benigních a maligních příčin je v současnosti diagnostickou výzvou, která obvykle vyžaduje odběr materiálu (buňky ponořené do pleurální tekutiny nebo dokonce histologický vzorek).

Prvním krokem tohoto výzkumu je v současné době cytologické hodnocení pleurální tekutiny, tj. pozorování buněk, počátečního vzorku pleurální tekutiny. Tento postup je spojen s průměrnou citlivostí 62 %, zatímco druhý vzorek torakocentézou zlepšuje senzitivitu diagnózy o 10 %. V některých případech však není možné diagnostikovat analýzou pleurální tekutiny a zpravidla je doporučována invazivnější diagnostická metoda, jako je pleurální biopsie (odebíraná punkcí „slepou“ jehlou, echo vedená nebo počítaná tomografie vedená nebo získaná pomocí přímé vizualizace pleurální dutiny pomocí pleuroskopie).

Diagnostická výtěžnost tohoto přístupu může dosáhnout až 97 % (v případě pleurální biopsie získané lékařskou torakoskopií). Znamená to však větší nemocnost a větší spotřebu zdrojů (materiálních i lidských). Vývoj citlivější a specifičtější a zároveň méně invazivní diagnostické metody pro pleurální tekutinu může přispět k efektivnějšímu screeningu pacientů s omezením použití invazivnějších metod pouze u pacientů s vyšším rizikem maligní patologie.

Cíle studia:

Tento projekt se skládá z preklinické studie, kde budeme zkoumat nové metodiky klinického hodnocení založené na proteomické analýze imunologických charakteristik a mikroprostředí nádoru v pleurální tekutině pacientů, u kterých nebyla potvrzena diagnóza. Získané výsledky budou použity při implementaci algoritmu pro klasifikaci pleurální tekutiny do následujících skupin: a) nízkorizikové nebo benigní; b) vysoce rizikové nebo maligní. Pokud má algoritmus dobrou senzitivitu a specificitu pro maligní diagnózy, může být užitečné rozlišit pacienty do skupin: a) odložit invazivní test a provést aktivní zobrazovací dohled; b) přistoupit k invazivnímu testování.

Posouzení přínosů/rizik:

Odběr pleurální tekutiny bude prováděn postupy používanými při standardní péči a diagnostice onemocnění, takže nepředstavují pro účastníky další rizika. Výsledky tohoto šetření nepřinášejí klinické účinky přímo aplikovatelné na zúčastněné účastníky. V budoucnu však mohou získané výsledky prospět dalším uživatelům díky lepšímu porozumění nádorovému mikroprostředí.

Způsoby náboru:

Prostřednictvím rozhovoru s vyšetřujícím lékařem se účastník této studie seznámí s podmínkami nakládání s jeho osobními údaji v rámci výzkumného projektu. Subjekty údajů navíc podepisují informovaný souhlas s účastí ve studii. Oznámení obsahuje vysvětlení postupů spojených s vyšetřováním a úlohu osobních údajů shromážděných v souvislosti s vyšetřováním. Při rozhovoru s vyšetřujícím lékařem a podpisem informovaného souhlasu s účastí ve studii se subjekt údajů dozví o svém právu odstoupit ze studie a/nebo odvolat svůj informovaný souhlas.

Odběr biologických vzorků pro srovnávací prospektivní kohortovou studii bude proveden ve všech spolupracujících nemocnicích tohoto projektu v období dvou až tří let. Na základě rozptylu a statistické síly pozorované v předchozí studii proteomu exosomu plicní tekutiny bylo odhadnuto 200 vzorků jako minimální počet pro klasifikaci biologických vzorků. Analýza statistické síly je založena na rozptylu pozorovaném u 10 vzorků, ve kterých bylo identifikováno a kvantifikováno přibližně 3500 proteinů v plicních tekutinách. Statistická analýza síly bere v úvahu korekci pro více testů podle počtu identifikovaných a kvantifikovaných proteinů.

Specifikace sběru dat:

Při konzultaci bude proveden klinický rozhovor, který umožní sběr osobních údajů, a to genetických údajů, údajů týkajících se zdraví a rasového či etnického původu. Dále bude provedeno objektivní vyšetření k posouzení hmotnosti, výšky, krevního tlaku a srdeční frekvence. Budou shromažďována data týkající se výsledků doplňkových diagnostických testů, a to: 1. RTG hrudníku (umístění, rozsah a charakteristika pleurálního výpotku); 2. ultrazvuk hrudníku (umístění, rozsah, charakterizace ekostruktury - homogenní / heterogenní; s / bez viditelných přepážek); 3. Hrudní počítačová tomografie (umístění, rozsah, morfologický aspekt pohrudnice – zvětšení tloušťky, uzliny atd.); 4. Cytologické vyšetření pleurální tekutiny; 5. Biochemická studie séra: hladina glukózy v krvi; stanovení celkových proteinů a sérového albuminu; hladina laktátdehydrogenázy.

Referenční diagnostická metoda bude založena na histologickém hodnocení tkáně. Výsledky proteomické analýzy získané v tomto projektu nebudou brány v úvahu pro konečnou diagnózu účastníků.

Specifikace odběru a konečného určení biologických vzorků:

Podle rozhodnutí lékaře bude pro diagnostiku odebrána pleurální tekutina (pomocí torakocentézy nebo v průběhu pleurální biopsie či pleuroskopie). Získaný vzorek bude následovat obvyklou cestu klinického zkoumání (cytologické a/nebo histopatologické hodnocení, biochemické hodnocení, mikrobiologické hodnocení), jak je registrováno v každé instituci. Pacientům, kteří souhlasí s účastí ve studii, bude zaslán pouze další vzorek pleurální tekutiny pro studii, kterou navrhujeme provést. Tyto poslední vzorky budou uloženy v CEDOC.

Text informací, které mají být poskytnuty dobrovolníkům:

Cílem studie, pro kterou vás žádáme o souhlas, je vyvinout diagnostickou metodu s větší specificitou a citlivostí při identifikaci různých patologií spojených s nadměrnou akumulací pleurální tekutiny (stav běžně známý jako pleurální výpotek). V současné době má cytologické hodnocení, tedy pozorování buněk, počátečního vzorku pleurální tekutiny průměrnou citlivost 62 %, zatímco druhý odběr pomocí torakocentézy (skládá se z aspirace tekutiny z pohrudnice přes punkci pleurální tekutiny). hrudní stěna) zlepšuje citlivost diagnózy o 10 %. V některých případech není možné diagnostikovat analýzou pleurální tekutiny a zpravidla se doporučuje invazivnější diagnostická metoda, jako je pleurální biopsie nebo pleuroskopie (chirurgická technika, která umožňuje přímo zobrazit vnitřek hrudního koše) s pleurálním biopsie (citlivost 98 %). Vývoj diagnostické metody s větší specificitou a senzitivitou pleurální tekutiny, čímž se vyhneme invazivním metodám, může zlepšit efektivitu screeningu pacientů s pleurálním výpotkem a omezit invazivní studii na vybranou část pacientů s efektivně vyšším rizikem maligní patologie . Vaše účast v této studii nezahrnuje další postupy kromě těch, které váš lékař považuje za nezbytné pro diagnostiku onemocnění nebo předepisování konkrétních léků pro danou studii. Odebrané vzorky budou anonymizovány pomocí kódu, to znamená, že výzkumníci nebudou moci vzorky spárovat s osobními údaji příslušných pacientů. Veškeré shromážděné údaje budou důvěrné v souladu s novým obecným nařízením o ochraně osobních údajů (GDPR), které vstoupilo v platnost loni v květnu 2018 (nařízení (EU) č. 2016/679).

INFORMOVANÝ SOUHLAS PACIENTA:

(JMÉNO) ______________________________________________________ Dobrovolně souhlasím s účastí na výzkumném projektu s názvem „Klinická studie v kontextu diagnostiky pacientů s pleurálním výpotkem“.

Prohlašuji, že jsem byl informován o cílech a metodice této studie, jakož i o podmínkách účasti, po obdržení ústních a písemných informací, které jsem slyšel, četl a kterým jsem rozuměl.

Tento dokument byl podepsán po vyjasnění všech pochybností s vyšetřujícím lékařem a po projednání tohoto návrhu na časově neomezenou účast.

Vzorky a data budou zašifrovány, aby byla chráněna moje identita. Mohu svobodně odmítnout darování svých vzorků a i poté, co poskytnu svůj souhlas, jej budu moci kdykoli odvolat, pokud si to budu přát. Mé rozhodnutí žádným způsobem neovlivní kvalitu mého klinického sledování ani nezmění má práva jako pacienta ________________________________________________________ (nemocniční jednotka).

Kdykoli mohu požádat o obecné informace o studii, pro kterou se vzorky používají. Nebudu však informován o konkrétních výsledcích získaných v mých vzorcích, protože tyto údaje nejsou relevantní pro mé klinické sledování.

Souhlasím také s používáním biologických vzorků a údajů shromážděných, anonymně a důvěrně, v následných výzkumných projektech, pokud jsou schváleny příslušnou etickou komisí.

Podpis účastníka: _______________________________________

Datum: __ / __ / _____

Podpis vyšetřovatele: _______________________________________

Datum: __ / __ / _____

Vlastnictví a ochrana údajů účastníků / důvěrnost:

Mezi bezpečnostní opatření v ochraně osobních údajů, která budou zavedena, patří 1. Pseudonymizace a šifrování osobních údajů; 2. Schopnost obnovit dostupnost a přístup k osobním údajům včas v případě incidentu; 3. Proces testování, posuzování a pravidelného vyhodnocování účinnosti technických a organizačních opatření k zajištění bezpečnosti zpracování údajů.