HBV virionokhoz kötött fehérjék

A hepatocelluláris karcinóma (HCC) megjelenése arra késztette a kutatást, hogy alaposan megértsük egyik fő kórokozója, a hepatitis B vírus (HBV) biológiáját. A HBV-részecskék bimbózó és beágyazó sejtfehérjék révén jutnak hozzá. Egyre több vírusfajról van bizonyíték arra vonatkozóan, hogy a virionhoz kötött fehérjék hajlamosak részt venni a vírusciklus replikációjában, bimbózásában/kilépésében vagy belépési/kibocsátási lépéseiben.

Az ilyen célpontok azonosítása ideális jelölteket eredményezhet a HBV-nek a gazdafehérjék egy korlátozott részhalmazától való függőségének megismeréséhez, így finomított genetikailag stabil célcsoportokat biztosít a terápia számára. A projekt célja a klinikai mintákban található HBV virionok robusztus és reprodukálható tisztításának megfelelő feltételek megteremtése, majd a HBV-hez kötött gazdafehérjék azonosítása és funkcióik jellemzése. A klinikai mintákból tisztított HBV-részecskék proteomikai profilozását a sejttenyészetben növesztett HBV-részecskékben azonosított és jellemzett fehérjékkel fedik le, klinikai biomarker-felfedezési fokozatú kritériumok alkalmazásával. A mindkét mintakészletben azonosított célpontokat in vitro vizsgálatoknak vetik alá HBV-replikáló sejtek felhasználásával. Hagyományos biokémiai és képalkotó módszereket kell alkalmazni annak érdekében, hogy: (i) megállapítsák a HBV virionokkal való fizikai kapcsolatukat; (ii) meghatározzák a HBV-fehérjékkel való kölcsönhatásuk módozatait; (iii) megfejteni a HBV fehérjékkel és virionokkal való kapcsolatuk topológiáját és szubcelluláris lokalizációját; iv. mennyiségileg értékeli funkcionális részvételüket a részecskék bimbózásában, kilépésében vagy szekréciójában és fertőzőképességében. Az ezekben a kísérletekben kielégítő eredményeket elérő jelöltet nyilvánosságra hozzák, és tovább vizsgálják a szerkezetbiológia szintjén, együttműködési kutatási programok keretében.