Genomika osobista w kardiologii prewencyjnej

Badania asocjacyjne całego genomu (GWAS) zidentyfikowały ponad 1000 SNP związanych z chorobami, w tym wiele związanych z chorobami układu krążenia (CVD). Stwierdzono powiązania dla większości tradycyjnych czynników ryzyka, w tym lipidów, ciśnienia krwi/nadciśnienia, wagi/wskaźnika masy ciała, palenia tytoniu i cukrzycy. Co ważne, GWAS zidentyfikował również warianty podatności na chorobę niedokrwienną serca/zawał mięśnia sercowego (CHD/MI), z których wiele jest niezależnych od tradycyjnych czynników ryzyka, a zatem nie można ich obecnie ocenić za pomocą środków zastępczych. Pierwszy i jak dotąd najsilniejszy z tych sygnałów został znaleziony w 9p21.3 locus i są związane z 20-40% wzrostem względnego ryzyka choroby niedokrwiennej serca wśród populacji kaukaskich i wschodnioazjatyckich. Podobnie jak większość zidentyfikowanych do tej pory asocjacji, funkcja niekodującego regionu chromosomalnego 9p21.3 pozostaje niejasna. Te markery przewidują chorobę i mogą skromnie poprawić wskaźniki reklasyfikacji. Na przykład, w bardzo niedawnym przykładzie, 13 SNP, które wcześniej zidentyfikowano w GWAS jako związane z CHD/MI, włączono do modelu multilocus, aby oszacować powiązanie wyniku ryzyka genetycznego z incydentem CHD/MI w kilku dużych badaniach prospektywnych. Nawet po uwzględnieniu wywiadu rodzinnego i tradycyjnych czynników ryzyka, osoby z górnego kwintyla miały 1,66-krotnie większe ryzyko w porównaniu z osobami z dolnego kwintyla 36. Nastąpiła znacząca poprawa w reklasyfikacji pacjentów o średnim ryzyku. Jak dotąd nie wykazano, aby stosowanie tych markerów przewyższało modele obejmujące tradycyjne czynniki ryzyka i historię rodzinną. To niedociągnięcie wynika prawdopodobnie z tego, że zdecydowana większość dziedzicznego ryzyka pozostaje nieodkryta. Podstawa tej luki w dziedziczności pozostaje niejasna, ale jest przedmiotem intensywnych badań. Pomimo luki w dziedziczności nadal możliwe jest, że zastosowanie znanych genetycznych czynników ryzyka może poprawić wyniki pacjentów. Na przykład testy genetyczne mogą poprawić przestrzeganie zaleceń przez pacjentów i zmniejszyć czynniki ryzyka mendlowskich postaci choroby wieńcowej, takich jak rodzinna hipercholesterolemia (FH). Jednak w przypadku choroby wieńcowej „odmiany ogrodowej” nigdy nie przeprowadzono badania klinicznego, które wskazywałoby, że użycie markerów genetycznych poprawia wyniki. Istnieją silne sygnały z NIH, US Preventive Services Task Force i innych niezależnych ośrodków prewencyjnych, że genetyczne badania przesiewowe będą dokładnie analizowane, dopóki takie próby nie będą istnieć. Obecnie zarówno grupa robocza Evaluation of Genomic Applications in Practice and Prevention (EGAPP), jak i ACC/AHA Taskforce on Practice Guidelines odradzają wykonywanie badań genetycznych w kierunku choroby wieńcowej39,40, ponieważ nie ma danych z badań klinicznych potwierdzających ich stosowanie. Pomimo tych zaleceń i braku danych dotyczących skuteczności, istnieje ogromna presja finansowa, aby zwiększyć liczbę testów genetycznych przeprowadzanych przez firmy „bezpośrednio do konsumenta”. W tym kontekście istnieje doskonała okazja do opracowania dobrze zaprojektowanych badań klinicznych w celu przetestowania tych wariantów.