Diagnostyka molekularna odrzucenia alloprzeszczepu serca przy użyciu wewnątrzprzeszczepowego ukierunkowanego profilowania ekspresji genów. (Nano-Heart)

Przeszczep serca (HTx) pozostaje najcenniejszą opcją terapeutyczną dla pacjentów ze schyłkową niewydolnością serca oporną na optymalną terapię zachowawczą. Pomimo znacznej poprawy w zakresie immunosupresji i opieki nad przeszczepami, ostre i przewlekłe uszkodzenia przeszczepów allogenicznych wywołane odrzuceniem pozostają jedną z głównych przyczyn śmiertelności i zachorowalności po przeszczepieniu serca, ograniczając w ten sposób średnią długość życia biorców. Niezaspokojoną potrzebą medyczną pozostaje poprawa ogólnego leczenia odrzucenia przeszczepu. Pierwszym krokiem jest dokładna diagnoza odrzucenia przeszczepu, która umożliwi ukierunkowanie opieki nad pacjentem i optymalizację postępowania.

Obecnie rozpoznanie odrzucenia serca opiera się wyłącznie na patologicznej ocenie biopsji endomiokardialnej (EMB), polegającej na identyfikacji i ocenie nacieków komórkowych oraz uszkodzenia mięśnia sercowego. Chociaż poczyniono istotne postępy w standaryzacji diagnozy odrzucenia, patologia pozostaje niedoskonałym złotym standardem, szczególnie ze względu na zmienność między obserwatorami, błąd próby oraz zastosowanie skal jakościowych lub półilościowych, które nadmiernie upraszczają złożone fenotypy. Dodatkowo, ciężkość choroby, stopień uszkodzenia mięśnia sercowego i etap progresji to kluczowe informacje słabo uchwycone przez obecnie działające preparaty. Wszystkie te ograniczenia stanowią główne bariery w osiągnięciu precyzyjnej i niezawodnej diagnozy odrzucenia.

W tym kontekście analiza profilowania ekspresji genów świeżych próbek mięśnia sercowego pobranych podczas biopsji pozardzeniowej i wykorzystanie podejścia całego transkryptomu pojawiła się jako potencjalne obiektywne narzędzie towarzyszące patologii w celu udoskonalenia diagnozy odrzucenia. Jednakże istotne wady ograniczają rutynowe zastosowanie kliniczne diagnostyki molekularnej opartej na całych transkryptomach, w tym błąd pobierania próbek poza rdzeniem, niską odtwarzalność, trudność techniczną i analityczną, a także koszty i powtarzalność próbek, które nie są zgodne z warunkami klinicznymi.

Najnowsze technologie mogą przezwyciężyć to ograniczenie, umożliwiając analizę tej samej tkanki wykorzystywanej do oceny histologicznej. Ukierunkowane profilowanie molekularne mające zastosowanie do biopsji endomiokardialnych utrwalonych w formalinie i zatopionych w parafinie (FFPE) może umożliwić wdrożenie diagnostyki molekularnej do rutyny klinicznej. Niedawno wykazaliśmy, że panel Banff Human Organ Transplant Panel (B-HOT), zatwierdzony przez konsorcjum panel docelowy obejmujący 770 genów, opracowany przez Grupę Roboczą ds. Diagnostyki Molekularnej Banff, dokładnie uchwycił kluczowe wzorce molekularne odrzucania za pośrednictwem przeciwciał ( AMR) w biopsjach alloprzeszczepu serca i może służyć jako wskaźnik zastępczy dla analizy opartej na całym transkryptomie.

Celem niniejszego badania jest zatem identyfikacja sygnatur ekspresji genów dla oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe i ostrego odrzucenia komórkowego w przeszczepieniu serca oraz opracowanie i walidacja systemu diagnostyki molekularnego odrzucenia serca opartego na ukierunkowanym transkryptomie jako nowatorskie narzędzie towarzyszące monitorowaniu w precyzyjnej diagnostyce alloprzeszczepów serca mające zastosowanie do FFPE-EMB.