Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Næste generations sekvensering af normalt væv prospektivt hos pædiatriske onkologiske patienter

23. april 2026 opdateret af: St. Jude Children's Research Hospital

Genomer for børn (G4K)

Udviklingen af ​​næste generations sekventeringsteknikker (NGS), herunder hele genom (WGS), exome (WES) og RNA-sekventering, har revolutioneret efterforskernes evne til at forespørge på de molekylære mekanismer, der ligger til grund for tumordannelse. Gennem Pediatric Cancer Genome Project (PCGP) har efterforskere ved St. Jude Children's Research Hospital (SJCRH) med succes brugt NGS-tilgange til at evaluere mere end 1.000 pædiatriske kræftformer lige fra hæmatologiske maligniteter til centralnervesystemet (CNS) og solide tumorer i ikke-CNS . Fra disse og relaterede undersøgelser er det blevet klart, at genomiske tilgange nøjagtigt kan klassificere tumorer i forskellige patologiske og prognostiske undertyper og detektere ændringer i cellulære veje, der kan tjene som nye terapeutiske mål. Samlet tyder disse undersøgelser på, at ved at karakterisere den genomiske sammensætning af individuelle tumorer, vil efterforskere være i stand til at udvikle personlige og potentielt mere effektive kræftbehandlinger og/eller forebyggende foranstaltninger.

Denne protokol blev oprindeligt vedtaget for at indlede NGS tilgange til rutinemæssig klinisk pleje. I den indledende fase af G4K-protokollen blev 310 deltagere rekrutteret og tilmeldt undersøgelsen. Tumor- og/eller kimlinjesekventering blev afsluttet på alle 310 patienter, med 253 somatiske rapporter genereret (repræsenterede 96 % af de 263 deltagere, for hvem tumorvæv var tilgængeligt og analyseret) og 301 kimlinjerapporter genereret (100 % af de 301 deltagere, der accepterede at modtagelse af kimlinjeresultater). Analyser af undersøgelsesdataene er i gang med planer om at udarbejde indledende manuskripter inden for de næste mange måneder. På grund af den vellykkede indledende udførelse af G4K-protokollen, tilbydes klinisk genomisk sekventering af tumor- og kimlinjeprøver nu som en del af standard klinisk behandling for pædiatriske onkologiske patienter på St. Jude.

G4K-protokollen er nu blevet revideret. Med revisionen vil undersøgelsesholdet registrere, opbevare og analysere germline- og tumorgenomisk information. Gennem indsamlingen af ​​disse data vil vi undersøge, hvordan kimlinjemutationer i 150 kræftprædispositionsgener påvirker klinisk præsentation, tumorhistologi, tumorgenomiske fund, respons på terapi og langsigtede resultater. De overordnede mål for denne forskning er yderligere at definere udbredelsen, spektret og arveligheden af ​​kimlinjevarianter i disse gener og at dechifrere, hvordan kimlinjemutationer påvirker fænotyperne af en voksende række af kræftprædispositionssyndromer. Disse undersøgelser giver os mulighed for at give mere nøjagtig genetisk rådgivning og håndteringsstrategier til fremtidige børn, der huser mutationer i disse gener.

Dette er fortsat en ikke-terapeutisk undersøgelse. Efterforskere forventer en stikprøvestørrelse på cirka 5000 patienter, som vil blive rekrutteret i løbet af de næste 7 år.

Studieoversigt

Status

Rekruttering

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljeret beskrivelse

PRIMÆRE MÅL:

  • At bruge klinisk genomisk sekventering til at definere prævalensen og spektret af kimlinjemutationer i kræftprædispositionsgener hos børn med kræft.
  • For dem, der er identificeret med kimlinjemutationer, at korrelere kimlinjegenomisk information med klinisk præsentation, tumorgenomiske fund, behandlingsrespons og resultat.

ANDRE FORESPECIFICEREDE MÅL:

  • At generere og analysere data, der beskriver patient/forældres opfattelse af genomiske undersøgelser og forskning på forskellige tidspunkter i hele undersøgelsen.
  • For at generere og analysere data omkring returnering af genomiske sekventeringsresultater, undersøge patient/forældres forståelse af disse resultater og vurdere virkningen af ​​resultater på patienter og familier.
  • For at bestemme gennemførligheden og pålideligheden af ​​at udføre WES- og RNA-sekventering på derivater fra formalinfikserede, paraffinindlejrede (FFPE) tumorprøver sammen med analysen af ​​matchede frosne tumor- og kimlinjeprøver.

For deltagere, der giver samtykke, vil en normal vævsprøve blive udtaget og brugt til WGS-, WES- og RNA-sekvensanalyse. En defineret liste med 150 gener vil blive analyseret til rapportering ved brug af det normale væv. Når resultaterne af disse analyser er tilgængelige, vil de blive videregivet til læger, patienter og forældre. Blandede foranstaltninger vil blive brugt til at vurdere forståelse, accept og indvirkning af genomiske resultater på patienter og forældre. I løbet af undersøgelsen forudser forskerne, at listen over gener, der skal rapporteres ved brug af normalt væv, ændres på grund af fremskridt i litteraturen eller anden dokumentation, der forbinder yderligere gener med tumordannelse og kræftrisiko, og nye lister kan blive defineret.

For at vurdere udbyderens, patientens og familiens forståelse og beskrive virkningerne af genomisk testning og returnering af resultater, vil denne undersøgelse også inkorporere administration af undersøgelser og semistrukturerede interviews. Undersøgelser og interviews er valgfrie, men vil blive tilbudt til alle primære SJCRH-udbydere såvel som alle berettigede deltagere og forældre, uanset om de giver samtykke til at forfølge den genomiske test eller ej.

En prøve af blod eller en hudbiopsi vil blive opnået som en kilde til kimlinje-DNA. Denne prøve er nødvendig, da den er komparatoren, mod hvilken tumorprøver vurderes. Hudbiopsier kan udføres på patienter, der har en diagnose, hvor perifert blod sandsynligvis er forurenet af tumorceller.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Anslået)

2500

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Studiesteder

  • Forenede Stater
    • Tennessee
      • Memphis, Tennessee, Forenede Stater, 38105
        • Rekruttering
        • St. Jude Children's Research Hospital
        • Ledende efterforsker:
          • Kim E. Nichols, MD
        • Kontakt:

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

  • Barn
  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Deltagerne vil være patienter på St. Jude Children's Research Hospital (SJCRH) med diagnoser af hæmatologiske, solide eller centralnervesystemtumorer, som accepterer at deltage i denne undersøgelse, og deres forældre eller juridisk autoriserede repræsentanter, der giver samtykke til at deltage.

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • St. Jude-patienter, der prospektivt identificeres på tidspunktet for aktivering af undersøgelsen med en diagnosticeret fast eller flydende tumor (godartet eller ondartet).
  • Der skal være tilstrækkeligt væv tilgængeligt (f. tilstrækkeligt kim- og/eller tumorvæv, hvorfra >1 µg DNA og >0,1 µg RNA skal isoleres). Patienter, der ikke har noget tumorvæv tilgængeligt, kan tilmeldes ved kun at bruge kimlinjeprøve.

Ekskluderingskriterier:

  • Tidligere hæmatopoietisk stamcelletransplantation (eller anden tilstand, der ville resultere i, at hæmatopoietisk celle-DNA ikke matcher værtsvævs-DNA).
  • Tumor- eller kimcellevæv, der ikke opfylder ovenstående kriterier.
  • Forskningsdeltagers eller juridiske værge/repræsentants manglende evne eller vilje til at give skriftligt informeret samtykke.
  • Deltagere, der ikke er i stand til at læse, skrive eller tale flydende på engelsk, vil blive udelukket fra de forudbestemte mål 3 og 4.

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Observationsmodeller: Kohorte
  • Tidsperspektiver: Fremadrettet

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
Deltagere

St. Jude-patienter med en diagnosticeret solid eller flydende tumor (godartet eller ondartet) og deres biologiske forældre eller juridisk autoriseret repræsentant.

Interventioner: Studieintroduktionsbesøg, informeret samtykkebesøg, informeret samtykkeopfølgningsbesøg, returnering af resultater samtale, to returnering af resultater opfølgningsbesøg, vævsprøve (hvis tilgængelig), blodprøve eller hudbiopsi.
Andet: Studieintroduktionsbesøg
Inden for 5±3 uger efter ankomsten til SJCRH, eller når det passer deltageren/familiens bekvemmelighed, vil deltagerne mødes med en genetisk rådgiver og kliniker, give oplysninger til en familieafstamning, gennemgå en fysisk og diskutere muligheder for kimlinjetest. Studieintroduktionsmateriale vil blive leveret. Familier, der er interesserede i G4K-undersøgelsen, vil blive henvist til undersøgelsens sygeplejerske eller et andet G4K-medlem, og der vil blive planlagt et besøg med informeret samtykke.
Andet: Informeret samtykke besøg
Inden for 1±3 uger efter studieintroduktionsbesøget, eller når det er muligt for deltageren/familien, vil forskningssygeplejersken eller et andet studieteammedlem give samtykke til familien og indsamle demografiske og medicinske oplysninger. Deltagerne vil udfylde vurderingsspørgeskemaer.
Andre navne:
  • Spørgeskemaer
  • Demografiske og medicinske former
Andet: Samtale med returnering af resultater
Deltagerne vil udfylde vurderingsspørgeskemaerne.
Andre navne:
  • Spørgeskemaer
  • Interviews
Procedure: Blodprøve
For patienter, der ikke tidligere har givet en blodprøve, vil en blodprøve blive udtaget som en kilde til kimlinje-DNA.
Andre navne:
  • Flebotomi
Procedure: Hudbiopsi
Efter samtykke, for deltagere med en diagnose, hvor perifert blod sandsynligvis er kontamineret af tumorceller, kan hudbiopsier udføres som en kilde til kimlinje-DNA.
Andre navne:
  • Biopsi
Andet: Opfølgningsbesøg med informeret samtykke
Ved eller efter tilmelding, men før udgivelsen af ​​gerline-resultaterne, eller når det passer deltageren/familiens bekvemmelighed, vil en undergruppe af deltagere (30-40) deltage i semistrukturerede interviews.
Andre navne:
  • Interviews
Andet: Returnering af resultater Opfølgningsbesøg
Returnering af resultater Opfølgningsbesøg vil blive gennemført to gange: den første inden for 8±4 uger efter returnering af resultater-samtalen, eller efter deltagerens/familiens bekvemmelighed, og den anden inden for 28 ± 4 uger efter returnering af resultater-samtalen eller kl. deltagerens/familiens bekvemmelighed. Ved hvert besøg udfylder deltagerne vurderingsspørgeskemaer. Der vil blive gennemført semistrukturerede interviews med forældre og unge.
Andre navne:
  • Spørgeskemaer
  • Interviews

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Samlet succesrate
Tidsramme: Cirka 3 måneder efter studieoptagelse

Succes er defineret af den kombinerede succes af (1) kvalitetsfortolkelige genomiske data genereres fra sekventering af tumor- og kimlinjevæv og (2) formidling af genomiske testresultater til den primære SJCRH-onkolog og patienten og hans/hendes forældre.

Den binomiale andel af vellykket præstation vil blive estimeret ved stikprøveandelen og 99 % konfidensintervallet baseret på den normale tilnærmelse. Prøvestørrelsen er 400.
Cirka 3 måneder efter studieoptagelse
Antal og type af somatiske genetiske varianter og kimlinjegenetiske varianter
Tidsramme: Ca. 3-4 måneder efter at kimlinjeprøven er taget
WGS-, WES- og RNA-sekvensdata vil blive brugt til at identificere og karakterisere somatiske genetiske varianter af patologisk betydning og genetiske varianter af kønsceller forbundet med øget cancerrisiko. Beskrivende statistikker, såsom antal og andele af varianter forbundet med øget kræftrisiko, vil blive beregnet inden for hver patient og i hver sygdomstype.
Ca. 3-4 måneder efter at kimlinjeprøven er taget

Andre resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Andel af forældre/deltagere efter opfattelse af genomisk testning
Tidsramme: Ved studieafslutning (op til 13 måneder efter sidste deltagertilmelding)
Forældre/deltageres opfattelse af genomiske undersøgelser og forskning vil blive vurderet ved hjælp af lydoptagede samtaler og undersøgelser. Resultater vil blive opsummeret af beskrivende statistik.
Ved studieafslutning (op til 13 måneder efter sidste deltagertilmelding)
Antal deltagere/forældre efter forståelsesniveau
Tidsramme: Ved studieafslutning (op til 13 måneder efter sidste deltagertilmelding)
Forskningsdeltagers/forældres forståelse af genomiske resultater og resultaternes indvirkning på forskningsdeltagere og deres familier vil blive vurderet ved analyse af lydoptagede samtaler og undersøgelsesresultater. Resultater vil blive opsummeret af beskrivende statistik
Ved studieafslutning (op til 13 måneder efter sidste deltagertilmelding)
Andel af vellykkede sekvenser af formalinfikserede, paraffinindlejrede (FFPE) prøver
Tidsramme: Cirka 3 måneder efter tilmelding
For at vurdere gennemførligheden vil andele af FFPE-prøver, der kan sekventeres med succes, blive estimeret sammen med et 95 % konfidensinterval.
Cirka 3 måneder efter tilmelding

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

St. Jude Children's Research Hospital

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Kim E. Nichols, MD, St. Jude Children's Research Hospital

Publikationer og nyttige links

Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.

Generelle publikationer

Hjælpsomme links

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

28. august 2015

Primær færdiggørelse (Anslået)

31. december 2033

Studieafslutning (Anslået)

31. december 2038

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

19. august 2015

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

19. august 2015

Først opslået (Anslået)

21. august 2015

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

29. april 2026

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

23. april 2026

Sidst verificeret

1. april 2026

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Nøgleord

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • G4K

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Faste, flydende tumorer i centralnervesystemet

Kliniske forsøg med Studieintroduktionsbesøg

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Switzerland

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

Abonner