En eksplorativ undersøgelse af virkningen af ​​bismutsubsalicylat på tarmmikrobiomet og værtsrespons hos raske voksne

Eksperimentel: Interventionel

Den orale suspensionsformulering af BSS vil blive brugt i denne undersøgelse. Det er selvindgivet med 1050 mg 4 gange dagligt (1 til 6 timers mellemrum) i 2 dage.

Medicin: Bismuth subsalicylat

BSS er en almindeligt anvendt, bredt tilgængelig, OTC-medicin til en række gastrointestinale GI-symptomer. Det er tilgængeligt i generisk form, men også under de mere almindeligt kendte mærker: Bismatrol; Diotame; Geri-Pectate; Kao-Tin; Peptisk lindring; Pepto-Bismol; Pink Bismuth og Mave Relief. Det modtog godkendelse af US Food and Drug Administration (FDA) i 1939.

At evaluere effekten af BSS på den humane tarmmikrobiota.

I forbindelse med tarmmikrobiom-analyse repræsenterer denne målestok antallet af bakterielle taxaer, der er signifikant forskellige mellem de to tidspunkter (baseline og 28 dage efter BSS) baseret på læsetællingerne, der repræsenterer taxaernes forekomst.

Vi brugte shotgun-metagenomsekventering til at analysere tarmmikrobiomet. Sekventerede læsninger blev kortlagt til en referencedatabase, og læsetælleforekomsten for hver taxa blev beregnet. Statistisk analyse blev udført for at identificere antallet af taxaer, der er signifikant forskellige mellem tidspunkterne.

At evaluere effekten af BSS på det humane tarmmikrobiom.

Forskel i alfa-diversitet i afføringsprøver ved Shannon-indeks ved baseline (før studiemedicinadministration) og 28 dage efter BSS.

I forbindelse med tarmmikrobiomanalyse repræsenterer Shannon-indekset et mål for alfa-diversitet (et mål for diversiteten af et mikrobielt samfund). Shannon-indekset er en værdi større end 0, hvor lavere værdier indikerer lavere diversitet og højere værdier indikerer højere diversitet, generelt mellem 1,5 og 3,5, og normalt < 4,5. For at evaluere ændringer i tarmmikrobiomet sammenlignede vi den gennemsnitlige ændring i Shannon-indekset ved baseline og 28 dage efter BSS. Shotgun-metagenomisk sekventering blev udført, og sekventerede læsninger blev kortlagt til en referencedatabase for at identificere og tælle baseret på læsetælling unikke taxa til stede i hver prøve. Statistisk analyse blev derefter brugt til at bestemme, om der var signifikante forskelle i Shannon-indekset mellem de to tidspunkter, hvilket giver indsigt i skift i mikrobiel diversitet efter BSS-administration.

At evaluere effekten af BSS på det menneskelige tarmmikrobiom.

Forskel i beta-diversitet af afføringsprøver ved baseline (før studielægemiddeladministrering) og 28 dage efter BSS.

Beta-diversitet refererer til variationen i bakteriesammensætning mellem prøver, som vi målte ved hjælp af Bray-Curtis dissimilaritetsindekset. Bray-Curtis er en meget anvendt metrik til at kvantificere beta-diversitet, der afspejler graden af forskellighed mellem prøver, og dens interval er fra 0 til 1, hvor 0 betyder ingen forskelle og 1 betyder fuldstændig forskellighed. Denne måling er afgørende for at forstå ændringer i bakteriesammensætningen over tid.

Vi anvendte shotgun-metagenomisk sekventering til at analysere tarmens mikrobiom. Sekventerede reads blev kortlagt til en referencedatabase, og hyppigheden af hver takson blev beregnet. Bray-Curtis dissimilaritetsindekset blev derefter beregnet ved hjælp af read-tællinger pr. art pr. prøve for at kvantificere forskellene i samfundssammensætningen mellem prøver ved baseline og 28 dage efter BSS-administrering.

At evaluere effekten af BSS på det menneskelige tarmmikrobioms metabolom.

I forbindelse med analyse af afføringens metabolom refererer antallet af differentielt rigelige metabolitter til antallet af metabolitter, hvis niveauer signifikant adskiller sig mellem baseline og 28 dage efter BSS. For at bestemme dette udførte vi bred målrettet metabolomisk profilering af afføringsprøver indsamlet på begge tidspunkter. Metabolitter blev identificeret og kvantificeret, og signifikante ændringer i rigelighed blev beregnet. Det samlede antal differentielt rigelige metabolitter giver et mål for de metaboliske skift i tarmmiljøet efter BSS-administration.

At evaluere effekten af BSS på den menneskelige tarmmikrobiota.

I forbindelse med analysen af tarms mikrobiom repræsenterer denne måling antallet af bakterielle taxaer, der er signifikant forskellige mellem de to tidspunkter (baseline og 2 dage efter BSS) baseret på læsetællingerne, der repræsenterer taxaernes forekomst.

Vi brugte shotgun-metagenomsekventering til at analysere tarms mikrobiomet. Sekventerede læsninger blev kortlagt til en referencedatabase, og læsetællingsforekomsten for hver taxa blev beregnet. Statistisk analyse blev udført for at identificere antallet af taxaer, der er signifikant forskellige mellem tidspunkterne.

At evaluere effekten af BSS på den menneskelige tarmmikrobiota.

Forskel i alfa-diversitet i afføringsprøver målt med Shannon-indekset ved baseline (før studielægemiddeladministration) og 2 dage efter BSS.

I forbindelse med tarmmikrobiomanalyse repræsenterer Shannon-indekset et mål for alfa-diversitet (et mål for diversiteten af et mikrobielt samfund). Shannon-indekset er en værdi større end 0, hvor lavere værdier indikerer lavere diversitet og højere værdier indikerer højere diversitet, generelt mellem 1,5 og 3,5, og normalt < 4,5. For at evaluere ændringer i tarmmikrobiomet sammenlignede vi den gennemsnitlige ændring i Shannon-indekset ved baseline og 2 dage efter BSS. Der blev udført shotgun-metagenomsekventering, og sekventerede læsninger blev kortlagt til en referencedatabase for at identificere og tælle baseret på læsetælling af unikke taxa til stede i hver prøve. Statistisk analyse blev derefter brugt til at afgøre, om der var signifikante forskelle i Shannon-indekset mellem de to tidspunkter, hvilket giver indsigt i skift i mikrobiel diversitet efter BSS-administration.

At evaluere effekten af BSS på den menneskelige tarms mikrobiom.

Beta-diversitet refererer til variationen i den bakterielle sammensætning mellem prøver, som vi målte ved hjælp af Bray-Curtis dissimilaritetsindekset. Bray-Curtis bruges til at kvantificere beta-diversitet, hvilket afspejler graden af forskellighed mellem prøver, og dets interval er fra 0 til 1, hvor 0 betyder ingen forskelle og 1 betyder fuldstændig forskellige. Denne måling er essentiel for at forstå ændringer i den bakterielle sammensætning over tid.

Vi brugte shotgun metagenomisk sekventering til at analysere tarmmikrobiomet. Sekventerede læsninger blev kortlagt til en referencedatabase, og mængden af hver takson blev beregnet. Bray-Curtis blev derefter beregnet ved hjælp af læsetællinger pr. art pr. prøve for at kvantificere forskellene i samfundssammensætningen mellem prøver ved baseline og 2 dage efter BSS-administration. Bray-Curtis dissimilariteter blev beregnet mellem prøver og visualiseret ved hjælp af principal coordinates analyse (PCoA); værdier langs den anden ordinationsakse (PCoA2) blev brugt til nedstrømsanalyse.

At evaluere effekten af BSS på det menneskelige tarmmetabolom.

I forbindelse med analyse af afføringens metabolom refererer antallet af differentielt rigelige metabolitter til antallet af metabolitter, hvis niveauer afviger signifikant mellem baseline og 2 dage efter BSS.
For at bestemme dette udførte vi bredt målrettet metabolomisk profilering af afføringsprøver indsamlet på begge tidspunkter.
Metabolitter blev identificeret og kvantificeret, og signifikante ændringer i rigelighed blev beregnet.
Det samlede antal differentielt rigelige metabolitter giver et mål for de metaboliske skift i tarmsystemet efter BSS-administration.