Hodnocení nové qPCR založené na stolici pro diagnostiku tuberkulózy u dětí a lidí žijících s HIV (Stool4TB)

Tuberkulóza (TBC) je i nadále hlavní příčinou nemocnosti a úmrtnosti dětí a lidí žijících s HIV (PLHIV). Navzdory významnému pokroku v diagnostice TBC je zlepšení diagnostiky TBC u dětí i nadále velkou výzvou a je klíčovým pilířem „Strategie ukončení TBC“ WHO. Laboratorní potvrzení TBC je zvláště náročné u dětí a osob žijících s HIV vzhledem k obtížnosti získávání vzorků sputa a pauci-bacilární povaze onemocnění. V důsledku toho zůstává bakteriologické potvrzení plicní TBC u malých dětí a imunosuprimované PLHIV neuspokojivě nízké. Neschopnost bakteriologicky potvrdit TBC má za následek i) nedostatečnou diagnózu, která vede k horším výsledkům včetně zvýšené úmrtnosti, a ii) překročení nebo nedostatečné stanovení diagnózy a špatnou alokaci zdrojů. Vzhledem k omezením v současnosti dostupných diagnostických testů založených na sputu u těchto zranitelných populací je potřeba vyvinout nové nástroje a identifikovat snadno sbíratelné vzorky z jiných než dýchacích cest, které by v kombinaci mohly zlepšit bakteriologické potvrzení. Předběžné údaje naznačují, že nová platforma, inovativní metoda homogenizace stolice a izolace DNA, přidává hodnotu stávající diagnostice založené na sputu tím, že zvyšuje míru bakteriologického potvrzení, a mohla by být také užitečná jako monitorovací nástroj pro odpověď na léčbu. Tato platforma má potenciál být přizpůsobena diagnostice v místě péče (POC), a tak snadno implementovat v centrech základní zdravotní péče s omezenými zdroji.

Cíl: Cílem tohoto projektu je vyhodnotit diagnostickou výkonnost platformy pro diagnostiku TBC u dětí a PLHIV založené na real-time kvantitativní PCR (qPCR) na bázi kuliček stolice. To bude vyhodnoceno v prostředí s vysokou zátěží TBC a HIV v Mosambiku, Eswatini a Ugandě za předpokladu, že to zúží velkou mezeru v detekci případů TBC zlepšením míry potvrzení TBC u dětí a PLHIV, přičemž se to ukáže jako proveditelné a přijatelné.

Primární cíl:

• Vyhodnoťte diagnostickou přesnost kvantitativní PCR v reálném čase založené na stolici pro detekci DNA Mycobacterium tuberculosis (MTB qPCR) ve srovnání se složeným referenčním standardem (sputum a stolice Xpert Ultra, kultivace sputa a moč TB-LAM).

Sekundární cíle:

• Vyhodnoťte diagnostickou přesnost Mtb qPCR na základě stolice pro jednotlivé výsledky sputa a stolice Xpert Ultra, LAM moči, stěr ze sputa a kultivaci sputa (MGIT) pomocí konsensuální definice klinického případu jako referenčního standardu.
• Vyhodnoťte užitečnost kvantitativní platformy MTB qPCR založené na stolici jako nástroje pro monitorování léčebné odpovědi u dětí a osob s HIV.
• Vytvořit biorepozitář dobře charakterizovaných pediatrických vzorků na každém ze studijních míst pro podporu budoucího vývoje a hodnocení nového výzkumu biomarkerů.

Metodika: Jedná se o prospektivní diagnostickou evaluační studii s vnořeným longitudinálním kohortním hodnocením. Během 30měsíčního období náboru se lidé s předpokládanou TBC postupně zapíší do dvou studijních skupin: Děti mladší 8 let, bez ohledu na HIV status (N=1295) a dospělí žijící s HIV, bez ohledu na imunologický stav ( N=650). Šedesát lidí navíc se zúčastní jako zdravé (asymptomatické) kontroly. Po klinickém, radiologickém a bakteriologickém vyhodnocení budou případy TBC léčeny podle národních doporučení. Účastníci s diagnostikovanou TBC budou sledováni po dobu 6 měsíců od zahájení léčby, aby bylo možné posoudit odpověď na léčbu a její výsledky. Definice klinického případu bude stanovena jako referenční standard a definována jako každý účastník, u kterého se rozhodne o zahájení ATT (případy TBC budou klasifikovány jako potvrzené nebo nepotvrzené). Konkrétně budou děti klasifikovány do 3 odlišných kategorií pediatrických endpointů (potvrzená TBC, nepotvrzená TBC a Nepravděpodobná TBC) na základě bakteriologických, radiologických a klinických kritérií, podle mezinárodních konsenzuálních pokynů.