Evaluering av en ny avføringsbasert qPCR for diagnose av tuberkulose hos barn og mennesker som lever med HIV (Stool4TB)

Tuberkulose (TB) fortsetter å være en ledende årsak til sykelighet og dødelighet blant barn og mennesker som lever med HIV (PLHIV). Til tross for betydelig fremgang innen TB-diagnostikk, fortsetter forbedring av TB-diagnose hos barn å være en stor utfordring og er en nøkkelpilar i WHOs «End TB Strategy». TB-laboratoriebekreftelse er spesielt utfordrende hos barn og PLHIV gitt vanskelighetene med å få sputumprøver og sykdommens pauci-basillære natur. Som en konsekvens forblir bakteriologisk bekreftelse av lunge-TB hos små barn og immunsupprimert PLHIV skuffende lav. Manglende evne til å bakteriologisk bekrefte TB, resulterer i både i) under diagnose som fører til dårligere utfall inkludert økt dødelighet og ii) over eller under diagnose, og dårlig ressursallokering. Gitt begrensningene til tilgjengelige sputumbaserte diagnostiske tester i disse sårbare populasjonene, er det behov for å utvikle nye verktøy og identifisere enkle å samle ikke-respiratoriske prøver som til sammen kan forbedre bakteriologisk bekreftelse. Foreløpige data tyder på at en ny plattform, en innovativ avføringshomogenisering og DNA-isoleringsmetode, tilfører verdi til eksisterende sputumbasert diagnostikk ved å øke frekvensen av bakteriologisk bekreftelse, og kan også være nyttig som et overvåkingsverktøy for behandlingsrespons. Denne plattformen har potensial til å bli tilpasset til en behandlingspunkt (POC) diagnostikk og dermed lett implementert i ressursbegrensede grunnleggende helsesentre.

Mål: Målet med dette prosjektet er å evaluere den diagnostiske ytelsen til den avføringsperlebaserte sanntids kvantitative PCR-plattformen (qPCR) for TB-diagnose hos barn og PLHIV. Dette vil bli evaluert i de høye tuberkulose- og HIV-byrdene i Mosambik, Eswatini og Uganda, under hypotesen om at det vil redusere det store gapet for oppdagelse av tuberkulose ved å forbedre bekreftelsesraten for tuberkulose hos barn og PLHIV, samtidig som det viser seg gjennomførbart og akseptabelt.

Hovedmål:

• Evaluer den diagnostiske nøyaktigheten til en avføringsbasert sanntids kvantitativ PCR for påvisning av DNA fra Mycobacterium tuberculosis (MTB qPCR), sammenlignet med en sammensatt referansestandard (sputum og avføring Xpert Ultra, sputumkultur og urin TB-LAM).

Sekundære mål:

• Evaluer den diagnostiske nøyaktigheten til den avføringsbaserte Mtb qPCR-en til individuelle sputum og avføring Xpert Ultra, urin LAM, sputum smear og sputum kultur (MGIT) resultater ved å bruke en konsensus klinisk kasusdefinisjon som referansestandard.
• Evaluer nytten av den kvantitative avføringsbaserte MTB qPCR-plattformen som et verktøy for å overvåke behandlingsrespons for barn og PLHIV.
• Å lage et biolager av godt karakteriserte pediatriske prøver på hvert av studiestedene for å støtte fremtidig utvikling og evaluering av ny biomarkørforskning.

Metodikk: Dette er en prospektiv diagnostisk evalueringsstudie med en nestet longitudinell kohortevaluering. I løpet av en 30-måneders rekrutteringsperiode vil personer med presumptiv tuberkulose fortløpende melde seg inn i to studiegrupper: Barn under 8 år, uavhengig av HIV-status (N=1295) og voksne som lever med HIV, uavhengig av immunologisk status ( N=650). Seksti ekstra personer vil delta som friske (asymptomatiske) kontroller. Etter klinisk, radiologisk og bakteriologisk vurdering vil tuberkulosetilfeller bli behandlet etter nasjonale retningslinjer. Deltakere diagnostisert med TB vil bli fulgt opp i 6 måneder siden behandlingsstart for å vurdere behandlingsrespons og resultater. En klinisk kasusdefinisjon vil bli etablert som en referansestandard og definert som enhver deltaker der det er tatt en beslutning om å starte ATT (TB-tilfeller vil bli klassifisert som bekreftet eller ubekreftet). Spesifikt vil barn bli klassifisert i 3 distinkte pediatriske endepunktkategorier (bekreftet TB, ubekreftet TB og Usannsynlig TB) basert på bakteriologiske, radiologiske og kliniske kriterier, i henhold til internasjonale konsensusretningslinjer.