En utforskende studie av effekten av vismutsubsalicylat på tarmmikrobiomet og vertsrespons hos friske voksne

Eksperimentell: Intervensjonell

Den orale suspensjonsformuleringen av BSS vil bli brukt i denne studien. Det er selvadministrert med 1050 mg 4 ganger per dag (1 til 6 timers mellomrom) i 2 dager.

Legemiddel: Vismutsubsalisylat

BSS er et ofte brukt, allment tilgjengelig, OTC-medisin for en rekke gastrointestinale GI-symptomer. Den er tilgjengelig i generisk form, men også under de mer kjente merkene: Bismatrol; Diotame; Geri-Pectate; Kao-Tin; Peptisk lindring; Pepto-Bismol; Rosa vismut og magelindring. Den fikk godkjenning av US Food and Drug Administration (FDA) i 1939.

For å evaluere effekten av BSS på menneskets tarmmikrobiom.

I sammenheng med analysen av tarmmikrobiomet representerer denne målingen antall bakterielle taksoner som er signifikant forskjellige mellom de to tidspunktene (utgangspunkt og 28 dager etter BSS) basert på lesetellingene som representerer mengden av taksoner.

Vi brukte shotgun-metagenomisk sekvensering for å analysere tarmmikrobiomet. Sekvenserte lesninger ble kartlagt til en referansedatabase, og lesetellingsmengden for hvert takson ble beregnet. Statistisk analyse ble utført for å identifisere antall taksoner som er signifikant forskjellige mellom tidspunktene.

For å evaluere effekten av BSS på den menneskelige tarmmikrobiota.

Forskjell i alfa-diversitet av avføringsprøver ved Shannon-indeks ved baseline (før studiemedisinadministrering) og 28 dager etter BSS.

I sammenheng med analyse av tarmmikrobiomet representerer Shannon-indeksen et mål for alfa-diversitet (et mål for mangfoldet i et mikrobiell samfunn). Shannon-indeksen er en verdi større enn 0 der lavere verdier indikerer lavere diversitet og høyere verdier indikerer høyere diversitet, generelt mellom 1,5 og 3,5, og vanligvis < 4,5. For å evaluere endringer i tarmmikrobiomet sammenlignet vi gjennomsnittlig endring i Shannon-indeksen ved baseline og 28 dager etter BSS. Shotgun metagenomisk sekvensering ble utført, og sekvenserte lesinger ble kartlagt til en referansedatabase for å identifisere og kvantifisere unike taksoner som var tilstede i hver prøve basert på lesetelling. Statistisk analyse ble deretter brukt for å avgjøre om det var signifikante forskjeller i Shannon-indeksen mellom de to tidspunktene, noe som gir innsikt i endringer i mikrobiell diversitet etter BSS-administrering.

For å evaluere effekten av BSS på det humane tarmmikrobiomet.

Forskjell i beta-diversitet av avføringsprøver ved baseline (før studiemedisinadministrering) og 28 dager etter BSS.

Beta-diversitet refererer til variasjonen i bakteriell sammensetning mellom prøver, som vi målte ved hjelp av Bray-Curtis dissimilaritetsindeks. Bray-Curtis er et mye brukt mål for å kvantifisere beta-diversitet, som reflekterer graden av ulikhet mellom prøver, og dens verdiområde er fra 0 til 1, der 0 betyr ingen forskjeller og 1 betyr helt ulike. Denne målingen er avgjørende for å forstå endringer i den bakterielle sammensetningen over tid.

Vi brukte shotgun metagenomisk sekvensering for å analysere tarmmikrobiomet. Sekvenserte lesninger ble kartlagt til en referansedatabase, og mengden av hver takson ble beregnet. Bray-Curtis dissimilaritetsindeks ble deretter beregnet ved bruk av lesetellinger per art per prøve for å kvantifisere forskjellene i samfunnssammensetning mellom prøver ved baseline og 28 dager etter BSS-administrering.

For å evaluere effekten av BSS på menneskets tarmmetabolom.

I sammenheng med analyse av avføringsmetabolom, refererer antallet differensielt rikelige metabolitter til antallet metabolitter hvis nivåer skiller seg signifikant mellom utgangspunktet og 28 dager etter BSS. For å fastslå dette, utførte vi bredt målrettet metabolomisk profilering av avføringsprøver samlet inn ved begge tidspunktene. Metabolitter ble identifisert og kvantifisert, og signifikante endringer i rikelighet ble beregnet. Det totale antallet differensielt rikelige metabolitter gir et mål på de metabolske endringene i tarmmiljøet etter BSS-administrering.

Å evaluere effekten av BSS på den menneskelige tarmmikrobiota.

I sammenheng med tarmmikrobiomanalyse representerer denne målingen antall bakterielle taksoner som er signifikant forskjellige mellom de to tidspunktene (baseline og 2 dager etter BSS) basert på lesetellingene som representerer mengden av taksoner.

Vi brukte shotgun metagenomisk sekvensering for å analysere tarmmikrobiomet. Sekvenserte lesninger ble kartlagt til en referansedatabase, og lesetellingsmengden for hvert takson ble beregnet. Statistisk analyse ble utført for å identifisere antall taksoner som er signifikant forskjellige mellom tidspunktene.

For å evaluere effekten av BSS på det menneskelige tarmmikrobiomet.

Forskjell i alfa-diversitet i avføringsprøver målt med Shannon-indeksen ved baseline (før studiemedisinadministrasjon) og 2 dager etter BSS.

I sammenheng med tarmmikrobiomanalyse representerer Shannon-indeksen et mål for alfa-diversitet (et mål på mangfoldet i et mikrobiellt samfunn). Shannon-indeksen er en verdi større enn 0, der lavere verdier indikerer lavere diversitet og høyere verdier indikerer høyere diversitet, vanligvis mellom 1,5 og 3,5, og vanligvis < 4,5. For å evaluere endringer i tarmmikrobiomet sammenlignet vi gjennomsnittlig endring i Shannon-indeksen ved baseline og 2 dager etter BSS. Shotgun metagenomisk sekvensering ble utført, og sekvenserte reads ble kartlagt til en referansedatabase for å identifisere og telle basert på read count unike taksoner som var tilstede i hver prøve. Statistisk analyse ble deretter brukt for å avgjøre om det var signifikante forskjeller i Shannon-indeksen mellom de to tidspunktene, noe som gir innsikt i endringer i mikrobiell diversitet etter BSS-administrasjon.

Å evaluere effekten av BSS på menneskets tarmmikrobiom.

Beta-diversitet refererer til variasjonen i bakteriesammensetning mellom prøver, som vi målte ved hjelp av Bray-Curtis-dissimilaritetsindeksen. Bray-Curtis brukes til å kvantifisere beta-diversitet, og reflekterer graden av ulikhet mellom prøver. Verdien varierer fra 0 til 1, der 0 betyr ingen forskjeller og 1 betyr helt ulik. Denne målingen er avgjørende for å forstå endringer i bakteriesammensetningen over tid.

Vi brukte shotgun-metagenomisk sekvensering for å analysere tarmmikrobiomet. Sekvenserte lesninger ble kartlagt mot en referansedatabase, og mengden av hver takson ble beregnet. Bray-Curtis ble deretter beregnet ved hjelp av lesetellinger per art per prøve for å kvantifisere forskjellene i samfunnssammensetning mellom prøver ved baseline og 2 dager etter BSS-administrasjon. Bray-Curtis-ulikheter ble beregnet mellom prøver og visualisert ved hjelp av hovedkoordinatanalyse (PCoA); verdier langs den andre ordinasjonsaksen (PCoA2) ble brukt til videre analyse.

Å evaluere effekten av BSS på det menneskelige tarmsystemets metabolom.

I forbindelse med analyser av avføringsmetabolom, refererer antallet differensielt rikelige metabolitter til antallet metabolitter hvis nivåer signifikant varierer mellom baseline og 2 dager etter BSS.
For å fastslå dette, utførte vi bredt målrettet metabolomisk profilering av avføringsprøver samlet inn ved begge tidspunktene.
Metabolitter ble identifisert og kvantifisert, og signifikante endringer i rikelighet ble beregnet.
Det totale antallet differensielt rikelige metabolitter gir et mål på de metaboliske endringene i tarmmiljøet etter BSS-administrasjon.