Ocena nowego testu qPCR na podstawie kału w diagnostyce gruźlicy u dzieci i osób żyjących z HIV (Stool4TB)

Gruźlica (TB) nadal jest główną przyczyną zachorowalności i śmiertelności wśród dzieci i osób żyjących z HIV (PLHIV). Pomimo znacznych postępów w diagnostyce gruźlicy, poprawa diagnostyki gruźlicy u dzieci nadal stanowi główne wyzwanie i jest kluczowym filarem „Strategii wyeliminowania gruźlicy” WHO. Potwierdzenie laboratoryjne gruźlicy jest szczególnie trudne u dzieci i osób zakażonych wirusem HIV, biorąc pod uwagę trudność w pobraniu próbek plwociny oraz brak bakterii bakteryjnych. W konsekwencji potwierdzenie bakteriologiczne gruźlicy płuc u małych dzieci i HIV z obniżoną odpornością pozostaje rozczarowująco niskie. Niemożność bakteriologicznego potwierdzenia gruźlicy powoduje zarówno i) niedostateczną diagnozę, co prowadzi do gorszych wyników, w tym zwiększoną śmiertelność, oraz ii) zawyżoną lub niedostateczną diagnozę i złą alokację zasobów. Biorąc pod uwagę ograniczenia obecnie dostępnych testów diagnostycznych opartych na plwocinie w tych wrażliwych populacjach, istnieje potrzeba opracowania nowych narzędzi i zidentyfikowania łatwych do pobrania próbek nie pochodzących z układu oddechowego, które łącznie mogłyby poprawić potwierdzenie bakteriologiczne. Wstępne dane sugerują, że nowa platforma, innowacyjna metoda homogenizacji kału i izolacji DNA, zwiększa wartość istniejącej diagnostyki opartej na plwocinie, zwiększając odsetek potwierdzeń bakteriologicznych, a także może być przydatna jako narzędzie do monitorowania odpowiedzi na leczenie. Platforma ta może zostać dostosowana do diagnostyki w miejscu opieki (POC), a tym samym łatwo wdrożona w ograniczonych zasobach ośrodkach podstawowej opieki zdrowotnej.

Cel: Celem tego projektu jest ocena wydajności diagnostycznej platformy ilościowej PCR w czasie rzeczywistym (qPCR) opartej na kulkach kału w diagnostyce gruźlicy u dzieci i PLHIV. Zostanie to ocenione w warunkach wysokiego obciążenia gruźlicą i HIV w Mozambiku, Eswatini i Ugandzie, przy założeniu, że zmniejszy dużą lukę w wykrywaniu przypadków gruźlicy poprzez poprawę wskaźników potwierdzania gruźlicy u dzieci i osób zakażonych wirusem HIV, jednocześnie okazując się wykonalne i akceptowalne.

Podstawowy cel:

• Ocena dokładności diagnostycznej ilościowego PCR w czasie rzeczywistym w kale w celu wykrycia DNA Mycobacterium tuberculosis (MTB qPCR) w porównaniu ze złożonym standardem referencyjnym (plwocina i stolec Xpert Ultra, posiew plwociny i TB-LAM moczu).

Cele drugorzędne:

• Oceń dokładność diagnostyczną Mtb qPCR na podstawie kału w odniesieniu do poszczególnych wyników plwociny i kału Xpert Ultra, LAM moczu, rozmazu plwociny i hodowli plwociny (MGIT), stosując uzgodnioną definicję przypadku klinicznego jako standard odniesienia.
• Oceń przydatność platformy MTB qPCR opartej na analizie ilościowej kału jako narzędzia do monitorowania odpowiedzi na leczenie dzieci i osób zakażonych wirusem HIV.
• Stworzenie biorepozytorium dobrze scharakteryzowanych próbek pediatrycznych w każdym z ośrodków badawczych w celu wspierania przyszłego rozwoju i oceny nowych badań nad biomarkerami.

Metodologia: Jest to prospektywne badanie diagnostyczne z zagnieżdżoną podłużną oceną kohortową. W trakcie 30-miesięcznego okresu rekrutacji osoby z podejrzeniem gruźlicy będą kolejno rejestrowane w dwóch grupach badawczych: Dzieci poniżej 8 roku życia, niezależnie od statusu HIV (N=1295) oraz dorośli żyjący z HIV, niezależnie od statusu immunologicznego ( N=650). Sześćdziesiąt dodatkowych osób weźmie udział jako zdrowe (bezobjawowe) kontrole. Po ocenie klinicznej, radiologicznej i bakteriologicznej przypadki gruźlicy będą leczone zgodnie z krajowymi wytycznymi. Uczestnicy, u których zdiagnozowano gruźlicę, będą obserwowani przez 6 miesięcy od rozpoczęcia leczenia w celu oceny odpowiedzi na leczenie i wyników. Definicja przypadku klinicznego zostanie ustalona jako standard odniesienia i zdefiniowana jako każdy uczestnik, u którego podjęta zostanie decyzja o rozpoczęciu ATT (przypadki gruźlicy będą klasyfikowane jako potwierdzone lub niepotwierdzone). Konkretnie, dzieci zostaną sklasyfikowane w 3 odrębne pediatryczne kategorie punktów końcowych (gruźlica potwierdzona, gruźlica niepotwierdzona i gruźlica mało prawdopodobna) w oparciu o kryteria bakteriologiczne, radiologiczne i kliniczne, zgodnie z międzynarodowymi wytycznymi konsensusu.