Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Next Generation Sequencing van normale weefsels prospectief bij pediatrische oncologiepatiënten

21 juli 2026 bijgewerkt door: St. Jude Children's Research Hospital

Genomen voor kinderen (G4K)

De ontwikkeling van next generation sequencing (NGS) technieken, waaronder het gehele genoom (WGS), exome (WES) en RNA sequencing heeft een revolutie teweeggebracht in het vermogen van onderzoekers om de moleculaire mechanismen die ten grondslag liggen aan tumorvorming te onderzoeken. Via het Pediatric Cancer Genome Project (PCGP) hebben onderzoekers van het St. Jude Children's Research Hospital (SJCRH) met succes NGS-benaderingen gebruikt om meer dan 1.000 pediatrische kankers te evalueren, variërend van hematologische maligniteiten tot centrale zenuwstelsel (CZS) en niet-CZS solide tumoren . Uit deze en gerelateerde onderzoeken is duidelijk geworden dat genomische benaderingen tumoren nauwkeurig kunnen classificeren in verschillende pathologische en prognostische subtypen en veranderingen in cellulaire routes kunnen detecteren die als nieuwe therapeutische doelen kunnen dienen. Gezamenlijk suggereren deze onderzoeken dat onderzoekers, door de genomische samenstelling van individuele tumoren te karakteriseren, gepersonaliseerde en mogelijk effectievere kankerbehandelingen en/of preventieve maatregelen kunnen ontwikkelen.

Dit protocol is in eerste instantie opgesteld om NGS-benaderingen in te luiden voor routinematige klinische zorg. Tijdens de beginfase van het G4K-protocol werden 310 deelnemers gerekruteerd en ingeschreven voor het onderzoek. Tumor- en/of kiembaansequencing werd voltooid bij alle 310 patiënten, waarbij 253 somatische rapporten werden gegenereerd (die 96% vertegenwoordigen van de 263 deelnemers voor wie tumorweefsel beschikbaar en geanalyseerd was) en 301 kiembaanrapporten werden gegenereerd (100% van de 301 deelnemers die instemden met de ontvangst van kiembaanresultaten). Analyses van de studiegegevens zijn aan de gang met plannen om de eerste manuscripten binnen de komende maanden voor te bereiden. Dankzij de succesvolle eerste uitvoering van het G4K-protocol wordt klinische genomische sequentiebepaling van tumor- en kiembaanmonsters nu aangeboden als onderdeel van de standaard klinische zorg voor pediatrische oncologiepatiënten in St. Jude.

Het G4K-protocol is nu herzien. Met de revisie zal het onderzoeksteam kiembaan- en tumorgenomische informatie vastleggen, opslaan en analyseren. Door het verzamelen van deze gegevens zullen we onderzoeken hoe kiembaanmutaties in 150 kankerpredispositiegenen de klinische presentatie, tumorhistologie, tumorgenomische bevindingen, respons op therapie en langetermijnresultaten beïnvloeden. De algemene doelstellingen van dit onderzoek zijn om de prevalentie, het spectrum en de erfelijkheidsgraad van kiembaanvarianten in deze genen verder te definiëren en om te ontcijferen hoe kiembaanmutaties de fenotypes van een groeiende reeks van predispositiesyndromen voor kanker beïnvloeden. Deze studies stellen ons in staat om nauwkeurigere genetische counseling en managementstrategieën te bieden aan toekomstige kinderen met mutaties in deze genen.

Dit blijft een niet-therapeutische studie. Onderzoekers verwachten een steekproefomvang van ongeveer 5000 patiënten die in de komende 7 jaar zullen worden gerekruteerd.

Studie Overzicht

Toestand

Werving

Conditie

Interventie / Behandeling

Gedetailleerde beschrijving

PRIMAIRE DOELEN:

  • Klinische genomische sequencing gebruiken om de prevalentie en het spectrum van kiembaanmutaties in genen voor aanleg voor kanker bij kinderen met kanker te bepalen.
  • Voor degenen die zijn geïdentificeerd met kiembaanmutaties, om kiembaangenomische informatie te correleren met klinische presentatie, tumorgenomische bevindingen, behandelingsrespons en resultaat.

ANDERE VOORAF GESPECIFICEERDE DOELSTELLINGEN:

  • Gegevens genereren en analyseren die de percepties van patiënten/ouders van genomisch onderzoek en onderzoek beschrijven op verschillende tijdstippen gedurende het onderzoek.
  • Om gegevens rond de terugkeer van resultaten van genomische sequencing te genereren en te analyseren, onderzoekt u het begrip van de patiënt/ouder van deze resultaten en beoordeelt u de impact van de resultaten op patiënten en families.
  • Om de haalbaarheid en betrouwbaarheid te bepalen van het uitvoeren van WES- en RNA-sequencing op derivaten van in formaline gefixeerde, in paraffine ingebedde (FFPE) tumormonsters naast de analyse van gematchte ingevroren tumor- en kiembaanmonsters.

Voor deelnemers die toestemming geven, wordt een normaal weefselmonster verkregen en gebruikt voor WGS-, WES- en RNA-sequentieanalyse. Een gedefinieerde lijst van 150 genen zal worden geanalyseerd voor rapportage met behulp van het normale weefsel. Zodra de resultaten van deze analyses beschikbaar zijn, worden ze bekendgemaakt aan artsen, patiënten en ouders. Er zullen benaderingen met gemengde maatregelen worden gebruikt om het begrip, de acceptatie en de impact van genomische resultaten op patiënten en ouders te beoordelen. In de loop van het onderzoek verwachten de onderzoekers dat de lijst van genen die gerapporteerd moeten worden bij gebruik van normaal weefsel, zal veranderen als gevolg van vooruitgang in de literatuur of ander bewijs dat aanvullende genen koppelt aan tumorvorming en het risico op kanker, en er kunnen nieuwe lijsten worden opgesteld.

Om het begrip van zorgverlener, patiënt en familie te beoordelen en de impact van genomische testen en teruggave van resultaten te beschrijven, zal deze studie ook het beheer van enquêtes en semi-gestructureerde interviews omvatten. Enquêtes en interviews zijn optioneel, maar worden aangeboden aan alle primaire SJCRH-aanbieders, evenals aan alle in aanmerking komende deelnemers en ouders, ongeacht of ze al dan niet toestemming geven om de genomische tests voort te zetten.

Een bloedmonster of een huidbiopsie zal worden verkregen als een bron van kiembaan-DNA. Dit monster is nodig omdat het de comparator is waartegen tumormonsters worden geëvalueerd. Huidbiopten kunnen worden uitgevoerd bij patiënten met een diagnose waarbij perifeer bloed waarschijnlijk is besmet met tumorcellen.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Geschat)

2500

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Locaties

  • Verenigde Staten
    • Tennessee
      • Memphis, Tennessee, Verenigde Staten, 38105
        • Werving
        • St. Jude Children's Research Hospital
        • Hoofdonderzoeker:
          • Kim E. Nichols, MD
        • Contact:

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

  • Kind
  • Volwassen
  • Oudere volwassene

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

Deelnemers zijn patiënten in het St. Jude Children's Research Hospital (SJCRH) met de diagnose van hematologische tumoren, solide tumoren of tumoren van het centrale zenuwstelsel die ermee instemmen om aan dit onderzoek deel te nemen, en hun ouders of wettelijk bevoegde vertegenwoordigers die ermee instemmen om deel te nemen.

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • St. Jude-patiënten identificeerden prospectief op het moment van studieactivering met een gediagnosticeerde vaste of vloeibare tumor (goedaardig of kwaadaardig).
  • Er moet voldoende weefsel beschikbaar zijn (bijv. voldoende kiembaan- en/of tumorweefsel, waaruit >1 µg DNA en >0,1 µg RNA moet worden geïsoleerd). Patiënten die geen tumorweefsel beschikbaar hebben, kunnen zich inschrijven met alleen een kiembaanmonster.

Uitsluitingscriteria:

  • Voorgeschiedenis van hematopoëtische stamceltransplantatie (of een andere aandoening die ertoe zou leiden dat het DNA van de hematopoëtische cel niet overeenkomt met het DNA van het gastheerweefsel).
  • Tumor- of kiembaanweefsel voldoet niet aan de bovenstaande criteria.
  • Onvermogen of onwil van onderzoeksdeelnemer of wettelijke voogd/vertegenwoordiger om schriftelijke geïnformeerde toestemming te geven.
  • Deelnemers die niet vloeiend Engels kunnen lezen, schrijven of converseren, worden uitgesloten van vooraf gespecificeerde doelstellingen 3 en 4.

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Observatiemodellen: Cohort
  • Tijdsperspectieven: Prospectief

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
Deelnemers

St. Jude-patiënten met een gediagnosticeerde vaste of vloeibare tumor (goedaardig of kwaadaardig) en hun biologische ouders of wettelijk gemachtigde vertegenwoordiger.

Interventies: Studie-introductiebezoek, bezoek met geïnformeerde toestemming, vervolgbezoek met geïnformeerde toestemming, gesprek over teruggave van resultaten, twee vervolgbezoeken met teruggave van resultaten, weefselmonster (indien beschikbaar), bloedmonster of huidbiopsie.
Ander: Studie Introductie Bezoek
Binnen 5 ± 3 weken na aankomst bij SJCRH, of wanneer het de deelnemer/familie uitkomt, zullen de deelnemers een genetisch adviseur en clinicus ontmoeten, informatie verstrekken voor een stamboom van de familie, een lichamelijk onderzoek ondergaan en opties voor kiembaantesten bespreken. Voor studie-introductiemateriaal wordt gezorgd. Gezinnen die geïnteresseerd zijn in de G4K-studie zullen worden doorverwezen naar de onderzoeksverpleegkundige of een ander G4K-lid en er zal een geïnformeerde toestemmingsbezoek worden gepland.
Ander: Bezoek met geïnformeerde toestemming
Binnen 1 ± 3 weken na het studie-introductiebezoek, of wanneer het de deelnemer/familie uitkomt, zal de onderzoeksverpleegkundige of een ander lid van het studieteam toestemming geven aan de familie en demografische en medische informatie verzamelen. De deelnemers vullen beoordelingsvragenlijsten in.
Andere namen:
  • Vragenlijsten
  • Demografische en medische vormen
Ander: Terugkeer van Resultaten Gesprek
De deelnemers vullen de beoordelingsvragenlijsten in.
Andere namen:
  • Vragenlijsten
  • Sollicitatiegesprekken
Procedure: Bloedmonster
Voor patiënten die niet eerder een bloedmonster hebben verstrekt, zal een bloedmonster worden verkregen als bron van kiembaan-DNA.
Andere namen:
  • Bloedafname
Procedure: Biopsie van de huid
Na toestemming kunnen voor deelnemers met een diagnose waarbij perifeer bloed waarschijnlijk besmet is met tumorcellen, huidbiopten worden uitgevoerd als bron van kiembaan-DNA.
Andere namen:
  • Biopsie
Ander: Vervolgbezoek met geïnformeerde toestemming
Bij of na inschrijving, maar vóór de publicatie van de gerline-resultaten, of wanneer het de deelnemer/familie uitkomt, zal een subgroep van deelnemers (30-40) deelnemen aan semi-gestructureerde interviews.
Andere namen:
  • Sollicitatiegesprekken
Ander: Terugkeer van resultaten Vervolgbezoeken
Vervolgbezoeken over de teruggave van de resultaten worden tweemaal uitgevoerd: de eerste binnen 8 ± 4 weken na het gesprek over de teruggave van de resultaten, of wanneer het de deelnemer/familie uitkomt, en de tweede binnen 28 ± 4 weken na het gesprek over de teruggave van de resultaten, of op het gemak van de deelnemer/familie. Bij elk bezoek vullen de deelnemers beoordelingsvragenlijsten in. Er zullen semi-gestructureerde interviews met ouders en adolescenten worden afgenomen.
Andere namen:
  • Vragenlijsten
  • Sollicitatiegesprekken

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Algehele slagingspercentage
Tijdsspanne: Ongeveer 3 maanden na inschrijving studie

Succes wordt bepaald door de gecombineerde successen van (1) hoogwaardige interpreteerbare genomische gegevens die worden gegenereerd door het bepalen van de sequentie van tumor- en kiembaanweefsels, en (2) het communiceren van genomische testresultaten aan de primaire SJCRH-oncoloog en de patiënt en zijn/haar ouders.

De binominale proportie van succesvolle prestaties wordt geschat door de steekproefproportie en het 99%-betrouwbaarheidsinterval op basis van de normale benadering. De steekproefomvang is 400.
Ongeveer 3 maanden na inschrijving studie
Aantal en type somatisch genetische varianten en kiembaangenetische varianten
Tijdsspanne: Ongeveer 3-4 maanden nadat het kiembaanmonster is verkregen
WGS-, WES- en RNA-sequentiegegevens zullen worden gebruikt voor het identificeren en karakteriseren van somatisch genetische varianten van pathologische betekenis en genetische varianten van de kiembaan die geassocieerd zijn met een verhoogd risico op kanker. Beschrijvende statistieken, zoals aantallen en proporties van varianten geassocieerd met een verhoogd risico op kanker, zullen binnen elke patiënt en in elk ziektetype worden berekend.
Ongeveer 3-4 maanden nadat het kiembaanmonster is verkregen

Andere uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Aandeel ouders/deelnemers naar perceptie van genomische testen
Tijdsspanne: Aan het einde van de studie (tot 13 maanden na inschrijving van de laatste deelnemer)
De percepties van ouders/deelnemers van genomisch onderzoek en onderzoek zullen worden beoordeeld met behulp van op audio opgenomen gesprekken en enquêtes. Resultaten zullen worden samengevat door beschrijvende statistieken.
Aan het einde van de studie (tot 13 maanden na inschrijving van de laatste deelnemer)
Aantal deelnemers/ouders naar begripsniveau
Tijdsspanne: Aan het einde van de studie (tot 13 maanden na inschrijving van de laatste deelnemer)
Onderzoeksdeelnemer/ouder begrip van genomische resultaten en de impact van resultaten op onderzoeksdeelnemers en hun families zal worden beoordeeld door analyse van op audio opgenomen gesprekken en onderzoeksresultaten. Resultaten zullen worden samengevat door beschrijvende statistieken
Aan het einde van de studie (tot 13 maanden na inschrijving van de laatste deelnemer)
Percentage succesvolle sequenties van in formaline gefixeerde, in paraffine ingebedde (FFPE) monsters
Tijdsspanne: Ongeveer 3 maanden na inschrijving
Om de uitvoerbaarheid te beoordelen, zullen de proporties van FFPE-monsters die met succes kunnen worden gesequenced, worden geschat samen met een betrouwbaarheidsinterval van 95%.
Ongeveer 3 maanden na inschrijving

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

St. Jude Children's Research Hospital

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: Kim E. Nichols, MD, St. Jude Children's Research Hospital

Publicaties en nuttige links

De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.

Algemene publicaties

Nuttige links

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

28 augustus 2015

Primaire voltooiing (Geschat)

31 december 2045

Studie voltooiing (Geschat)

31 december 2053

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

19 augustus 2015

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

19 augustus 2015

Eerst geplaatst (Geschat)

21 augustus 2015

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

22 juli 2026

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

21 juli 2026

Laatst geverifieerd

1 juli 2026

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Trefwoorden

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • G4K

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren