Studie av molekylær analyse av gastrisk og øsofageal kreft (MAGnET)

Vevsprøver og biologiske prøver (som kan inkludere blod, avføring, spytt) fra pasienter med mistenkt/bekreftet spiserørskreft (OGC) ved The Royal Marsden NHS Foundation Trust i løpet av studieperioden vil bli samlet inn og lagret på vegne av The Royal Marsden NHS Foundation Trust. Molekylære analyser inkludert, men ikke begrenset til, miRNA-analyse, DNA- og RNA-sekvensering, nanostring, RT-PCR og immunhistokjemi vil bli utført. Avførings- og spyttprøver kan analyseres for å vurdere tilstedeværende mikrobiota. Molekylær analysedata og mikrobiotadata vil bli sammenstilt på en lenkeanonymisert måte og korrelert til kliniske utfallsdata.

Denne prospektive studien er ment å sette opp en database over pasienter behandlet både for esophageal cancer og gastrisk cancer med tilgjengelighet av kommenterte kliniske data og tumorvev pluss biologiske prøver. Denne serien vil tjene som en verdifull plattform for å analysere uttrykket til flere biomarkører av potensiell interesse. Det vil også være mulighet for å vurdere den prognostiske og prediktive rollen til identifiserte biomarkører i spesifikke pasientundergrupper og i forhold til spesifikke behandlinger. Innenfor denne studien kan vi også håpe å utvikle organoid- og pasientavledede xenograft-modeller for å representere lokalt avansert og metastatisk sykdom som vil støtte fremtidig medikamentutvikling. Vi tar sikte på å også undersøke mikrobiomet til pasienter diagnostisert med OGC. I tillegg kan denne databasen fungere som en valideringskohort for ekstern validering av funn fra andre prosjekter i OGC som er av klinisk relevans. De molekylære analyseplanene for studien vil utvikle seg etter hvert som studien skrider frem og etter hvert som nye data dukker opp som vil generere nye hypoteser å undersøke.