Charakterystyka izolatów Escherichia coli z dolnych dróg oddechowych u wentylowanych mechanicznie pacjentów intensywnej terapii (COLOCOLI)
Charakterystyka izolatów Escherichia coli z dolnych dróg oddechowych kolonizujących i infekujących wentylowanych mechanicznie pacjentów intensywnej terapii: francuska wieloośrodkowa kolekcja prospektywna
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Szczegółowy opis
Prospektywne, obserwacyjne, wieloośrodkowe badanie przeprowadzone na 14 oddziałach intensywnej terapii we Francji w celu zebrania bakterii Escherichia coli (E. coli) izolaty pochodzące od pacjentów oddziałów intensywnej terapii (OIOM) wentylowanych mechanicznie; w celu scharakteryzowania fenotypu i genotypu szczepów E. coli pobranych z dolnych dróg oddechowych wentylowanych pacjentów. Wszystkie izolaty E. coli zidentyfikowane w laboratorium mikrobiologicznym i pobrane z próbki płuc (aspirat z tchawicy, popłuczyny oskrzelowo-pęcherzykowe lub zatkany teleskopowo cewnik) pochodzące od pacjenta OIOM będą przechowywane i przechowywane w temperaturze -80°C we wlewie mózgowo-sercowym bulion zawierający glicerol 20 %. Zostaną one następnie scentralizowane w jednostce badawczej badaczy do dalszej analizy, która obejmuje określenie wrażliwości na środki przeciwdrobnoustrojowe, filotypu E. coli, typu O i zawartości genów czynnika wirulencji.
Izolaty te zostaną porównane z tymi z dwóch wcześniej opublikowanych kolekcji, jednej ze stolca osób ze społeczności, uważanych za szczepy komensalne, a drugiej z krwi pacjentów z bakteriemią.
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Zapisy
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- dorosły, przyjęty na oddział intensywnej terapii
- przy inwazyjnej wentylacji mechanicznej
- obecność Escherichia coli w próbce z dolnych dróg oddechowych
Kryteria wyłączenia:
-
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
określenie grupy filogenetycznej
Ramy czasowe: 50 minut
|
Metodą reakcji łańcuchowej polimerazy quadruplex (PCR) zastosowano metodę określenia grupy filogenetycznej E. coli (A, B1, B2, C, D, E, F), czyli kladu I Escherichia należącego do
|
50 minut
|
Miary wyników drugorzędnych
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Oznaczanie typu O
Ramy czasowe: 50 minut
|
metoda łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR) została wykorzystana do poszukiwania najbardziej oczekiwanych serotypów w zakażeniach pozajelitowych: O1, O2a, O2b, O4, O6, O7, O12, O15, O16, O17, O18, O22, O25a, O25b, O45a, O75, O78
|
50 minut
|
|
oznaczanie zawartości genów czynnika wirulencji (VF).
Ramy czasowe: 90 minut
|
Multipleks PCR zastosowano do wykrycia genów kodujących jedenaście często spotykanych VF pozajelitowych (fimbrie S i F (sfa/foc), pilusy związane z odmiedniczkowym zapaleniem nerek (papC), adhezynę P (papGII, papGIII), receptor wychwytu yersiniabaktyny żelaza (fyuA), transport żelaza (iroN), aerobaktyna (aer), białko przenoszenia koniugalnego (traT), białko 2-epimerazy N-acetyloglukozaminy (neuC), hemolizyna (hlyC) i cytotoksyczny czynnik martwicy 1 (cnf1)
|
90 minut
|
|
oznaczanie wrażliwości na środki przeciwdrobnoustrojowe
Ramy czasowe: 24 godziny
|
Wrażliwość każdego izolatu na środki przeciwdrobnoustrojowe określono metodą dyfuzyjno-krążkową według Francuskiego Towarzystwa Mikrobiologicznego.
Wynik oporności zdefiniowano jako sumę nieaktywnych środków przeciwdrobnoustrojowych in vitro dla każdego izolatu
|
24 godziny
|
|
obecność beta-laktamazy
Ramy czasowe: 90 minut
|
Wykrywanie sekwencji genów kodujących enzymy CTX-M i TEM przeprowadzono metodą PCR z genomowym DNA
|
90 minut
|
Inne miary wyników
Inne miary wyników
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
grupa filogenetyczna należąca do innych istniejących kolekcji Escherichia coli
Ramy czasowe: 24 godziny
|
porównanie grup filogenetycznych obecnych izolatów z dwoma wcześniej opublikowanymi kolekcjami, pochodzącymi z okolic Paryża, Francja; jeden, który zawiera 280 szczepów E. coli wyizolowanych z kału dorosłych osobników społecznych w 2010 r. („COLIVILLE”) i który można uznać za szczepy komensalne, a drugi zawiera 373 szczepy E. coli wyizolowane z krwi 373 pacjentów hospitalizowanych w siedem różnych szpitali, w przebiegu bakteriemii w 2005 roku (badanie COLIBAFI)
|
24 godziny
|
|
Dystrybucja typu O w innych istniejących kolekcjach Escherichia coli
Ramy czasowe: 24 godziny
|
porównanie rozmieszczenia typu O obecnych izolatów z rozmieszczeniem dwóch wcześniej opublikowanych kolekcji, pochodzących z okolic Paryża, Francja; jeden, który zawiera 280 szczepów E. coli wyizolowanych z kału dorosłych osobników społecznych w 2010 r. („COLIVILLE”) i który można uznać za szczepy komensalne, a drugi zawiera 373 szczepy E. coli wyizolowane z krwi 373 pacjentów hospitalizowanych w siedem różnych szpitali, w przebiegu bakteriemii w 2005 roku (badanie COLIBAFI)
|
24 godziny
|
|
zawartość genów czynnika wirulencji (VF) w innych istniejących kolekcjach Escherichia coli
Ramy czasowe: 24 godziny
|
porównanie zawartości genu czynnika wirulencji (VF) obecnych izolatów z zawartością dwóch wcześniej opublikowanych kolekcji, pochodzących z rejonu Paryża, Francja; jeden, który zawiera 280 szczepów E. coli wyizolowanych z kału dorosłych osobników społecznych w 2010 r. („COLIVILLE”) i który można uznać za szczepy komensalne, a drugi zawiera 373 szczepy E. coli wyizolowane z krwi 373 pacjentów hospitalizowanych w siedem różnych szpitali, w przebiegu bakteriemii w 2005 roku (badanie COLIBAFI)
|
24 godziny
|
|
grupa filogenetyczna należąca do izolatów E. coli odpowiedzialnych za zapalenie płuc oraz odpowiedzialnych za prostą kolonizację
Ramy czasowe: średni przedział czasowy wynosi 11,5 dnia, a maksymalnie 35 dni
|
porównanie grupy filogenetycznej przynależności izolatów odpowiedzialnych za zapalenie płuc i tych za prostą kolonizację
|
średni przedział czasowy wynosi 11,5 dnia, a maksymalnie 35 dni
|
|
Dystrybucja typu O w izolatach E. coli odpowiedzialnych za zapalenie płuc iw tych odpowiedzialnych za prostą kolonizację
Ramy czasowe: średni przedział czasowy wynosi 11,5 dnia, a maksymalnie 35 dni
|
porównanie rozkładu typu O między izolatami odpowiedzialnymi za zapalenie płuc i tymi za prostą kolonizację
|
średni przedział czasowy wynosi 11,5 dnia, a maksymalnie 35 dni
|
|
zawartość genu czynnika wirulencji (VF) w izolatach E. coli odpowiedzialnych za zapalenie płuc oraz w tych odpowiedzialnych za prostą kolonizację
Ramy czasowe: średni przedział czasowy wynosi 11,5 dnia, a maksymalnie 35 dni
|
porównanie zawartości genu czynnika wirulencji (VF) między izolatami odpowiedzialnymi za zapalenie płuc i tymi za prostą kolonizację
|
średni przedział czasowy wynosi 11,5 dnia, a maksymalnie 35 dni
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Messika J, Magdoud F, Clermont O, Margetis D, Gaudry S, Roux D, Branger C, Dreyfuss D, Denamur E, Ricard JD. Pathophysiology of Escherichia coli ventilator-associated pneumonia: implication of highly virulent extraintestinal pathogenic strains. Intensive Care Med. 2012 Dec;38(12):2007-16. doi: 10.1007/s00134-012-2699-5. Epub 2012 Sep 28.
- Dufour N, Clermont O, La Combe B, Messika J, Dion S, Khanna V, Denamur E, Ricard JD, Debarbieux L; ColoColi group. Bacteriophage LM33_P1, a fast-acting weapon against the pandemic ST131-O25b:H4 Escherichia coli clonal complex. J Antimicrob Chemother. 2016 Nov;71(11):3072-3080. doi: 10.1093/jac/dkw253. Epub 2016 Jul 7.
- Massot M, Daubie AS, Clermont O, Jaureguy F, Couffignal C, Dahbi G, Mora A, Blanco J, Branger C, Mentre F, Eddi A, Picard B, Denamur E, The Coliville Group. Phylogenetic, virulence and antibiotic resistance characteristics of commensal strain populations of Escherichia coli from community subjects in the Paris area in 2010 and evolution over 30 years. Microbiology (Reading). 2016 Apr;162(4):642-650. doi: 10.1099/mic.0.000242. Epub 2016 Jan 28.
- Lefort A, Panhard X, Clermont O, Woerther PL, Branger C, Mentre F, Fantin B, Wolff M, Denamur E; COLIBAFI Group. Host factors and portal of entry outweigh bacterial determinants to predict the severity of Escherichia coli bacteremia. J Clin Microbiol. 2011 Mar;49(3):777-83. doi: 10.1128/JCM.01902-10. Epub 2010 Dec 22.
- Royer G, Poirel L, La Combe B, Clermont O, Chau F, Mercier-Darty M, Denamur E, Nordmann P, Ricard JD, Decousser JW. Lack of association between colistin resistance and chlorhexidine reduced susceptibility in clinical isolates of Escherichia coli. J Antimicrob Chemother. 2021 Sep 15;76(10):2736-2737. doi: 10.1093/jac/dkab235. No abstract available.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (RZECZYWISTY)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (RZECZYWISTY)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (RZECZYWISTY)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (RZECZYWISTY)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (RZECZYWISTY)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Procesy patologiczne
- Infekcje
- Infekcje dróg oddechowych
- Choroby Układu Oddechowego
- Choroby płuc
- Atrybuty choroby
- Oznaki i objawy, układ pokarmowy
- Zakażenia bakteriami Gram-ujemnymi
- Infekcje bakteryjne
- Infekcje bakteryjne i grzybice
- Zakażenie krzyżowe
- Choroba jatrogenna
- Zakażenia Enterobacteriaceae
- Zapalenie płuc związane z opieką zdrowotną
- Zapalenie płuc
- Biegunka
- Zapalenie płuc związane z respiratorem
- Zakażenia Escherichia coli
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- HLM_JDR8
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .
Badania kliniczne na Szpitalne zapalenie płuc
-
NCT06841731RekrutacyjnyPneumonia bakteryjna na chazmu szpitalnym (HABP) | Bakteryjne zapalenie płuc związane z respiratorem (VABP)
-
NCT01761487NieznanyNosiciele opornego na karbapenemy Klebsiella Pneumonia
-
NCT07129174RekrutacyjnyRespiratorowe zapalenie płuc (VAP) | Dysbioza mikrobiomu | Pacjenci Oddziału Intensywnej Terapii (OIOM).
-
NCT07089186RekrutacyjnyPowikłane zakażenie w obrębie jamy brzusznej (cIAI) | Powikłane zakażenie dróg moczowych (cUTI) | Infekcja krwi (BSI) | Pneumonia bakteryjna na chazmu szpitalnym (HABP) | Bakteryjne zapalenie płuc związane z respiratorem (VABP)
-
NCT07109791RekrutacyjnyDysplazja oskrzelowo-płucna (BPD) | Pneumonia związana z respiratorem (VAP), noworodka | Organizmy oporne na antybiotyki (AROS) | Zakażenie związane z opieką zdrowotną (HAI)