Uno studio esplorativo sull'effetto del subsalicilato di bismuto sul microbioma intestinale e sulla risposta dell'ospite negli adulti sani

Sperimentale: Interventistico

In questo studio verrà utilizzata la formulazione in sospensione orale di BSS. È autosomministrato a 1050 mg 4 volte al giorno (da 1 a 6 ore di distanza) per 2 giorni.

Droga: Subsalicilato di bismuto

BSS è un farmaco da banco comunemente usato e ampiamente disponibile per una varietà di sintomi GI gastrointestinali. È disponibile nella forma generica, ma anche con i marchi più conosciuti: Bismatrol; Diotama; Geri-Pettato; Kao-Tin; Sollievo peptico; Pepto-Bismol; Bismuto rosa e sollievo allo stomaco. Ha ricevuto l'approvazione dalla Food and Drug Administration (FDA) statunitense nel 1939.

Valutare l'effetto di BSS sul microbioma intestinale umano.

Nel contesto dell'analisi del microbioma intestinale, questa misura rappresenta il numero di taxa batterici che sono significativamente diversi tra i due punti temporali (baseline e 28 giorni dopo BSS) in base alle conte di lettura che rappresentano l'abbondanza dei taxa.

Abbiamo utilizzato il sequenziamento metagenomico shotgun per analizzare il microbioma intestinale. Le letture sequenziate sono state mappate su un database di riferimento, e l'abbondanza di conte di lettura di ciascun taxon è stata calcolata. È stata eseguita un'analisi statistica per identificare il numero di taxa che sono significativamente diversi tra i punti temporali.

Valutare l'effetto del BSS sul microbioma intestinale umano.

Differenza della diversità alfa nei campioni di feci secondo l'indice di Shannon al basale (prima della somministrazione del farmaco in studio) e 28 giorni dopo BSS.

Nel contesto dell'analisi del microbioma intestinale, l'indice di Shannon rappresenta una misura della diversità alfa (misura della diversità di una comunità microbica). L'indice di Shannon è un valore maggiore di 0, dove valori più bassi indicano una minore diversità e valori più alti indicano una maggiore diversità, generalmente compresi tra 1,5 e 3,5, e solitamente < 4,5. Per valutare i cambiamenti nel microbioma intestinale, abbiamo confrontato la variazione media dell'indice di Shannon al basale e 28 giorni dopo BSS. È stato eseguito il sequenziamento metagenomico shotgun e le letture sequenziate sono state mappate su un database di riferimento per identificare ed enumerare, in base al conteggio delle letture, i taxa unici presenti in ciascun campione. L'analisi statistica è stata quindi utilizzata per determinare se ci fossero differenze significative nell'indice di Shannon tra i due punti temporali, fornendo informazioni sui cambiamenti nella diversità microbica dopo la somministrazione di BSS.

Valutare l'effetto di BSS sul microbioma intestinale umano.

Differenza della diversità beta nei campioni di feci al basale (prima della somministrazione del farmaco dello studio) e 28 giorni dopo BSS.

La diversità beta si riferisce alla variazione nella composizione batterica tra i campioni, che abbiamo misurato utilizzando l'indice di dissimilarità di Bray-Curtis. L'indice di Bray-Curtis è una metrica ampiamente utilizzata per quantificare la diversità beta, riflettendo il grado di dissimilarità tra i campioni, e il suo intervallo va da 0 a 1, dove 0 significa nessuna differenza e 1 significa completamente dissimili. Questa misura è essenziale per comprendere i cambiamenti nella composizione batterica nel tempo.

Abbiamo utilizzato il sequenziamento metagenomico shotgun per analizzare il microbioma intestinale. Le letture sequenziate sono state mappate su un database di riferimento, e l'abbondanza di ciascun taxon è stata calcolata. L'indice di dissimilarità di Bray-Curtis è stato quindi calcolato utilizzando i conteggi di lettura per specie per campione per quantificare le differenze nella composizione della comunità tra i campioni al basale e 28 giorni dopo la somministrazione di BSS.

Per valutare l'effetto del BSS sul metaboloma intestinale umano.

Nel contesto dell'analisi del metaboloma fecale, il numero di metaboliti differenzialmente abbondanti si riferisce al conteggio dei metaboliti i cui livelli differiscono significativamente tra la baseline e i 28 giorni post-BSS.
Per determinare ciò, abbiamo eseguito un profilo metabolomico mirato ampio sui campioni di feci raccolti in entrambi i punti temporali.
I metaboliti sono stati identificati e quantificati, e i cambiamenti significativi nell'abbondanza sono stati calcolati.
Il numero totale di metaboliti differenzialmente abbondanti fornisce una misura degli spostamenti metabolici nell'ambiente intestinale in seguito alla somministrazione di BSS.

Valutare l'effetto di BSS sul microbioma intestinale umano.

Nel contesto dell'analisi del microbioma intestinale, questa misura rappresenta il numero di taxa batterici che sono significativamente diversi tra i due punti temporali (baseline e 2 giorni post BSS) in base ai conteggi di letture che rappresentano l'abbondanza dei taxa.

Abbiamo utilizzato il sequenziamento metagenomico shotgun per analizzare il microbioma intestinale. Le letture sequenziate sono state mappate su un database di riferimento ed è stato calcolato l'abbondanza di ciascun taxon in base al conteggio delle letture. È stata eseguita un'analisi statistica per identificare il numero di taxa che sono significativamente diversi tra i punti temporali.

Valutare l'effetto del BSS sul microbioma intestinale umano.

Differenza della diversità alfa nei campioni fecali secondo l'indice di Shannon al basale (prima della somministrazione del farmaco in studio) e 2 giorni dopo BSS.

Nel contesto dell'analisi del microbioma intestinale, l'indice di Shannon rappresenta una misura della diversità alfa (misura della diversità di una comunità microbica). L'indice di Shannon è un valore maggiore di 0, con valori più bassi che indicano una minore diversità e valori più alti che indicano una maggiore diversità, generalmente compreso tra 1,5 e 3,5 e solitamente < 4,5. Per valutare i cambiamenti nel microbioma intestinale, abbiamo confrontato la variazione media dell'indice di Shannon al basale e 2 giorni dopo BSS. È stato eseguito il sequenziamento metagenomico shotgun, e le letture sequenziate sono state mappate su un database di riferimento per identificare ed enumerare, in base al conteggio delle letture, i taxa unici presenti in ciascun campione. L'analisi statistica è stata quindi utilizzata per determinare se vi fossero differenze significative nell'indice di Shannon tra i due punti temporali, fornendo informazioni sui cambiamenti nella diversità microbica dopo la somministrazione di BSS.

Valutare l'effetto del BSS sul microbioma intestinale umano.

La diversità beta si riferisce alla variazione nella composizione batterica tra i campioni, che abbiamo misurato utilizzando l'Indice di dissimilarità di Bray-Curtis. L'indice di Bray-Curtis viene utilizzato per quantificare la diversità beta, riflettendo il grado di dissimilarità tra i campioni, e il suo intervallo va da 0 a 1, dove 0 significa nessuna differenza e 1 significa completamente dissimile. Questa misura è essenziale per comprendere i cambiamenti nella composizione batterica nel tempo.

Abbiamo utilizzato il sequenziamento metagenomico shotgun per analizzare il microbioma intestinale. Le letture sequenziate sono state mappate su un database di riferimento e l'abbondanza di ciascun taxon è stata calcolata. L'indice di Bray-Curtis è stato quindi calcolato utilizzando i conteggi delle letture per specie per campione per quantificare le differenze nella composizione della comunità tra i campioni al basale e 2 giorni dopo la somministrazione di BSS. Le dissimilarità di Bray-Curtis sono state calcolate tra i campioni e visualizzate utilizzando l'analisi delle coordinate principali (PCoA); i valori lungo il secondo asse di ordinazione (PCoA2) sono stati utilizzati per le analisi successive.

Per valutare l'effetto di BSS sul metaboloma intestinale umano.

Nel contesto dell'analisi del metaboloma fecale, il numero di metaboliti differenzialmente abbondanti si riferisce al conteggio dei metaboliti i cui livelli differiscono significativamente tra il basale e i 2 giorni post-BSS. Per determinare ciò, abbiamo eseguito un profilo metabolomico mirato ampio sui campioni di feci raccolti in entrambi i punti temporali. I metaboliti sono stati identificati e quantificati, e sono stati calcolati i cambiamenti significativi nell'abbondanza. Il numero totale di metaboliti differenzialmente abbondanti fornisce una misura degli spostamenti metabolici nell'ambiente intestinale a seguito della somministrazione di BSS.