Genetyczny model predykcyjny oparty na polimorfizmie pojedynczego nukleotydu w szlaku naprawy DNA oraz farmakogenetyce metabolizmu/transportu leków w przewidywaniu odpowiedzi i wyników leczenia ostrej białaczki szpikowej

Głównym składnikiem w leczeniu ostrej białaczki szpikowej (AML) jest antracyklina (taka jak daunorubicyna lub idarubicyna) i cytarabina. Zmienność międzyosobnicza transportu/metabolizmu środka chemioterapeutycznego i kilka szlaków genetycznych zaangażowanych w działanie leku może wiązać się z różną odpowiedzią po leczeniu AML, które zwykle składało się z chemioterapii i/lub przeszczepu. Jednym z potencjalnych szlaków zaangażowanych w działanie leku jest szlak naprawy DNA, zatem polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNP) w szlaku maszynerii naprawy DNA mogą być markerem predykcyjnym wyników terapii w AML.

W maszynerię naprawy DNA zaangażowanych było kilka genów, którymi są: 1) Szlak łączenia niehomologicznych końców (NHEJ) zaangażowany w fazę G1/S, 2) Szlak homologicznej naprawy rekombinacyjnej (HRR) zaangażowany w fazę S/G2. XRCC4, LIG4, MRN i ATM są dobrze znanymi genami zaangażowanymi w szlak NHEJ, podczas gdy wiadomo, że MRE11, RAD50, NBS1 (MRN), RAD51, XRCC2, XRCC3, RAD51B, RAD51C, RAD 51D, RAD52 lub RAD54 są związane z HRR ścieżka.

Badanie sugerowało, że SNP w ścieżce naprawy DNA były zaangażowane w podatność na wtórną AML rozwijającą się po chemioterapii lub autologicznym przeszczepie hematopoetycznych komórek macierzystych, a zatem te markery SNP mogą stać się markerem predykcyjnym wtórnej AML. Jednak nigdy nie badano go pod kątem wielu ścieżek kandydujących jednocześnie ze stosunkowo większą liczbą pacjentów. W związku z tym obecne badanie ma na celu zbadanie potencjalnej roli markerów genotypowych w wielu ścieżkach kandydujących, zwł. koncentruje się na maszynerii naprawy DNA, w odniesieniu do odpowiedzi po chemioterapii lub przeżywalności pacjentów z AML.

W sumie ponad 500 zarchiwizowanych próbek od pacjentów, u których zdiagnozowano ostrą białaczkę szpikową w Samsung Medical Center w Seulu w Korei, zostanie uwzględnionych, a genomowe DNA zostanie wyekstrahowane i zbadane pod kątem ich genotypów kandydujących SNP zaangażowanych w szlaki naprawy DNA . Następnie prowadzona będzie analiza statystyczna dla analizy pojedynczego markera, analizy haplotypów oraz dla budowy genetycznego modelu ryzyka w oparciu o analizę wieloczynnikową.