Предварительное исследование влияния субсалицилата висмута на микробиом кишечника и реакцию хозяина у здоровых взрослых

Экспериментальный: Интервенционный

В этом исследовании будет использоваться пероральная суспензия BSS. Он принимается самостоятельно по 1050 мг 4 раза в день (с интервалом от 1 до 6 часов) в течение 2 дней.

Лекарство: Субсалицилат висмута

BSS является широко используемым, широко доступным безрецептурным препаратом для лечения различных желудочно-кишечных симптомов. Он доступен в непатентованной форме, а также под более известными торговыми марками: Bismatrol; диотам; гери-пектат; Као-Тин; пептическая помощь; Пепто-бисмол; Розовый висмут и облегчение желудка. Он получил одобрение Управления по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) в 1939 году.

Оценить влияние BSS на микробиом кишечника человека.

В контексте анализа микробиома кишечника эта мера представляет количество бактериальных таксонов, которые значительно различаются между двумя временными точками (исходный уровень и 28 дней после BSS) на основе количества прочтений, представляющих обилие таксонов.

Мы использовали метагеномное секвенирование дробовиком для анализа микробиома кишечника. Секвенированные прочтения были сопоставлены с эталонной базой данных, и было рассчитано обилие каждого таксона по количеству прочтений. Был проведен статистический анализ для определения количества таксонов, которые значительно различаются между временными точками.

Оценить влияние BSS на микробиом кишечника человека.

Различие альфа-разнообразия образцов стула по индексу Шеннона на исходном уровне (перед введением исследуемого препарата) и через 28 дней после BSS.

В контексте анализа микробиома кишечника индекс Шеннона представляет собой меру альфа-разнообразия (показатель разнообразия микробного сообщества). Индекс Шеннона — это значение больше 0, причём более низкие значения указывают на меньшее разнообразие, а более высокие — на большее, обычно в диапазоне от 1,5 до 3,5 и, как правило, < 4,5. Для оценки изменений в микробиоме кишечника мы сравнили среднее изменение индекса Шеннона на исходном уровне и через 28 дней после BSS. Было проведено шотган-метагеномное секвенирование, и секвенированные риды были сопоставлены с референсной базой данных для идентификации и подсчёта на основе количества ридов уникальных таксонов, присутствующих в каждом образце. Затем с помощью статистического анализа было определено, существуют ли значимые различия в индексе Шеннона между двумя временными точками, что позволило получить представление о сдвигах в микробном разнообразии после введения BSS.

Оценить влияние BSS на микробиом кишечника человека.

Различия бета-разнообразия образцов кала на исходном уровне (до введения исследуемого препарата) и через 28 дней после приема BSS.

Бета-разнообразие относится к вариациям в бактериальном составе между образцами, которые мы измерили с использованием индекса несходства Брея-Кертиса. Индекс Брея-Кертиса — это широко используемый показатель для количественной оценки бета-разнообразия, отражающий степень различия между образцами; его диапазон составляет от 0 до 1, где 0 означает отсутствие различий, а 1 — полную несхожесть. Этот показатель важен для понимания изменений в бактериальном составе с течением времени.

Мы использовали метагеномное секвенирование дробовиком для анализа микробиома кишечника. Секвенированные риды были сопоставлены с референсной базой данных, и была рассчитана численность каждого таксона. Затем индекс несходства Брея-Кертиса был рассчитан с использованием количества ридов на вид на образец для количественной оценки различий в составе сообщества между образцами на исходном уровне и через 28 дней после введения BSS.

Для оценки влияния BSS на метаболом кишечника человека.

В контексте анализа метаболома стула, количество дифференциально обильных метаболитов относится к числу метаболитов, уровни которых значительно различаются между исходным состоянием и 28 днями после приема БСС.
Для определения этого мы провели широкий таргетированный метаболомный профилирование образцов стула, собранных в оба момента времени.
Метаболиты были идентифицированы и количественно оценены, а значительные изменения в содержании были рассчитаны.
Общее количество дифференциально обильных метаболитов дает меру метаболических сдвигов в кишечной среде после введения БСС.

Оценить влияние BSS на микробиом кишечника человека.

В контексте анализа микробиома кишечника этот показатель представляет количество бактериальных таксонов, которые значительно различаются между двумя временными точками (исходный уровень и через 2 дня после BSS) на основе количества прочтений, представляющих обилие таксонов.

Мы использовали секвенирование метагенома методом дробовика для анализа микробиома кишечника. Секвенированные прочтения были сопоставлены с эталонной базой данных, и было рассчитано обилие каждого таксона по количеству прочтений. Для определения количества таксонов, которые значительно различаются между временными точками, был проведен статистический анализ.

Оценить влияние BSS на микробиом кишечника человека.

Различие альфа-разнообразия образцов стула по индексу Шеннона на исходном уровне (до введения исследуемого препарата) и через 2 дня после BSS.

В контексте анализа микробиома кишечника индекс Шеннона представляет собой меру альфа-разнообразия (измерение разнообразия микробного сообщества). Индекс Шеннона — это значение больше 0, где более низкие значения указывают на меньшее разнообразие, а более высокие — на большее разнообразие, обычно в диапазоне от 1,5 до 3,5 и, как правило, < 4,5. Для оценки изменений в микробиоме кишечника мы сравнили среднее изменение индекса Шеннона на исходном уровне и через 2 дня после BSS. Было проведено дробовидное метагеномное секвенирование, и прочтения секвенирования были сопоставлены с эталонной базой данных для идентификации и количественной оценки уникальных таксонов, присутствующих в каждом образце, на основе количества прочтений. Затем для определения наличия статистически значимых различий в индексе Шеннона между двумя временными точками был использован статистический анализ, что позволило получить представление о сдвигах в микробном разнообразии после введения BSS.

Для оценки влияния BSS на микробиом кишечника человека.

Бета-разнообразие относится к вариации бактериального состава между образцами, которую мы измерили с использованием индекса несходства Брея-Кертиса. Индекс Брея-Кертиса используется для количественной оценки бета-разнообразия, отражая степень различия между образцами, и его диапазон составляет от 0 до 1, где 0 означает отсутствие различий, а 1 означает полную несхожесть. Эта мера важна для понимания изменений в бактериальном составе с течением времени.

Мы использовали метагеномное секвенирование дробовиком для анализа микробиома кишечника. Секвенированные риды были картированы на референсную базу данных, и была рассчитана обильность каждого таксона. Затем индекс Брея-Кертиса был рассчитан с использованием количества ридов на вид на образец для количественной оценки различий в составе сообщества между образцами на исходном уровне и через 2 дня после введения BSS. Рассчитывались несходства по Брею-Кертису между образцами и визуализировались с помощью анализа главных координат (PCoA); значения вдоль второй оси упорядочивания (PCoA2) использовались для последующего анализа.

Оценить влияние BSS на метаболом кишечника человека.

В контексте анализа метаболома стула, количество дифференциально обильных метаболитов относится к числу метаболитов, уровни которых значительно различаются между исходным состоянием и 2 днями после приема БСС. Для определения этого мы провели широкое целевое метаболомное профилирование образцов стула, собранных в оба временных пункта. Метаболиты были идентифицированы и количественно определены, а значимые изменения в обилии были рассчитаны. Общее количество дифференциально обильных метаболитов дает меру метаболических сдвигов в кишечной среде после введения БСС.