Proteine ​​legate ai virioni dell'HBV

L'emergere del carcinoma epatocellulare (HCC) ha spinto a cercare una comprensione approfondita della biologia di uno dei suoi principali agenti causali, il virus dell'epatite B (HBV). Le particelle di HBV acquisiscono tramite proteine ​​​​cellulari in erba e incapsidazione. Esistono prove crescenti su diverse specie virali che le proteine ​​​​legate al virione tendono a essere coinvolte nelle fasi di replicazione, germogliamento/uscita o ingresso/rilascio del ciclo virale.

L'identificazione di tali bersagli può produrre candidati ideali per ottenere informazioni sulla dipendenza dell'HBV da un sottoinsieme ristretto di proteine ​​dell'ospite, fornendo quindi insiemi raffinati di bersagli geneticamente stabili per la terapia. Gli obiettivi di questo progetto sono di creare condizioni adeguate per una purificazione robusta e riproducibile dei virioni HBV in campioni clinici, seguita dall'identificazione delle loro proteine ​​ospiti legate all'HBV e dalla caratterizzazione delle loro funzioni. La profilazione proteomica delle particelle di HBV purificate da campioni clinici sarà sovrapposta alle proteine ​​identificate e caratterizzate in particelle di HBV cresciute in coltura cellulare, utilizzando i criteri del grado di scoperta dei biomarcatori clinici. I bersagli identificati in entrambi i set di campioni saranno sottoposti a indagini in vitro utilizzando cellule replicanti l'HBV. Verranno utilizzati metodi convenzionali biochimici e di imaging per: (i) accertare la loro associazione fisica con i virioni HBV; (ii) definire le modalità della loro interazione con le proteine ​​dell'HBV; (iii) decifrare la topologia e la localizzazione subcellulare della loro associazione con proteine ​​e virioni dell'HBV; (iv) valutare quantitativamente il loro coinvolgimento funzionale nella gemmazione, uscita o secrezione di particelle e nell'infettività. Un candidato che ha prodotto risultati soddisfacenti in questi esperimenti sarà divulgato e ulteriormente studiato a livello di biologia strutturale, in programmi di ricerca collaborativa.