Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Проспективное секвенирование нормальных тканей нового поколения у пациентов с детской онкологией

21 июля 2026 г. обновлено: St. Jude Children's Research Hospital

Геномы для детей (G4K)

Развитие методов секвенирования следующего поколения (NGS), включая полногеномное (WGS), экзомное (WES) и РНК-секвенирование, произвело революцию в способности исследователей исследовать молекулярные механизмы, лежащие в основе образования опухоли. В рамках Проекта генома детского рака (PCGP) исследователи из Детской исследовательской больницы Св. Иуды (SJCRH) успешно использовали подходы NGS для оценки более 1000 детских онкологических заболеваний, начиная от гематологических злокачественных новообразований и заканчивая солидными опухолями центральной нервной системы (ЦНС) и вне ЦНС. . Из этих и родственных исследований стало ясно, что геномные подходы могут точно классифицировать опухоли по отдельным патологическим и прогностическим подтипам и обнаруживать изменения в клеточных путях, которые могут служить новыми терапевтическими мишенями. В совокупности эти исследования показывают, что, характеризуя геномный состав отдельных опухолей, исследователи смогут разработать персонализированные и потенциально более эффективные методы лечения рака и / или профилактические меры.

Этот протокол был первоначально принят, чтобы внедрить подходы NGS в рутинную клиническую помощь. На начальном этапе протокола G4K было набрано и включено в исследование 310 участников. Секвенирование опухоли и/или зародышевой линии было выполнено у всех 310 пациентов, при этом было создано 253 соматических отчета (представляющих 96% из 263 участников, у которых была доступна и проанализирована опухолевая ткань) и 301 отчет зародышевой линии (100% из 301 участника, которые согласились на исследование). получение результатов зародышевой линии). Анализ данных исследования продолжается, и в ближайшие несколько месяцев планируется подготовить первоначальные рукописи. Благодаря успешному первоначальному выполнению протокола G4K, клиническое геномное секвенирование образцов опухоли и зародышевой линии теперь предлагается как часть стандартной клинической помощи пациентам с детской онкологией в больнице Св. Иуды.

Протокол G4K теперь был пересмотрен. После пересмотра исследовательская группа будет записывать, хранить и анализировать информацию о зародышевой линии и геноме опухоли. Собрав эти данные, мы изучим, как зародышевые мутации в 150 генах предрасположенности к раку влияют на клиническую картину, гистологию опухоли, геномные данные опухоли, ответ на терапию и долгосрочные результаты. Общие цели этого исследования заключаются в дальнейшем определении распространенности, спектра и наследуемости вариантов зародышевой линии в этих генах, а также в расшифровке того, как мутации зародышевой линии влияют на фенотипы расширяющегося набора синдромов предрасположенности к раку. Эти исследования позволяют нам предоставлять более точные генетические консультации и стратегии ведения будущих детей с мутациями в этих генах.

Это остается нетерапевтическим исследованием. Исследователи ожидают, что размер выборки составит около 5000 пациентов, которые будут набраны в течение следующих 7 лет.

Обзор исследования

Статус

Рекрутинг

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

ОСНОВНЫЕ ЦЕЛИ:

  • Использовать клиническое геномное секвенирование для определения распространенности и спектра зародышевых мутаций в генах предрасположенности к раку у детей с онкологическими заболеваниями.
  • Для тех, у кого выявлены мутации зародышевой линии, чтобы сопоставить геномную информацию зародышевой линии с клинической картиной, геномными данными опухоли, ответом на лечение и исходом.

ДРУГИЕ ПРЕДВАРИТЕЛЬНЫЕ ЗАДАЧИ:

  • Для создания и анализа данных, описывающих восприятие пациентом/родителем геномных исследований и исследований в различные моменты времени на протяжении всего исследования.
  • Для создания и анализа данных, связанных с возвращением результатов геномного секвенирования, изучения понимания этих результатов пациентами/родителями и оценки влияния результатов на пациентов и их семьи.
  • Определить возможность и надежность проведения секвенирования WES и РНК на производных образцов опухолей, фиксированных формалином и залитых парафином (FFPE), наряду с анализом соответствующих замороженных образцов опухоли и образцов зародышевой линии.

Для участников, давших согласие, будет получен образец нормальной ткани, который будет использован для анализа последовательности WGS, WES и РНК. Определенный список из 150 генов будет проанализирован для составления отчета с использованием нормальной ткани. Как только результаты этих анализов будут доступны, они будут доведены до сведения врачей, пациентов и родителей. Подходы смешанных измерений будут использоваться для оценки понимания, принятия и влияния результатов геномной диагностики на пациентов и родителей. В ходе исследования исследователи ожидают, что список генов, о которых будет сообщено при использовании нормальной ткани, изменится из-за достижений в литературе или других доказательств, связывающих дополнительные гены с образованием опухолей и риском рака, и могут быть определены новые списки.

Для оценки понимания медицинских работников, пациентов и членов их семей и описания воздействия геномного тестирования и получения результатов это исследование также будет включать проведение опросов и полуструктурированных интервью. Опросы и интервью не являются обязательными, но они будут предложены всем основным поставщикам SJCRH, а также всем правомочным участникам и родителям, независимо от того, согласны ли они на проведение геномного тестирования.

Образец крови или биопсия кожи будут получены в качестве источника ДНК зародышевой линии. Этот образец необходим, так как он является компаратором, по которому оцениваются образцы опухоли. Биопсия кожи может быть выполнена у пациентов с диагнозом, при котором периферическая кровь может быть контаминирована опухолевыми клетками.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Оцененный)

2500

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Контакты исследования

  • Имя: Kim E. Nichols, MD
  • Номер телефона: 888-226-4343
  • Электронная почта: referralinfo@stjude.org

Места учебы

  • Соединенные Штаты
    • Tennessee
      • Memphis, Tennessee, Соединенные Штаты, 38105
        • Рекрутинг
        • St. Jude Children's Research Hospital
        • Главный следователь:
          • Kim E. Nichols, MD
        • Контакт:
          • Kim E. Nichols, MD
          • Номер телефона: 888-226-4343
          • Электронная почта: referralinfo@stjude.org

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

  • Ребенок
  • Взрослый
  • Пожилой взрослый

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Участниками будут пациенты Детской исследовательской больницы Св. Иуды (SJCRH) с диагнозами гематологических, солидных опухолей или опухолей центральной нервной системы, которые согласны участвовать в этом исследовании, а также их родители или законные представители, которые дают согласие на участие.

Описание

Критерии включения:

  • Пациенты St. Jude проспективно идентифицированы на момент активации исследования с диагностированной солидной или жидкостной опухолью (доброкачественной или злокачественной).
  • Должна быть доступна адекватная ткань (например, достаточное количество зародышевой линии и/или опухолевой ткани, из которых должно быть выделено >1 мкг ДНК и >0,1 мкг РНК). Пациенты, у которых нет доступной опухолевой ткани, могут зарегистрироваться, используя только образец зародышевой линии.

Критерий исключения:

  • Трансплантация гемопоэтических стволовых клеток в анамнезе (или другое состояние, которое может привести к тому, что ДНК гемопоэтических клеток не будет соответствовать ДНК ткани хозяина).
  • Опухоль или зародышевая ткань, не соответствующие перечисленным выше критериям.
  • Неспособность или нежелание участника исследования или законного опекуна/представителя дать письменное информированное согласие.
  • Участники, которые не могут свободно читать, писать или разговаривать на английском языке, будут исключены из предварительно определенных целей 3 и 4.

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

  • Наблюдательные модели: Когорта
  • Временные перспективы: Перспективный

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
Участники

Пациенты St. Jude с диагностированной солидной или жидкой опухолью (доброкачественной или злокачественной) и их биологические родители или законные представители.

Вмешательства: посещение для ознакомления с исследованием, посещение с информированным согласием, последующее посещение с информированным согласием, беседа о возвращении результатов, два повторных визита с подтверждением результатов, образец ткани (при наличии), образец крови или биопсия кожи.
Другой: Введение в исследование Визит
В течение 5-3 недель после прибытия в SJCRH или по желанию участника/семьи участники встретятся с консультантом по генетическим вопросам и клиницистом, предоставят информацию о семейной родословной, пройдут медосмотр и обсудят варианты тестирования зародышевой линии. Вводные учебные материалы будут предоставлены. Семьи, заинтересованные в исследовании G4K, будут направлены к медсестре-исследователю или другому члену G4K, и будет назначен визит для получения информированного согласия.
Другой: Визит с информированным согласием
В течение 1-3 недель после визита для ознакомления с исследованием или по усмотрению участника/семьи медсестра-исследователь или другой член исследовательской группы дает согласие семье и собирает демографическую и медицинскую информацию. Участники заполняют оценочные анкеты.
Другие имена:
  • Анкеты
  • Демографические и медицинские формы
Другой: Возврат результатов беседы
Участники заполняют оценочные анкеты.
Другие имена:
  • Анкеты
  • Интервью
Процедура: Образец крови
У пациентов, которые ранее не сдавали образец крови, будет получен образец крови в качестве источника зародышевой ДНК.
Другие имена:
  • Флеботомия
Процедура: Биопсия кожи
После согласия участникам с диагнозом, при котором периферическая кровь может быть загрязнена опухолевыми клетками, может быть сделана биопсия кожи в качестве источника ДНК зародышевой линии.
Другие имена:
  • Биопсия
Другой: Последующий визит для получения информированного согласия
Во время или после регистрации, но до публикации результатов зародышевого исследования, или по усмотрению участника/семьи, подгруппа участников (30–40 человек) примет участие в полуструктурированных интервью.
Другие имена:
  • Интервью
Другой: Возврат результатов. Последующие визиты.
Последующие визиты будут проводиться дважды: первый в течение 8 ± 4 недель после беседы о возврате результатов или по усмотрению участника/семьи, а второй в течение 28 ± 4 недель после беседы о возврате результатов или в удобство участника/семьи. При каждом посещении участники заполняют оценочные анкеты. Будут проведены полуструктурированные интервью с родителями и подростками.
Другие имена:
  • Анкеты
  • Интервью

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Общий показатель успеха
Временное ограничение: Примерно через 3 месяца после зачисления в исследование

Успех определяется комбинированными успехами (1) качественных интерпретируемых геномных данных, полученных в результате секвенирования опухолевых и зародышевых тканей, и (2) сообщения результатов геномного теста основному онкологу SJCRH, пациенту и его/ее родителям.

Биномиальная пропорция успешной работы будет оцениваться по пропорции выборки и 99% доверительному интервалу на основе нормального приближения. Размер выборки 400.
Примерно через 3 месяца после зачисления в исследование
Количество и тип соматических генетических вариантов и генетических вариантов зародышевой линии
Временное ограничение: Приблизительно через 3-4 месяца после получения образца зародышевой линии
Данные WGS, WES и последовательности РНК будут использоваться для идентификации и характеристики соматических генетических вариантов, имеющих патологическое значение, и генетических вариантов зародышевой линии, связанных с повышенным риском рака. Описательные статистические данные, такие как количество и доля вариантов, связанных с повышенным риском развития рака, будут рассчитываться для каждого пациента и для каждого типа заболевания.
Приблизительно через 3-4 месяца после получения образца зародышевой линии

Другие показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Доля родителей/участников по восприятию геномного тестирования
Временное ограничение: В конце исследования (до 13 месяцев после регистрации последнего участника)
Восприятие родителями/участниками геномных исследований и исследований будет оцениваться с использованием аудиозаписей разговоров и опросов. Результаты будут обобщены описательной статистикой.
В конце исследования (до 13 месяцев после регистрации последнего участника)
Количество участников/родителей по уровню понимания
Временное ограничение: В конце исследования (до 13 месяцев после регистрации последнего участника)
Понимание участником исследования/родителем геномных результатов и влияние результатов на участников исследования и их семьи будет оцениваться путем анализа аудиозаписей разговоров и результатов опроса. Результаты будут обобщены описательной статистикой.
В конце исследования (до 13 месяцев после регистрации последнего участника)
Доля успешных последовательностей образцов, фиксированных формалином и залитых парафином (FFPE)
Временное ограничение: Примерно через 3 месяца после регистрации
Для оценки целесообразности будут оцениваться пропорции образцов FFPE, которые могут быть успешно секвенированы, с доверительным интервалом 95%.
Примерно через 3 месяца после регистрации

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

St. Jude Children's Research Hospital

Следователи

  • Главный следователь: Kim E. Nichols, MD, St. Jude Children's Research Hospital

Публикации и полезные ссылки

Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.

Общие публикации

Полезные ссылки

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

28 августа 2015 г.

Первичное завершение (Оцененный)

31 декабря 2045 г.

Завершение исследования (Оцененный)

31 декабря 2053 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

19 августа 2015 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

19 августа 2015 г.

Первый опубликованный (Оцененный)

21 августа 2015 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

22 июля 2026 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

21 июля 2026 г.

Последняя проверка

1 июля 2026 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Ключевые слова

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • G4K

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться