Ontstekingsgenomica en atherosclerose - Ondergeschikt aan CARDIA

ACHTERGROND:

Atherosclerose is een belangrijke determinant van coronaire hartziekte en wordt bepaald door het samenspel van genetische en omgevingsrisicofactoren. Hoewel atherosclerose de neiging heeft om in families te aggregeren, vertoont het geen klassieke Mendeliaanse segregatie. De genen die het risico op atherosclerose van een individu bepalen, hebben dus waarschijnlijk betrekking op meerdere plaatsen binnen genen en interacties tussen genen, die allemaal een genetisch risico definiëren dat wordt gewijzigd door de gastheeromgeving.

ONTWERP VERHAAL:

De genetische epidemiologische studie onderzoekt de associaties van algemene variatie in ontstekings-/trombosegenen met tussenliggende kwantitatieve fenotypes en subklinische coronaire atherosclerose in de Coronary Artery Risk Factor Development in Young Adults (CARDIA) Study, een grote, bi-raciale cohortstudie. De set van 25 kandidaatgenen omvat routes (cytokines, chemokines en hun receptoren; cellulaire adhesiemoleculen; en stollingseiwitten) en omvat verschillende receptor-ligandparen. Met behulp van cladistische analyse en de middelen van het Program in Genomic Applications (PGA), zullen de onderzoekers een beperkte set van single-nucleotide polymorfismen identificeren (bereik 3-10 SNP's per gen) die kenmerkend zijn voor veelvoorkomende haplotypes in deze kandidaatgenen bij personen van Afrikaanse afkomst en Europese afkomst. DNA van het CARDIA Year 10-onderzoek (n = 3.950 proefpersonen) zal worden gegenotypeerd voor de geselecteerde varianten die kenmerkend zijn voor de algemene haplotypes. Gegevens over de aanwezigheid van veel voorkomende varianten en haplotypes zullen worden opgenomen in de CARDIA Study-database. Niveaus van twee belangrijke intermediaire fenotypes, fibrinogeen en C-reactief proteïne (CRP) werden eerder bepaald. Niet-invasieve beoordeling van coronaire atherosclerose, gedefinieerd als de aanwezigheid van verkalking van de kransslagader (CAC), werd verkregen bij CARDIA-deelnemers tijdens het jaar 15-examen. Analyses zullen worden gestratificeerd naar ras/etniciteit en zich richten op de associaties van de gebruikelijke haplotypes met fibrinogeen, CRP en CAC gemeten in het vroege volwassen leven. Ten tweede zullen de onderzoekers mogelijke gen-gen- en gen-omgevingsinteracties onderzoeken. De voorgestelde multidisciplinaire samenwerking zou de sensitiviteit en specificiteit moeten verbeteren van de inspanningen om de associaties van gemeenschappelijke variatie in sets van ontstekings-/trombose-kandidaatgenen en cardiovasculair risico bij jonge volwassenen te beoordelen.