Podawanie autologicznych komórek T zmodyfikowanych genetycznie w celu ekspresji receptorów komórek T reagujących na zmutowane lub wirusowe neoantygeny u pacjenta z rakiem z przerzutami oraz podawanie pembrolizumabu

Tło:

• Podanie autologicznych limfocytów naciekających guz (TIL) może pośredniczyć w całkowitej, trwałej regresji u 20-25% pacjentów z przerzutowym czerniakiem. Ostatnie badania wykazały, że te TIL rozpoznają głównie unikalne zmutowane lub wirusowe neoantygeny wyrażane przez raka, które nie są wspólne dla innych czerniaków.
• Podawanie masowych autologicznych TIL pacjentom z różnymi innymi nowotworami litymi, w tym rakiem przewodu pokarmowego i układu moczowo-płciowego, ma niewielki lub żaden wpływ terapeutyczny.
• Niedawne badania w National Cancer Institute Surgery Branch (NCI-SB) wykazały, że TIL z nieczerniakowych raków litych może również zawierać komórki T reagujące na nieudostępnione unikalne zmutowane neoantygeny eksprymowane w raku. Częstość występowania tych limfocytów T jest bardzo niska (często < 0,1%) i dlatego trudno jest wyizolować i wyhodować komórki T reagujące na mutacje do poziomów wymaganych do skutecznej terapii.
• U pojedynczego pacjenta z opornym na chemioterapię przerzutowym rakiem dróg żółciowych byliśmy w stanie wyhodować stosunkowo czystą populację TIL reaktywnego na neoantygen, a podawanie tych komórek pośredniczyło w prawie całkowitej regresji wszystkich przerzutów choroby trwającej obecnie 2,5 roku.
• Opracowaliśmy metody identyfikacji rzadkich komórek T reagujących na neoantygeny z typowych raków innych niż czerniak, izolowania ich receptorów komórek T (TCR) oraz inżynierii genetycznej autologicznych limfocytów krwi obwodowej (PBL) w celu ekspresji tych TCR z wysoką wydajnością. Komórki zmodyfikowane genem neoantygenu TCR mogą rozpoznawać i niszczyć autologiczne nowotwory in vitro.
• Oprócz reaktywności na neoantygeny pochodzące z mutacji niesynonimicznych, limfocyty T mogą rozpoznawać epitopy wirusa brodawczaka ludzkiego (HPV) u pacjentów z nowotworami wywołanymi przez HPV. TCR z tych reaktywnych komórek można izolować i transdukować retrowirusowo do autologicznych PBL z wysoką wydajnością. Ten protokół kliniczny będzie leczył pojedynczego pacjenta z opornym na leczenie rakiem odbytu przy użyciu adoptywnego transferu autologicznych PBL transdukowanych genami kodującymi TCR, które rozpoznają unikalne zmutowane lub wirusowe neoantygeny eksprymowane przez raka.

Cel:

-W ramach IND u jednego pacjenta, w celu leczenia pacjenta z przerzutowym rakiem płaskonabłonkowym odbytu HPV-16 z autologicznymi limfocytami krwi obwodowej (PBL), które zostały transdukowane genami kodującymi receptory limfocytów T, które rozpoznają zmutowane lub wirusowe neoantygeny w autologicznym rak.

Uprawnienia:

• Musi mieć mierzalną chorobę z przerzutami, zgodnie z kryteriami RECIST v1.1.
• Musi podpisać dokument świadomej zgody.
• Gotowość do podpisania formularza trwałego pełnomocnictwa.
• Musi mieć wszystkie zezwolenia regulacyjne przed rozpoczęciem leczenia.

Projekt:

• Ten pacjent przeszedł już resekcję lub biopsję w celu uzyskania guza do wytworzenia autologicznych hodowli TIL. Zostanie to przeprowadzone zgodnie z protokołem zbierania komórek NCI-SB 03-C-0277 (Protokoły zbierania komórek i przygotowania do zabiegu chirurgicznego Branch Adoptive Cell Therapy).
• Przeprowadzone zostanie sekwencjonowanie egzomiczne i RNA-Seq w celu zidentyfikowania mutacji ulegających ekspresji w raku pacjenta. Wiele autologicznych kultur TIL będzie hodowanych i testowanych pod kątem reaktywności wobec mutacji z autologicznego guza przy użyciu opracowanych przez nas testów, które obejmują ekspozycję autologicznych komórek prezentujących antygen na długie peptydy zawierające mutację lub tandemowe mini-geny kodujące mutację.
• Hodowle komórek T wykazujące reaktywność wobec zmutowanych i wirusowych neoantygenów zostaną zidentyfikowane, a poszczególne receptory komórek T rozpoznające neoantygeny zostaną zsyntetyzowane i wykorzystane do stworzenia supernatantów retrowirusów do transdukcji TCR do autologicznych PBL pacjenta.
• Pacjent będzie leczony cyklofosfamidem i fludarabiną bez mieloablacji, zmniejszający limfodeplecję, po czym nastąpi infuzja autologicznej transdukowanej PBL, a następnie aldesleukiny w dużych dawkach. Pacjent otrzyma również pembrolizumab w Dniu -2 przed podaniem komórek i trzy dodatkowe dawki co trzy tygodnie po infuzji komórek.
• Odpowiedź kliniczna i immunologiczna będzie oceniana około 4-6 tygodni po infuzji komórek, a następnie okresowo.