Inflammationsgenomik och ateroskleros – underordnad CARDIA

BAKGRUND:

Åderförkalkning är en viktig faktor för kranskärlssjukdom och bestäms av samspelet mellan genetiska och miljömässiga riskfaktorer. Även om ateroskleros tenderar att samlas i familjer, uppvisar den inte klassisk mendelsk segregation. Således involverar generna som bestämmer en individs risk för åderförkalkning sannolikt flera platser inom gener och interaktioner mellan gener, som alla definierar en genetisk risk som modifieras av värdmiljön.

DESIGNBERÄTTELSE:

Den genetiska epidemiologiska studien undersöker sambanden mellan vanlig variation i inflammations-/trombosgener med intermediära kvantitativa fenotyper och subklinisk koronar ateroskleros i Coronary Artery Risk Factor Development in Young Adults (CARDIA) Study, en stor, bi-racial kohortstudie. Uppsättningen av 25 kandidatgener involverar vägar (cytokiner, kemokiner och deras receptorer; cellulära adhesionsmolekyler; och koagulationsproteiner) och inkluderar flera receptor-ligandpar. Med hjälp av kladistisk analys och resurserna från programmet i genomiska applikationer (PGA), kommer forskarna att identifiera en begränsad uppsättning enstaka nukleotidpolymorfier (intervall 3-10 SNP per gen) som karaktäriserar vanliga haplotyper i dessa kandidatgener hos personer av afrikansk härkomst och Europeisk härkomst. DNA från CARDIA År 10-undersökningen (n = 3 950 försökspersoner) kommer att genotypas för de utvalda varianterna som karakteriserar de vanliga haplotyperna. Data om förekomsten av vanliga varianter och haplotyper kommer att införlivas i CARDIA-studiedatabasen. Nivåer av två viktiga intermediära fenotyper, fibrinogen och C-reaktivt protein (CRP) bestämdes tidigare. Icke-invasiv bedömning av koronar ateroskleros, definierad som förekomsten av kranskärlsförkalkning (CAC), erhölls på CARDIA-deltagare vid års 15-examen. Analyserna kommer att stratifieras efter ras/etnicitet och fokusera på associationerna mellan de vanliga haplotyperna och fibrinogen, CRP och CAC mätt i tidig vuxen ålder. Sekundärt kommer utredarna att utforska möjliga gen-gen- och gen-miljö-interaktioner. Det föreslagna tvärvetenskapliga samarbetet bör öka känsligheten och specificiteten i ansträngningarna för att bedöma sambanden mellan vanlig variation i uppsättningar av inflammation/trombos-kandidatgener och kardiovaskulär risk hos unga vuxna.