Podávání autologních T-buněk geneticky upravených k expresi T-buněčných receptorů reaktivních proti mutovaným nebo virovým neoantigenům u pacienta s metastatickým karcinomem plus podání pembrolizumabu

Pozadí:

• Podání autologních tumor-infiltrujících lymfocytů (TIL) může zprostředkovat kompletní, trvalé regrese u 20–25 % pacientů s metastatickým melanomem. Nedávné studie ukázaly, že tyto TIL převážně rozpoznávají jedinečné mutované nebo virové neoantigeny exprimované rakovinou, kterou nesdílejí jiné melanomy.
• Podání hromadného autologního TIL pacientům s řadou dalších solidních karcinomů, včetně karcinomů gastrointestinálního traktu a genitourinárního traktu, má malý, pokud vůbec nějaký, terapeutický dopad.
• Nedávné studie v National Cancer Institute Surgery Branch (NCI-SB) ukázaly, že TIL z nemelanomových pevných rakovin může také obsahovat T-buňky reaktivní proti nesdíleným jedinečným mutovaným neoantigenům exprimovaným v rakovině. Frekvence těchto T-buněk je velmi nízká (často < 0,1 %), a proto je obtížné izolovat a pěstovat mutační reaktivní T-buňky na úrovně potřebné pro účinnou terapii.
• U jediného pacienta s chemo-refrakterním metastazujícím cholangiokarcinomem jsme byli schopni vypěstovat relativně čistou populaci neoantigenně reaktivního TIL a podávání těchto buněk zprostředkovalo téměř úplnou regresi všech metastatických onemocnění, která nyní trvá 2,5 roku.
• Vyvinuli jsme přístupy k identifikaci vzácných neoantigenně reaktivních T-buněk z běžných nemelanomových rakovin, k izolaci jejich receptorů T-buněk (TCR) a ke genetickému inženýrství autologních lymfocytů periferní krve (PBL) k expresi těchto TCR s vysokou účinností. Neoantigenní TCR genem modifikované buňky mohou rozpoznat a zničit autologní rakovinu in vitro.
• Kromě reaktivity na neoantigeny odvozené z nesynonymních mutací mohou T-buňky rozpoznat epitopy lidského papilomaviru (HPV) u pacientů s rakovinou vyvolanou HPV. TCR z těchto reaktivních buněk může být izolován a retrovirově transdukován do autologních PBL s vysokou účinností. Tento klinický protokol bude léčit jediného pacienta s refrakterním análním karcinomem pomocí adoptivního přenosu autologních PBL transdukovaných geny kódujícími TCR, které rozpoznávají jedinečné mutované nebo virové neoantigeny exprimované rakovinou.

Objektivní:

- V rámci IND pro jednoho pacienta k léčbě pacienta s metastatickým karcinomem spinocelulárního análního kanálu pozitivního na HPV-16 s autologními lymfocyty periferní krve (PBL), které byly transdukovány geny kódujícími receptory T-buněk, které rozpoznávají mutované nebo virové neoantigeny v autologních rakovina.

Způsobilost:

• Musí mít měřitelné, metastatické onemocnění podle kritérií RECIST v1.1.
• Musí podepsat dokument informovaného souhlasu.
• Ochota podepsat Trvalou plnou moc.
• Před zahájením léčby musí mít všechna regulační schválení.

Design:

• Tento pacient již podstoupil resekci nebo biopsii za účelem získání nádoru pro vytvoření autologních kultur TIL. To bude provedeno podle protokolu sklizně buněk NCI-SB 03-C-0277 (Protokoly buněčné sklizně a přípravy na adoptivní buněčnou terapii chirurgické větve).
• Exomické sekvenování a RNA-Seq budou provedeny k identifikaci mutací exprimovaných v pacientově rakovině. Mnohonásobné autologní kultury TIL budou pěstovány a testovány na reaktivitu proti mutacím z autologního nádoru pomocí námi vyvinutých testů, které zahrnují expozici buněk prezentujících autologní antigen dlouhým peptidům obsahujícím mutaci nebo tandemovým minigenům kódujícím mutaci.
• Budou identifikovány kultury T lymfocytů s reaktivitou proti mutovaným a virovým neoantigenům a jednotlivé receptory T lymfocytů, které rozpoznávají neoantigeny, budou syntetizovány a použity k vytvoření retrovirových supernatantů pro transdukci TCR do pacientova autologního PBL.
• Pacient bude léčen nemyeloablativním, lymfodeplečním preparativním režimem cyklofosfamidu a fludarabinu, po kterém bude následovat infuze autologního transdukovaného PBL a poté vysoké dávky aldesleukinu. Pacient také dostane pembrolizumab v den -2 před podáním buněk a tři další dávky každé tři týdny po infuzi buněk.
• Klinická a imunologická odpověď bude hodnocena přibližně 4-6 týdnů po infuzi buněk a poté pravidelně.