Genomika stanów zapalnych i miażdżyca - pomocnicza dla CARDIA

TŁO:

Miażdżyca jest głównym wyznacznikiem choroby niedokrwiennej serca i jest określana przez wzajemne oddziaływanie genetycznych i środowiskowych czynników ryzyka. Chociaż miażdżyca ma tendencję do gromadzenia się w rodzinach, nie wykazuje klasycznej segregacji mendlowskiej. Zatem geny, które określają ryzyko miażdżycy u danej osoby, prawdopodobnie obejmują wiele miejsc w genach i interakcje między genami, z których wszystkie definiują ryzyko genetyczne, które jest modyfikowane przez środowisko gospodarza.

NARRACJA PROJEKTOWA:

Badanie epidemiologii genetycznej bada powiązania powszechnej zmienności genów zapalenia/zakrzepicy z pośrednimi fenotypami ilościowymi i subkliniczną miażdżycą tętnic wieńcowych w badaniu rozwoju czynników ryzyka tętnic wieńcowych u młodych dorosłych (CARDIA), dużym, dwurasowym badaniu kohortowym. Zestaw 25 genów kandydujących obejmuje szlaki (cytokiny, chemokiny i ich receptory, cząsteczki adhezji komórkowej oraz białka krzepnięcia) i obejmuje kilka par receptor-ligand. Wykorzystując analizę kladystyczną i zasoby Programu w Zastosowaniach Genomicznych (PGA), badacze zidentyfikują ograniczony zestaw polimorfizmów pojedynczych nukleotydów (zakres 3-10 SNP na gen), które charakteryzują wspólne haplotypy w tych genach kandydujących u osób pochodzenia afrykańskiego i Europejskie pochodzenie. DNA z badania CARDIA Year 10 (n = 3950 osób) zostanie genotypowane pod kątem wybranych wariantów, które charakteryzują wspólne haplotypy. Dane dotyczące występowania wspólnych wariantów i haplotypów zostaną włączone do bazy danych badania CARDIA. Wcześniej określono poziomy dwóch ważnych fenotypów pośrednich, fibrynogenu i białka C-reaktywnego (CRP). Nieinwazyjną ocenę miażdżycy naczyń wieńcowych, definiowaną jako obecność zwapnień tętnic wieńcowych (CAC), uzyskano u uczestników badania CARDIA na egzaminie z roku 15. Analizy zostaną podzielone według rasy/pochodzenia etnicznego i skupią się na powiązaniach typowych haplotypów z fibrynogenem, CRP i CAC mierzonymi we wczesnej dorosłości. Po drugie, badacze zbadają możliwe interakcje gen-gen i gen-środowisko. Proponowana wielodyscyplinarna współpraca powinna zwiększyć czułość i specyficzność wysiłków zmierzających do oceny powiązań między wspólną zmiennością zestawów genów kandydujących na zapalenie/zakrzepicę a ryzykiem sercowo-naczyniowym u młodych dorosłych.