Studie av molekylär analys av gastrisk och esofageal cancer (MAGnET)

Vävnadsprover och biologiska prover (som kan inkludera blod, avföring, saliv) från patienter med en misstänkt/bekräftad esophagogastric cancer (OGC) på The Royal Marsden NHS Foundation Trust kommer under studieperioden att samlas in och lagras på uppdrag av The Royal Marsden NHS Stiftelsen Trust. Molekylära analyser inklusive, men inte begränsat till, miRNA-analys, DNA- och RNA-sekvensering, nanostring, RT-PCR och immunhistokemi kommer att utföras. Avförings- och salivprover kan analyseras för att bedöma den närvarande mikrobiotan. Molekylära analysdata och mikrobiotadata kommer att sammanställas på ett länkanonymiserat sätt och korreleras till kliniska resultatdata.

Denna prospektiva studie är avsedd att upprätta en databas över patienter som behandlas både för matstrupscancer och magcancer med tillgång till kommenterade kliniska data och tumörvävnad plus biologiska prover. Denna serie kommer att fungera som en värdefull plattform för att analysera uttrycket av flera biomarkörer av potentiellt intresse. Det kommer också att finnas möjlighet att bedöma den prognostiska och prediktiva rollen för identifierade biomarkörer i specifika patientundergrupper och i relation till specifika behandlingar. Inom denna studie kan vi också hoppas att utveckla organoida och patienthärledda xenograftmodeller för att representera lokalt avancerad och metastaserande sjukdom som kommer att stödja framtida läkemedelsutveckling. Vi strävar efter att även undersöka mikrobiomet hos patienter med diagnosen OGC. Dessutom kan denna databas fungera som en valideringskohort för extern validering av resultat från andra projekt inom OGC som är av klinisk relevans. De molekylära analysplanerna för studien kommer att utvecklas allt eftersom studien fortskrider och när nya data dyker upp som kommer att generera nya hypoteser att undersöka.