小児腫瘍学患者における正常組織の次世代シーケンシング

全ゲノム (WGS)、エクソーム (WES)、および RNA シーケンシングを含む次世代シーケンシング (NGS) 技術の開発は、腫瘍形成の根底にある分子メカニズムを調査する研究者の能力に革命をもたらしました。 小児がんゲノム プロジェクト (PCGP) を通じて、セント ジュード小児研究病院 (SJCRH) の研究者は、NGS アプローチを使用して、血液悪性腫瘍から中枢神経系 (CNS) および非 CNS 固形腫瘍に至る 1,000 を超える小児がんの評価に成功しました。 . これらの研究および関連する研究から、ゲノム アプローチが腫瘍を異なる病理学的および予後サブタイプに正確に分類し、新しい治療標的として機能する可能性のある細胞経路の変化を検出できることが明らかになりました。 まとめると、これらの研究は、個々の腫瘍のゲノム構成を特徴づけることにより、研究者が個別化された、潜在的により効果的な癌治療および/または予防措置を開発できることを示唆しています。

このプロトコルは当初、日常的な臨床ケアに NGS アプローチを導入するために制定されました。 G4K プロトコルの初期段階では、310 人の参加者が募集され、研究に登録されました。 腫瘍および/または生殖細胞系列の配列決定が 310 人の患者全員で完了し、253 の体細胞報告が生成され (腫瘍組織が利用可能で分析された 263 人の参加者の 96% を表す)、301 の生殖細胞系列の報告が生成された (301 の参加者の 100% が同意した)生殖細胞系の結果の受領)。 研究データの分析は進行中であり、今後数か月以内に最初の原稿を準備する予定です。 G4K プロトコルの初期実行が成功したため、腫瘍および生殖細胞系サンプルの臨床ゲノム配列決定が現在、St. Jude で小児腫瘍学患者の標準的な臨床ケアの一部として提供されています。

G4K プロトコルが改訂されました。 この改訂により、研究チームは生殖細胞系および腫瘍のゲノム情報を記録、保存、分析します。 これらのデータの収集を通じて、150 のがん素因遺伝子の生殖細胞変異が臨床症状、腫瘍組織学、腫瘍ゲノム所見、治療への反応、および長期転帰にどのように影響するかを調べます。 この研究の全体的な目標は、これらの遺伝子における生殖細胞バリアントの有病率、スペクトル、および遺伝率をさらに定義し、生殖細胞変異が拡大する一連のがん素因症候群の表現型にどのように影響するかを解明することです。 これらの研究により、これらの遺伝子に突然変異を抱える将来の子供たちにより正確な遺伝カウンセリングと管理戦略を提供することができます.

これは非治療研究のままです。 研究者は、今後 7 年間で約 5000 人の患者が募集されると予想しています。