Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Prospektywne sekwencjonowanie prawidłowych tkanek u pacjentów onkologicznych u dzieci

18 grudnia 2023 zaktualizowane przez: St. Jude Children's Research Hospital

Genomy dla dzieci (G4K)

Rozwój technik sekwencjonowania nowej generacji (NGS), w tym sekwencjonowania całego genomu (WGS), eksomu (WES) i sekwencjonowania RNA, zrewolucjonizował zdolność badaczy do badania mechanizmów molekularnych leżących u podstaw powstawania nowotworów. W ramach projektu Pediatric Cancer Genome Project (PCGP) badacze z Dziecięcego Szpitala Badawczego St. Jude (SJCRH) z powodzeniem wykorzystali metody NGS do oceny ponad 1000 nowotworów u dzieci, od nowotworów hematologicznych po guzy lite ośrodkowego układu nerwowego (OUN) i niezwiązane z OUN . Z tych i pokrewnych badań stało się jasne, że podejścia genomiczne mogą dokładnie klasyfikować guzy na odrębne podtypy patologiczne i prognostyczne oraz wykrywać zmiany w szlakach komórkowych, które mogą służyć jako nowe cele terapeutyczne. Podsumowując, badania te sugerują, że dzięki scharakteryzowaniu składu genomowego poszczególnych nowotworów badacze będą w stanie opracować spersonalizowane i potencjalnie bardziej skuteczne metody leczenia raka i/lub środki zapobiegawcze.

Protokół ten został początkowo uchwalony w celu wprowadzenia metod NGS do rutynowej opieki klinicznej. W początkowej fazie protokołu G4K zrekrutowano i włączono do badania 310 uczestników. Sekwencjonowanie guza i/lub linii zarodkowej zostało zakończone u wszystkich 310 pacjentów, z wygenerowanymi 253 raportami somatycznymi (reprezentującymi 96% z 263 uczestników, dla których tkanka nowotworowa była dostępna i analizowana) i wygenerowanymi 301 raportami linii zarodkowej (100% z 301 uczestników, którzy zgodzili się na otrzymanie wyników linii płciowej). Trwają analizy danych z badania, aw ciągu najbliższych kilku miesięcy planowane jest przygotowanie wstępnych manuskryptów. Dzięki pomyślnemu wstępnemu wykonaniu protokołu G4K kliniczne sekwencjonowanie genomowe próbek guza i linii zarodkowej jest obecnie oferowane jako część standardowej opieki klinicznej nad pacjentami onkologicznymi dzieci w St. Jude.

Protokół G4K został poprawiony. Wraz z rewizją zespół badawczy będzie rejestrował, przechowywał i analizował informacje dotyczące linii zarodkowej i genomu guza. Poprzez gromadzenie tych danych zbadamy, w jaki sposób mutacje germinalne w 150 genach predysponujących do raka wpływają na obraz kliniczny, histologię guza, wyniki genomiczne guza, odpowiedź na terapię i długoterminowe wyniki. Ogólnymi celami tych badań jest dalsze zdefiniowanie rozpowszechnienia, spektrum i odziedziczalności wariantów linii zarodkowej w tych genach oraz rozszyfrowanie, w jaki sposób mutacje linii zarodkowej wpływają na fenotypy rozszerzającego się zestawu zespołów predyspozycji do raka. Badania te pozwalają nam zapewnić dokładniejsze doradztwo genetyczne i strategie zarządzania przyszłym dzieciom niosącym mutacje w tych genach.

To pozostaje badaniem nieterapeutycznym. Badacze przewidują wielkość próby około 5000 pacjentów, którzy zostaną zrekrutowani w ciągu najbliższych 7 lat.

Przegląd badań

Status

Aktywny, nie rekrutujący

Warunki

Interwencja / Leczenie

Szczegółowy opis

CELE NAJWAŻNIEJSZE:

  • Wykorzystanie klinicznego sekwencjonowania genomu do określenia częstości występowania i spektrum mutacji germinalnych w genach predysponujących do raka u dzieci z rakiem.
  • Dla osób zidentyfikowanych z mutacjami linii zarodkowej, aby skorelować informacje genomowe linii zarodkowej z obrazem klinicznym, wynikami badań genomu guza, odpowiedzią na leczenie i wynikiem.

INNE OKREŚLONE CELE:

  • Generowanie i analizowanie danych opisujących postrzeganie badań i badań genomicznych przez pacjentów/rodziców w różnych punktach czasowych badania.
  • Aby wygenerować i przeanalizować dane dotyczące zwrotu wyników sekwencjonowania genomu, zbadaj zrozumienie tych wyników przez pacjenta/rodzica i oceń wpływ wyników na pacjentów i rodziny.
  • Określenie wykonalności i niezawodności przeprowadzenia sekwencjonowania WES i RNA na pochodnych z próbek guza utrwalonych w formalinie i zatopionych w parafinie (FFPE) wraz z analizą dopasowanych zamrożonych próbek guza i linii zarodkowej.

Od uczestników, którzy wyrażą zgodę, zostanie pobrana normalna próbka tkanki i wykorzystana do analizy sekwencji WGS, WES i RNA. Zdefiniowana lista 150 genów zostanie przeanalizowana pod kątem raportowania przy użyciu normalnej tkanki. Gdy wyniki tych analiz będą dostępne, zostaną ujawnione lekarzom, pacjentom i rodzicom. Do oceny zrozumienia, akceptacji i wpływu wyników genomicznych na pacjentów i rodziców zostaną zastosowane podejścia oparte na miarach mieszanych. W trakcie badania badacze przewidują, że lista genów, które zostaną zgłoszone przy użyciu normalnej tkanki, ulegnie zmianie w związku z postępem w literaturze lub innymi dowodami łączącymi dodatkowe geny z powstawaniem guza i ryzykiem raka, a nowe listy mogą zostać zdefiniowane.

Aby ocenić zrozumienie świadczeniodawcy, pacjenta i rodziny oraz opisać wpływ testów genomicznych i zwrot wyników, badanie to obejmie również administrację ankiet i częściowo ustrukturyzowanych wywiadów. Ankiety i wywiady są opcjonalne, ale zostaną zaoferowane wszystkim głównym dostawcom SJCRH, a także wszystkim kwalifikującym się uczestnikom i rodzicom, niezależnie od tego, czy wyrażą zgodę na przeprowadzenie badań genomicznych.

Próbka krwi lub biopsja skóry zostanie pobrana jako źródło DNA linii zarodkowej. Ta próbka jest niezbędna, ponieważ jest komparatorem, względem którego ocenia się próbki guza. Biopsje skóry można wykonać u pacjentów z rozpoznaniem, w którym krew obwodowa może być skażona komórkami nowotworowymi.

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Szacowany)

5000

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Lokalizacje studiów

  • Stany Zjednoczone
    • Tennessee
      • Memphis, Tennessee, Stany Zjednoczone, 38105
        • St. Jude Children's Research Hospital

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

  • Dziecko
  • Dorosły
  • Starszy dorosły

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Uczestnikami będą pacjenci St. Jude Children's Research Hospital (SJCRH) z rozpoznaniem guzów hematologicznych, litych lub ośrodkowego układu nerwowego, którzy wyrażą zgodę na udział w tym badaniu oraz ich rodzice lub prawnie upoważnieni przedstawiciele, którzy wyrażą zgodę na udział.

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • Pacjenci z St. Jude prospektywnie zidentyfikowani w momencie aktywacji badania z rozpoznanym litym lub płynnym guzem (łagodnym lub złośliwym).
  • Dostępna musi być odpowiednia tkanka (np. wystarczającej ilości linii zarodkowej i/lub tkanki nowotworowej, z której należy wyizolować >1 μg DNA i >0,1 μg RNA). Pacjenci, którzy nie mają dostępnej tkanki nowotworowej, mogą zostać włączeni do badania wyłącznie przy użyciu próbki linii zarodkowej.

Kryteria wyłączenia:

  • Historia przeszczepu hematopoetycznych komórek macierzystych (lub inny stan, który spowodowałby, że DNA komórek krwiotwórczych nie pasuje do DNA tkanki gospodarza).
  • Nowotwór lub tkanka zarodkowa niespełniająca kryteriów wymienionych powyżej.
  • Niemożność lub niechęć uczestnika badania lub opiekuna prawnego/przedstawiciela do wyrażenia pisemnej świadomej zgody.
  • Uczestnicy, którzy nie są w stanie czytać, pisać ani płynnie rozmawiać w języku angielskim, zostaną wykluczeni ze Z góry określonych celów 3 i 4.

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

  • Modele obserwacyjne: Kohorta
  • Perspektywy czasowe: Spodziewany

Kohorty i interwencje

Grupa / Kohorta
Interwencja / Leczenie
Uczestnicy

St. Jude pacjenci ze zdiagnozowanym guzem litym lub płynnym (łagodnym lub złośliwym) oraz ich biologiczni rodzice lub prawnie upoważniony przedstawiciel.

Interwencje: wizyta wprowadzająca do badania, wizyta w celu uzyskania świadomej zgody, wizyta kontrolna w celu uzyskania świadomej zgody, rozmowa zwrotna z wynikami, dwie wizyty kontrolne w celu przekazania wyników, próbka tkanki (jeśli jest dostępna), próbka krwi lub biopsja skóry.
Inny: Wizyta wprowadzająca do badania
W ciągu 5 ± 3 tygodni po przybyciu do SJCRH lub w dogodnym dla uczestnika/rodziny terminie uczestnicy spotkają się z doradcą genetycznym i klinicystą, udzielą informacji na temat rodowodu rodziny, przejdą badanie fizyczne i omówią opcje badania linii zarodkowej. Materiały wprowadzające do nauki zostaną dostarczone. Rodziny zainteresowane badaniem G4K zostaną skierowane do pielęgniarki prowadzącej badanie lub innego członka G4K i zostanie zaplanowana wizyta w celu uzyskania świadomej zgody.
Inny: Wizyta świadomej zgody
W ciągu 1 ± 3 tygodni po wizycie wprowadzającej do badania lub w dogodnym dla uczestnika/rodzinie miejscu pielęgniarka badawcza lub inny członek zespołu badawczego wyrazi zgodę rodziny i zbierze dane demograficzne i medyczne. Uczestnicy wypełnią ankiety oceniające.
Inne nazwy:
  • Kwestionariusze
  • Formularze demograficzne i medyczne
Inny: Wizyta kontrolna po uzyskaniu świadomej zgody
W ciągu 2-4 tygodni po wizycie w celu uzyskania świadomej zgody lub w dogodnym dla uczestnika/rodziny podzbiorze uczestników (30-40) weźmie udział w częściowo ustrukturyzowanych wywiadach.
Inne nazwy:
  • Wywiady
Inny: Zwrot wyników Rozmowa
Uczestnicy wypełnią kwestionariusze oceny.
Inne nazwy:
  • Kwestionariusze
  • Wywiady
Inny: Zwrot wyników Wizyty kontrolne
Zwrot wyników Wizyty kontrolne zostaną przeprowadzone dwukrotnie: pierwsza w ciągu 8±4 tygodni od Rozmowy o zwrocie wyników lub w dogodny dla uczestnika/rodziny sposób, a druga w ciągu 32±8 tygodni od Rozmowy o zwrocie wyników lub o godz. wygoda uczestnika/rodziny. Podczas każdej wizyty uczestnicy będą wypełniać kwestionariusze oceniające. Przeprowadzone zostaną częściowo ustrukturyzowane wywiady z rodzicami i młodzieżą.
Inne nazwy:
  • Kwestionariusze
  • Wywiady
Procedura: Próbka krwi
W przypadku pacjentów, którzy wcześniej nie pobrali próbki krwi, zostanie pobrana próbka krwi jako źródło DNA linii zarodkowej.
Inne nazwy:
  • Puszczanie krwi
Procedura: Biopsja skóry
Po wyrażeniu zgody, w przypadku uczestników z rozpoznaniem, w którym krew obwodowa może być skażona komórkami nowotworowymi, można wykonać biopsje skóry jako źródło DNA linii zarodkowej.
Inne nazwy:
  • Biopsja

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Ogólny wskaźnik sukcesu
Ramy czasowe: Około 3 miesiące po zapisaniu się na studia

Sukces jest definiowany przez łączne sukcesy (1) wysokiej jakości dających się zinterpretować danych genomowych uzyskanych z sekwencjonowania tkanek guza i linii zarodkowej oraz (2) przekazania wyników badań genomicznych głównemu onkologowi SJCRH oraz pacjentowi i jego rodzicom.

Dwumianowa proporcja pomyślnych wyników zostanie oszacowana na podstawie proporcji próby i 99% przedziału ufności opartego na przybliżeniu normalnym. Wielkość próbki to 400.
Około 3 miesiące po zapisaniu się na studia
Liczba i rodzaj somatycznych wariantów genetycznych i wariantów genetycznych linii płciowej
Ramy czasowe: Około 3-4 miesiące po pobraniu próbki linii zarodkowej
Dane sekwencyjne WGS, WES i RNA zostaną wykorzystane do identyfikacji i scharakteryzowania somatycznych wariantów genetycznych o znaczeniu patologicznym oraz wariantów genetycznych linii zarodkowej związanych ze zwiększonym ryzykiem raka. Statystyki opisowe, takie jak liczby i proporcje wariantów związanych ze zwiększonym ryzykiem raka, zostaną obliczone dla każdego pacjenta i dla każdego typu choroby.
Około 3-4 miesiące po pobraniu próbki linii zarodkowej

Inne miary wyników

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Odsetek rodziców/uczestników według postrzegania testów genomowych
Ramy czasowe: Na koniec badania (do 13 miesięcy po rejestracji ostatniego uczestnika)
Postrzeganie badań i badań genomicznych przez rodziców/uczestników zostanie ocenione za pomocą nagranych rozmów i ankiet. Wyniki zostaną podsumowane za pomocą statystyk opisowych.
Na koniec badania (do 13 miesięcy po rejestracji ostatniego uczestnika)
Liczba uczestników/rodziców według poziomu zrozumienia
Ramy czasowe: Na koniec badania (do 13 miesięcy po rejestracji ostatniego uczestnika)
Zrozumienie przez uczestnika badania/rodzica wyników genomicznych oraz wpływu wyników na uczestników badania i ich rodziny zostanie ocenione na podstawie analizy nagranych na taśmę rozmów i wyników ankiety. Wyniki zostaną podsumowane za pomocą statystyk opisowych
Na koniec badania (do 13 miesięcy po rejestracji ostatniego uczestnika)
Odsetek udanych sekwencji próbek utrwalonych w formalinie i zatopionych w parafinie (FFPE).
Ramy czasowe: Około 3 miesiące po rejestracji
Aby ocenić praktyczność, zostaną oszacowane proporcje próbek FFPE, które można z powodzeniem zsekwencjonować, wraz z 95% przedziałem ufności.
Około 3 miesiące po rejestracji

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

St. Jude Children's Research Hospital

Śledczy

  • Główny śledczy: Kim E. Nichols, MD, St. Jude Children's Research Hospital

Publikacje i pomocne linki

Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.

Publikacje ogólne

Przydatne linki

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

28 sierpnia 2015

Zakończenie podstawowe (Szacowany)

1 lipca 2025

Ukończenie studiów (Szacowany)

1 lipca 2035

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

19 sierpnia 2015

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

19 sierpnia 2015

Pierwszy wysłany (Szacowany)

21 sierpnia 2015

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Szacowany)

19 grudnia 2023

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

18 grudnia 2023

Ostatnia weryfikacja

1 grudnia 2023

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Słowa kluczowe

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • G4K

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Badania kliniczne na Wizyta wprowadzająca do badania

Wyszukaj podobne próby

Sponsorzy i współpracownicy

Warunki medyczne

Interwencje lekowe

CROs by country

CROs in Taiwan

Warunki

Rzadkie choroby

Interwencje lekowe

Suplementy diety

Sponsor / Współpracownicy

Lokalizacje

3
Subskrybuj