Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Sekvenování normálních tkání nové generace prospektivně u pacientů s dětskou onkologií

23. dubna 2026 aktualizováno: St. Jude Children's Research Hospital

Genomy pro děti (G4K)

Vývoj technik sekvenování nové generace (NGS), včetně sekvenování celého genomu (WGS), exomu (WES) a RNA, způsobil revoluci ve schopnosti výzkumníků zkoumat molekulární mechanismy, které jsou základem tvorby nádorů. Prostřednictvím projektu Pediatric Cancer Genome Project (PCGP) vyšetřovatelé z Dětské výzkumné nemocnice St. Jude (SJCRH) úspěšně použili přístupy NGS k hodnocení více než 1 000 dětských rakovin od hematologických malignit po centrální nervový systém (CNS) a solidní nádory mimo CNS. . Z těchto a souvisejících studií se ukázalo, že genomické přístupy mohou přesně klasifikovat nádory do odlišných patologických a prognostických podtypů a detekovat změny v buněčných drahách, které mohou sloužit jako nové terapeutické cíle. Souhrnně tyto studie naznačují, že charakterizací genomového složení jednotlivých nádorů budou výzkumníci schopni vyvinout personalizovanou a potenciálně účinnější léčbu rakoviny a/nebo preventivní opatření.

Tento protokol byl původně přijat, aby uvedl přístupy NGS do rutinní klinické péče. Během počáteční fáze protokolu G4K bylo přijato 310 účastníků a zapsáno do studie. Sekvenování nádoru a/nebo zárodečné linie bylo dokončeno u všech 310 pacientů, přičemž bylo vytvořeno 253 somatických zpráv (představujících 96 % z 263 účastníků, pro které byla nádorová tkáň dostupná a analyzována) a vygenerováno 301 zpráv ze zárodečné linie (100 % z 301 účastníků, kteří souhlasili s příjem zárodečných výsledků). Probíhají analýzy dat studie s plány připravit počáteční rukopisy během několika příštích měsíců. Vzhledem k úspěšnému počátečnímu provedení protokolu G4K je nyní klinické genomové sekvenování vzorků nádorů a zárodečné linie nabízeno jako součást standardní klinické péče o dětské onkologické pacienty v St. Jude.

Protokol G4K byl nyní revidován. S revizí bude studijní tým zaznamenávat, ukládat a analyzovat zárodečné a nádorové genomické informace. Prostřednictvím sběru těchto dat budeme zkoumat, jak zárodečné mutace ve 150 genech pro predispozici rakoviny ovlivňují klinickou prezentaci, histologii nádoru, genomické nálezy nádoru, odpověď na terapii a dlouhodobé výsledky. Celkovým cílem tohoto výzkumu je dále definovat prevalenci, spektrum a dědičnost zárodečných variant v těchto genech a dešifrovat, jak zárodečné mutace ovlivňují fenotypy rozšiřující se řady syndromů predispozice k rakovině. Tyto studie nám umožňují poskytovat přesnější genetické poradenství a strategie řízení budoucím dětem s mutacemi v těchto genech.

Toto zůstává neterapeutická studie. Vyšetřovatelé předpokládají velikost vzorku přibližně 5000 pacientů, kteří budou přijati během příštích 7 let.

Přehled studie

Postavení

Nábor

Podmínky

Intervence / Léčba

Detailní popis

PRIMÁRNÍ CÍLE:

  • Využít klinické genomické sekvenování k definování prevalence a spektra zárodečných mutací v genech predispozice k rakovině u dětí s rakovinou.
  • Pro ty, u kterých byly identifikovány zárodečné mutace, korelovat zárodečné genomové informace s klinickou prezentací, nálezy genomu nádoru, léčebnou odpovědí a výsledkem.

DALŠÍ PŘEDEPSANÉ CÍLE:

  • Generovat a analyzovat data popisující vnímání genomických výzkumů a výzkumu pacientem/rodičem v různých časových bodech studie.
  • Chcete-li generovat a analyzovat data týkající se návratu výsledků genomického sekvenování, prozkoumejte, jak pacient/rodič těmto výsledkům rozumí, a zhodnoťte dopad výsledků na pacienty a rodiny.
  • Stanovit proveditelnost a spolehlivost provádění sekvenování WES a RNA na derivátech ze vzorků nádorů fixovaných ve formalínu, zalitých v parafinu (FFPE) spolu s analýzou odpovídajících vzorků zmrazeného nádoru a zárodečné linie.

Pro účastníky, kteří dají souhlas, bude odebrán vzorek normální tkáně a použit pro WGS, WES a RNA sekvenční analýzu. Definovaný seznam 150 genů bude analyzován pro hlášení pomocí normální tkáně. Jakmile budou výsledky těchto analýz k dispozici, budou sděleny lékařům, pacientům a rodičům. K posouzení porozumění, přijetí a dopadu genomických výsledků na pacienty a rodiče budou použity smíšené přístupy. V průběhu studie vědci předpokládají, že seznam genů, které mají být hlášeny pomocí normální tkáně, se změní v důsledku pokroku v literatuře nebo jiných důkazů spojujících další geny s tvorbou nádorů a rizikem rakoviny a mohou být definovány nové seznamy.

Aby bylo možné posoudit porozumění poskytovatele, pacienta a rodiny a popsat dopady genomického testování a návratnosti výsledků, bude tato studie zahrnovat také provádění průzkumů a polostrukturovaných rozhovorů. Průzkumy a rozhovory jsou volitelné, ale budou nabídnuty všem primárním poskytovatelům SJCRH, stejně jako všem způsobilým účastníkům a rodičům, bez ohledu na to, zda souhlasí s prováděním genomického testování či nikoli.

Jako zdroj zárodečné DNA bude získán vzorek krve nebo kožní biopsie. Tento vzorek je nezbytný, protože je to komparátor, proti kterému se hodnotí vzorky nádorů. Kožní biopsie lze provádět u pacientů s diagnózou, kdy je pravděpodobně periferní krev kontaminována nádorovými buňkami.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Odhadovaný)

2500

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

Studijní místa

  • Spojené státy
    • Tennessee
      • Memphis, Tennessee, Spojené státy, 38105
        • Nábor
        • St. Jude Children's Research Hospital
        • Vrchní vyšetřovatel:
          • Kim E. Nichols, MD
        • Kontakt:

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

  • Dítě
  • Dospělý
  • Starší dospělý

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Účastníky budou pacienti z Dětské výzkumné nemocnice St. Jude (SJCRH) s diagnózou hematologických nádorů, solidních nádorů nebo nádorů centrálního nervového systému, kteří souhlasí s účastí v této studii, a jejich rodiče nebo zákonní zástupci, kteří souhlasí s účastí.

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Pacienti v St. Jude prospektivně identifikovaní v době aktivace studie s diagnostikovaným pevným nebo tekutým nádorem (benigní nebo maligní).
  • Musí být k dispozici odpovídající tkáň (např. dostatek zárodečné a/nebo nádorové tkáně, ze které musí být izolováno >1 ug DNA a >0,1 ug RNA). Pacienti, kteří nemají k dispozici žádnou nádorovou tkáň, se mohou zapsat pouze s použitím vzorku zárodečné linie.

Kritéria vyloučení:

  • Minulá historie transplantace krvetvorných kmenových buněk (nebo jiného stavu, který by vedl k tomu, že DNA hematopoetických buněk selhala v souladu s DNA hostitelské tkáně).
  • Nádor nebo zárodečná tkáň nesplňující kritéria uvedená výše.
  • Neschopnost nebo neochota účastníka výzkumu nebo zákonného zástupce/zástupce dát písemný informovaný souhlas.
  • Účastníci, kteří nejsou schopni číst, psát nebo plynule konverzovat v angličtině, budou vyloučeni z předem stanovených cílů 3 a 4.

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Observační modely: Kohorta
  • Časové perspektivy: Budoucí

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
Účastníci

Jude pacientů s diagnostikovaným solidním nebo tekutým nádorem (benigním nebo maligním) a jejich biologickými rodiči nebo zákonným zástupcem.

Intervence: Úvodní návštěva studie, Návštěva s informovaným souhlasem, Následná návštěva s informovaným souhlasem, Konverzace s návratem výsledků, dvě následné návštěvy s návratem výsledků, Vzorek tkáně (pokud je k dispozici), Vzorek krve nebo Biopsie kůže.
Jiný: Úvod do studia Návštěva
Během 5±3 týdnů po příjezdu do SJCRH nebo podle potřeby účastníka/rodiny se účastníci setkají s genetickým poradcem a klinikem, poskytnou informace pro rodinný rodokmen, podstoupí fyzické vyšetření a prodiskutují možnosti testování zárodečné linie. Budou poskytnuty úvodní materiály ke studiu. Rodiny se zájmem o studii G4K budou odkázány na studijní sestru nebo jiného člena G4K a bude naplánována návštěva s informovaným souhlasem.
Jiný: Návštěva informovaného souhlasu
Do 1 ± 3 týdnů po návštěvě Úvodu do studie nebo na přání účastníka/rodiny dá výzkumná sestra nebo jiný člen studijního týmu souhlas s rodinou a shromáždí demografické a lékařské informace. Účastníci vyplní hodnotící dotazníky.
Ostatní jména:
  • Dotazníky
  • Demografické a lékařské formy
Jiný: Návrat výsledků konverzace
Účastníci vyplní hodnotící dotazníky.
Ostatní jména:
  • Dotazníky
  • Rozhovory
Postup: Krevní vzorek
U pacientů, kteří dříve neposkytli vzorek krve, bude odebrán vzorek krve jako zdroj zárodečné DNA.
Ostatní jména:
  • Flebotomie
Postup: Biopsie kůže
Po souhlasu mohou být u účastníků s diagnózou, kde je pravděpodobně periferní krev kontaminována nádorovými buňkami, provedeny kožní biopsie jako zdroje zárodečné DNA.
Ostatní jména:
  • Biopsie
Jiný: Následná návštěva s informovaným souhlasem
Při zápisu nebo po něm, ale před zveřejněním výsledků gerline, nebo podle přání účastníka/rodiny se podskupina účastníků (30–40) zúčastní polostrukturovaných rozhovorů.
Ostatní jména:
  • Rozhovory
Jiný: Návrat výsledků Následné návštěvy
Následné návštěvy pro vrácení výsledků budou provedeny dvakrát: první do 8 ± 4 týdnů od konverzace o vrácení výsledků nebo podle přání účastníka/rodiny a druhá do 28 ± 4 týdnů od konverzace o vrácení výsledků nebo v pohodlí účastníka/rodiny. Při každé návštěvě účastníci vyplní hodnotící dotazníky. Budou vedeny polostrukturované rozhovory s rodiči a dospívajícími.
Ostatní jména:
  • Dotazníky
  • Rozhovory

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Celková úspěšnost
Časové okno: Přibližně 3 měsíce po zápisu do studia

Úspěch je definován kombinovanými úspěchy (1) kvalitními interpretovatelnými genomickými daty, která jsou generována ze sekvenování nádorových a zárodečných tkání, a (2) sdělením výsledků genomických testů primárnímu onkologovi SJCRH a pacientovi a jeho rodičům.

Binomický podíl úspěšného výkonu bude odhadnut pomocí podílu vzorku a 99% intervalu spolehlivosti na základě normální aproximace. Velikost vzorku je 400.
Přibližně 3 měsíce po zápisu do studia
Počet a typ somatických genetických variant a zárodečných genetických variant
Časové okno: Přibližně 3-4 měsíce po získání vzorku zárodečné linie
Data sekvencí WGS, WES a RNA budou použita k identifikaci a charakterizaci somatických genetických variant patologického významu a zárodečných genetických variant spojených se zvýšeným rizikem rakoviny. Popisné statistiky, jako jsou počty a podíly variant spojených se zvýšeným rizikem rakoviny, budou vypočítány pro každého pacienta a pro každý typ onemocnění.
Přibližně 3-4 měsíce po získání vzorku zárodečné linie

Další výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Podíl rodičů/účastníků podle vnímání genomického testování
Časové okno: Na konci studie (až 13 měsíců po posledním zápisu účastníka)
Vnímání genomických výzkumů a výzkumu rodiči/účastníky bude hodnoceno pomocí audionahrávek konverzací a průzkumů. Výsledky budou shrnuty pomocí deskriptivních statistik.
Na konci studie (až 13 měsíců po posledním zápisu účastníka)
Počet účastníků/rodičů podle úrovně porozumění
Časové okno: Na konci studie (až 13 měsíců po posledním zápisu účastníka)
Porozumění výsledkům genomu ze strany účastníků výzkumu/rodičů a dopadu výsledků na účastníky výzkumu a jejich rodiny bude posouzeno analýzou audionahrávek rozhovorů a výsledků průzkumu. Výsledky budou shrnuty pomocí deskriptivních statistik
Na konci studie (až 13 měsíců po posledním zápisu účastníka)
Podíl úspěšných sekvencí vzorků fixovaných ve formalínu, zalitých v parafínu (FFPE).
Časové okno: Přibližně 3 měsíce po zápisu
Pro posouzení proveditelnosti se odhadnou podíly vzorků FFPE, které lze úspěšně sekvenovat, spolu s 95% intervalem spolehlivosti.
Přibližně 3 měsíce po zápisu

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

St. Jude Children's Research Hospital

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Kim E. Nichols, MD, St. Jude Children's Research Hospital

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Obecné publikace

Užitečné odkazy

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

28. srpna 2015

Primární dokončení (Odhadovaný)

31. prosince 2033

Dokončení studie (Odhadovaný)

31. prosince 2038

Termíny zápisu do studia

První předloženo

19. srpna 2015

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

19. srpna 2015

První zveřejněno (Odhadovaný)

21. srpna 2015

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

29. dubna 2026

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

23. dubna 2026

Naposledy ověřeno

1. dubna 2026

Více informací

Termíny související s touto studií

Klíčová slova

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • G4K

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Úvod do studia Návštěva

Prohledejte podobné pokusy

Sponzoři a spolupracovníci

Zdravotní podmínky

Drogové intervence

CROs by country

CROs in Mauritania

Podmínky

Vzácné nemoci

Drogové intervence

Doplňky stravy

Sponzor / Spolupracovníci

Místa

Předplatit