Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Nästa generations sekvensering av normala vävnader prospektivt hos pediatriska onkologiska patienter

21 juli 2026 uppdaterad av: St. Jude Children's Research Hospital

Genom för barn (G4K)

Utvecklingen av nästa generations sekvenseringstekniker (NGS), inklusive helgenom (WGS), exome (WES) och RNA-sekvensering har revolutionerat utredarnas förmåga att fråga de molekylära mekanismerna bakom tumörbildningen. Genom Pediatric Cancer Genome Project (PCGP) har utredare vid St. Jude Children's Research Hospital (SJCRH) framgångsrikt använt NGS-metoder för att utvärdera mer än 1 000 pediatriska cancerformer, allt från hematologiska maligniteter till centrala nervsystemet (CNS) och solida tumörer utanför CNS . Från dessa och relaterade studier har det blivit tydligt att genomiska tillvägagångssätt exakt kan klassificera tumörer i distinkta patologiska och prognostiska subtyper och upptäcka förändringar i cellulära vägar som kan fungera som nya terapeutiska mål. Sammantaget tyder dessa studier på att genom att karakterisera den genomiska sammansättningen av individuella tumörer kommer utredarna att kunna utveckla personliga och potentiellt mer effektiva cancerbehandlingar och/eller förebyggande åtgärder.

Detta protokoll antogs ursprungligen för att inleda NGS tillvägagångssätt i rutinmässig klinisk vård. Under den inledande fasen av G4K-protokollet rekryterades 310 deltagare och registrerades i studien. Tumör- och/eller könslinjesekvensering fullbordades på alla 310 patienter, med 253 somatiska rapporter genererade (representerande 96 % av de 263 deltagare för vilka tumörvävnad var tillgänglig och analyserad) och 301 könslinjerapporter genererade (100 % av de 301 deltagarna som gick med på att mottagandet av könslinjeresultat). Analyser av studiedata pågår med planer på att förbereda första manuskript inom de närmaste månaderna. På grund av det framgångsrika initiala genomförandet av G4K-protokollet, erbjuds nu klinisk genomisk sekvensering av tumör- och könslinjeprover som en del av standard klinisk vård för pediatriska onkologiska patienter vid St. Jude.

G4K-protokollet har nu reviderats. Med revideringen kommer studiegruppen att registrera, lagra och analysera genomisk information om könsceller och tumörer. Genom insamlingen av dessa data kommer vi att undersöka hur könscellsmutationer i 150 cancerpredispositionsgener påverkar klinisk presentation, tumörhistologi, tumörgenomiska fynd, respons på terapi och långsiktiga resultat. De övergripande målen för denna forskning är att ytterligare definiera prevalensen, spektrumet och ärftligheten av könslinjevarianter i dessa gener och att dechiffrera hur könscellsmutationer påverkar fenotyperna hos ett växande antal cancerpredispositionssyndrom. Dessa studier tillåter oss att tillhandahålla mer exakt genetisk rådgivning och hanteringsstrategier till framtida barn som har mutationer i dessa gener.

Detta förblir en icke-terapeutisk studie. Utredarna räknar med en urvalsstorlek på cirka 5 000 patienter som kommer att rekryteras under de kommande 7 åren.

Studieöversikt

Status

Rekrytering

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljerad beskrivning

PRIMÄRA MÅL:

  • Att använda klinisk genomisk sekvensering för att definiera prevalensen och spektrumet av könscellsmutationer i cancerpredispositionsgener hos barn med cancer.
  • För dem som identifierats med mutationer i könscellerna, för att korrelera genomisk information från könsceller med klinisk presentation, tumörgenomiska fynd, behandlingssvar och resultat.

ANDRA FÖRESPECIFICERADE MÅL:

  • Att generera och analysera data som beskriver patientens/förälders uppfattningar om genomiska undersökningar och forskning vid olika tidpunkter under hela studien.
  • För att generera och analysera data kring återkomsten av genomiska sekvenseringsresultat, undersök patientens/förälders förståelse för dessa resultat och bedöm effekten av resultaten på patienter och familjer.
  • För att bestämma genomförbarheten och tillförlitligheten av att utföra WES- och RNA-sekvensering på derivat från formalinfixerade, paraffininbäddade (FFPE) tumörprover tillsammans med analysen av matchade frysta tumör- och könslinjeprover.

För deltagare som ger samtycke kommer ett normalt vävnadsprov att tas och användas för WGS-, WES- och RNA-sekvensanalys. En definierad lista med 150 gener kommer att analyseras för rapportering med hjälp av normal vävnad. När resultaten av dessa analyser är tillgängliga kommer de att avslöjas för läkare, patienter och föräldrar. Metoder med blandade mått kommer att användas för att bedöma förståelse, acceptans och påverkan av genomiska resultat på patienter och föräldrar. Under studiens gång förutser forskarna att listan över gener som ska rapporteras med normal vävnad kommer att förändras på grund av framsteg i litteraturen eller andra bevis som kopplar ytterligare gener till tumörbildning och cancerrisk, och nya listor kan komma att definieras.

För att bedöma leverantörens, patientens och familjens förståelse och beskriva effekterna av genomisk testning och återlämnande av resultat, kommer denna studie också att inkludera administration av undersökningar och semistrukturerade intervjuer. Undersökningar och intervjuer är valfria, men kommer att erbjudas till alla primära SJCRH-leverantörer, såväl som alla berättigade deltagare och föräldrar, oavsett om de samtycker till att genomföra genomisk testning eller inte.

Ett blodprov eller en hudbiopsi kommer att erhållas som en källa till könslinje-DNA. Detta prov är nödvändigt eftersom det är jämförelsen mot vilken tumörprover utvärderas. Hudbiopsier kan göras på patienter som har en diagnos där perifert blod sannolikt är förorenat av tumörceller.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Beräknad)

2500

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Studieorter

  • Förenta staterna
    • Tennessee
      • Memphis, Tennessee, Förenta staterna, 38105
        • Rekrytering
        • St. Jude Children's Research Hospital
        • Huvudutredare:
          • Kim E. Nichols, MD
        • Kontakt:

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

  • Barn
  • Vuxen
  • Äldre vuxen

Tar emot friska volontärer

Nej

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Deltagarna kommer att vara patienter på St. Jude Children's Research Hospital (SJCRH) med diagnoser av hematologiska, solida eller centrala nervsystemtumörer som samtycker till att delta i denna studie och deras föräldrar eller lagligt auktoriserade representanter som samtycker till att delta.

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • St. Jude-patienter identifierade prospektivt vid tidpunkten för studieaktivering med en diagnostiserad fast eller flytande tumör (godartad eller malign).
  • Adekvat vävnad måste finnas tillgänglig (t.ex. tillräckligt med könsceller och/eller tumörvävnad, från vilken >1 µg DNA och >0,1 µg RNA måste isoleras). Patienter som inte har någon tillgänglig tumörvävnad kan registreras med endast könslinjeprov.

Exklusions kriterier:

  • Tidigare hematopoetisk stamcellstransplantation (eller annat tillstånd som skulle resultera i att hematopoetisk cell-DNA inte matchar värdvävnads-DNA).
  • Tumör- eller könscellsvävnad som inte uppfyller kriterierna ovan.
  • Oförmåga eller ovilja hos forskningsdeltagare eller målsman/representant att ge skriftligt informerat samtycke.
  • Deltagare som inte kan läsa, skriva eller konversera flytande på engelska kommer att uteslutas från fördefinierade mål 3 och 4.

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

  • Observationsmodeller: Kohort
  • Tidsperspektiv: Blivande

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
Deltagarna

St. Jude-patienter med en diagnostiserad solid eller flytande tumör (godartad eller malign) och deras biologiska föräldrar eller juridiskt auktoriserad representant.

Interventioner: Studieintroduktionsbesök, besök med informerat samtycke, uppföljningsbesök med informerat samtycke, samtal med återlämnande av resultat, två uppföljningsbesök med återlämnande av resultat, vävnadsprov (när tillgängligt), blodprov eller hudbiopsi.
Övrig: Studieintroduktionsbesök
Inom 5±3 veckor efter ankomsten till SJCRH, eller när det passar deltagaren/familjen, kommer deltagarna att träffa en genetisk rådgivare och läkare, tillhandahålla information för en familjestamtavla, genomgå en fysisk och diskutera alternativen för testning av könsceller. Studieintroduktionsmaterial kommer att tillhandahållas. Familjer som är intresserade av G4K-studien kommer att hänvisas till studiesjuksköterskan eller annan G4K-medlem och ett besök med informerat samtycke kommer att planeras.
Övrig: Besök med informerat samtycke
Inom 1±3 veckor efter studieintroduktionsbesöket, eller när det passar deltagaren/familjen, kommer forskningssköterskan eller annan studiegruppsmedlem att ge sitt samtycke till familjen och samla in demografisk och medicinsk information. Deltagarna kommer att fylla i bedömningsformulär.
Andra namn:
  • Frågeformulär
  • Demografiska och medicinska former
Övrig: Konversation med återkomst av resultat
Deltagarna kommer att fylla i bedömningsformuläret.
Andra namn:
  • Frågeformulär
  • Intervjuer
Procedur: Blodprov
För patienter som inte tidigare har lämnat ett blodprov kommer ett blodprov att tas som en källa till könscells-DNA.
Andra namn:
  • Flebotomi
Procedur: Hudbiopsi
Efter samtycke, för deltagare med en diagnos där perifert blod sannolikt är förorenat av tumörceller, kan hudbiopsier göras som en källa till könslinje-DNA.
Andra namn:
  • Biopsi
Övrig: Uppföljningsbesök för informerat samtycke
Vid eller efter registreringen men innan gerline-resultaten publiceras, eller när det passar deltagaren/familjen, kommer en delmängd av deltagare (30-40) att delta i semistrukturerade intervjuer.
Andra namn:
  • Intervjuer
Övrig: Återlämnande av resultat Uppföljningsbesök
Återlämnande av resultat Uppföljningsbesök kommer att genomföras två gånger: det första inom 8±4 veckor efter samtalet med återlämnande av resultat, eller när det passar deltagaren/familjen, och det andra inom 28 ± 4 veckor efter samtalet med återlämnande av resultat eller kl. deltagarens/familjens bekvämlighet. Vid varje besök kommer deltagarna att fylla i bedömningsformulär. Semistrukturerade intervjuer med föräldrar och ungdomar kommer att genomföras.
Andra namn:
  • Frågeformulär
  • Intervjuer

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Total framgångsfrekvens
Tidsram: Cirka 3 månader efter studieinskrivning

Framgång definieras av de kombinerade framgångarna av (1) kvalitetstolkbara genomiska data genereras från sekvensering av tumör- och könscellers vävnader, och (2) förmedling av genomiska testresultat till den primära SJCRH-onkologen och patienten och hans/hennes föräldrar.

Den binomiska andelen för framgångsrik prestation kommer att uppskattas av provandelen och 99 % konfidensintervall baserat på den normala approximationen. Provstorleken är 400.
Cirka 3 månader efter studieinskrivning
Antal och typ av somatiska genetiska varianter och könslinjegenetiska varianter
Tidsram: Cirka 3-4 månader efter att könslinjeprovet tagits
WGS-, WES- och RNA-sekvensdata kommer att användas för att identifiera och karakterisera somatiska genetiska varianter av patologisk betydelse och genetiska varianter av könsceller associerade med ökad cancerrisk. Beskrivande statistik, såsom antal och proportioner av varianter associerade med ökad cancerrisk kommer att beräknas inom varje patient och i varje sjukdomstyp.
Cirka 3-4 månader efter att könslinjeprovet tagits

Andra resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Andel föräldrar/deltagare efter uppfattning om genomisk testning
Tidsram: Vid studieslut (upp till 13 månader efter sista deltagares registrering)
Föräldrar/deltagares uppfattningar om genomiska undersökningar och forskning kommer att bedömas med hjälp av ljudbandade samtal och enkäter. Resultaten kommer att sammanfattas med beskrivande statistik.
Vid studieslut (upp till 13 månader efter sista deltagares registrering)
Antal deltagare/föräldrar efter kunskapsnivå
Tidsram: Vid studieslut (upp till 13 månader efter sista deltagares registrering)
Forskningsdeltagares/förälders förståelse för genomiska resultat och resultatens inverkan på forskningsdeltagare och deras familjer kommer att bedömas genom analys av ljudinspelade samtal och enkätresultat. Resultaten kommer att sammanfattas med beskrivande statistik
Vid studieslut (upp till 13 månader efter sista deltagares registrering)
Andel framgångsrika sekvenser av formalinfixerade, paraffininbäddade (FFPE) prover
Tidsram: Cirka 3 månader efter inskrivning
För att bedöma genomförbarheten kommer proportioner av FFPE-prover som framgångsrikt kan sekvenseras att uppskattas tillsammans med ett 95 % konfidensintervall.
Cirka 3 månader efter inskrivning

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

St. Jude Children's Research Hospital

Utredare

  • Huvudutredare: Kim E. Nichols, MD, St. Jude Children's Research Hospital

Publikationer och användbara länkar

Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.

Allmänna publikationer

Användbara länkar

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

28 augusti 2015

Primärt slutförande (Beräknad)

31 december 2045

Avslutad studie (Beräknad)

31 december 2053

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

19 augusti 2015

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

19 augusti 2015

Första postat (Beräknad)

21 augusti 2015

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

22 juli 2026

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

21 juli 2026

Senast verifierad

1 juli 2026

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Nyckelord

Ytterligare relevanta MeSH-villkor

Andra studie-ID-nummer

  • G4K

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera