HBV Virions bundna proteiner

Uppkomsten av hepatocellulärt karcinom (HCC) har föranlett ett sökande efter en grundlig förståelse av biologin hos ett av dess viktigaste orsaksämnen, hepatit B-viruset (HBV). HBV-partiklar förvärvar cellulära proteiner via spirande och inkapsling. Det finns växande bevis på flera virala arter att virionbundna proteiner är benägna att vara involverade antingen vid replikering, knoppning/utträde eller inträde/frisättning av viruscykeln.

Identifiering av sådana mål kan ge idealiska kandidater för att få insikt om beroendet av HBV på en begränsad delmängd av värdproteiner, vilket därför tillhandahåller raffinerade uppsättningar av genetiskt stabila mål för terapi. Detta projekts mål är att skapa adekvata förhållanden för robust och reproducerbar rening av HBV-virioner i kliniska prover, följt av identifiering av deras HBV-bundna värdproteiner och karakterisering av deras funktioner. Proteomikprofilering av HBV-partiklar som renats från kliniska prover kommer att överlagras med proteiner som identifierats och karakteriserats i cellkulturodlade HBV-partiklar, med hjälp av kriterier för klinisk biomarkör upptäcktsgrad. Mål som identifierats i båda provuppsättningarna kommer att utsättas för in vitro-undersökningar med HBV-replikerande celler. Konventionella biokemiska metoder och avbildningsmetoder kommer att användas för att: (i) fastställa deras fysiska association med HBV-virioner; (ii) definiera modaliteterna för deras interaktion med HBV-proteiner; (iii) dechiffrera topologin och subcellulär lokalisering av deras association med HBV-proteiner och virioner; (iv) kvantitativt bedöma deras funktionella inblandning i partikelknoppning, utträde eller utsöndring och smittsamhet. En kandidat som gav tillfredsställande resultat i dessa experiment kommer att avslöjas och undersökas vidare på strukturbiologins nivå, i samarbetande forskningsprogram.